| LAMC1 |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 1KLO, 1NPE, 1TLE, 4AQT | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | LAMC1, LAMB2, Laminin, gamma 1, laminin subunit gamma 1 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 150290 MGI: 99914 HomoloGene: 1724 GeneCards: LAMC1 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| колоректальний рак[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent
• extracellular matrix constituent conferring elasticity
|
|---|
| Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця
• extracellular region
• базальна мембрана
• laminin-1 complex
• екзосома
• laminin-10 complex
• laminin-11 complex
• міжклітинний простір
• endoplasmic reticulum lumen
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • hemidesmosome assembly
• substrate adhesion-dependent cell spreading
• endoderm development
• адгезія клітин
• extracellular matrix organization
• cell migration
• positive regulation of epithelial cell proliferation
• extracellular matrix disassembly
• посттрансляційна модифікація
• GO:0034622 protein-containing complex assembly
• animal organ morphogenesis
• гістогенез
• organism system development
• basement membrane assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 1: 183.02 – 183.15 Mb | Хр. 1: 153.09 – 153.21 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMC1 (англ. Laminin subunit gamma 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 609 амінокислот, а молекулярна маса — 177 603[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MRGSHRAAPA | | LRPRGRLWPV | | LAVLAAAAAA | | GCAQAAMDEC | | TDEGGRPQRC |
| MPEFVNAAFN | | VTVVATNTCG | | TPPEEYCVQT | | GVTGVTKSCH | | LCDAGQPHLQ |
| HGAAFLTDYN | | NQADTTWWQS | | QTMLAGVQYP | | SSINLTLHLG | | KAFDITYVRL |
| KFHTSRPESF | | AIYKRTREDG | | PWIPYQYYSG | | SCENTYSKAN | | RGFIRTGGDE |
| QQALCTDEFS | | DISPLTGGNV | | AFSTLEGRPS | | AYNFDNSPVL | | QEWVTATDIR |
| VTLNRLNTFG | | DEVFNDPKVL | | KSYYYAISDF | | AVGGRCKCNG | | HASECMKNEF |
| DKLVCNCKHN | | TYGVDCEKCL | | PFFNDRPWRR | | ATAESASECL | | PCDCNGRSQE |
| CYFDPELYRS | | TGHGGHCTNC | | QDNTDGAHCE | | RCRENFFRLG | | NNEACSSCHC |
| SPVGSLSTQC | | DSYGRCSCKP | | GVMGDKCDRC | | QPGFHSLTEA | | GCRPCSCDPS |
| GSIDECNIET | | GRCVCKDNVE | | GFNCERCKPG | | FFNLESSNPR | | GCTPCFCFGH |
| SSVCTNAVGY | | SVYSISSTFQ | | IDEDGWRAEQ | | RDGSEASLEW | | SSERQDIAVI |
| SDSYFPRYFI | | APAKFLGKQV | | LSYGQNLSFS | | FRVDRRDTRL | | SAEDLVLEGA |
| GLRVSVPLIA | | QGNSYPSETT | | VKYVFRLHEA | | TDYPWRPALT | | PFEFQKLLNN |
| LTSIKIRGTY | | SERSAGYLDD | | VTLASARPGP | | GVPATWVESC | | TCPVGYGGQF |
| CEMCLSGYRR | | ETPNLGPYSP | | CVLCACNGHS | | ETCDPETGVC | | NCRDNTAGPH |
| CEKCSDGYYG | | DSTAGTSSDC | | QPCPCPGGSS | | CAVVPKTKEV | | VCTNCPTGTT |
| GKRCELCDDG | | YFGDPLGRNG | | PVRLCRLCQC | | SDNIDPNAVG | | NCNRLTGECL |
| KCIYNTAGFY | | CDRCKDGFFG | | NPLAPNPADK | | CKACNCNLYG | | TMKQQSSCNP |
| VTGQCECLPH | | VTGQDCGACD | | PGFYNLQSGQ | | GCERCDCHAL | | GSTNGQCDIR |
| TGQCECQPGI | | TGQHCERCEV | | NHFGFGPEGC | | KPCDCHPEGS | | LSLQCKDDGR |
| CECREGFVGN | | RCDQCEENYF | | YNRSWPGCQE | | CPACYRLVKD | | KVADHRVKLQ |
| ELESLIANLG | | TGDEMVTDQA | | FEDRLKEAER | | EVMDLLREAQ | | DVKDVDQNLM |
| DRLQRVNNTL | | SSQISRLQNI | | RNTIEETGNL | | AEQARAHVEN | | TERLIEIASR |
| ELEKAKVAAA | | NVSVTQPEST | | GDPNNMTLLA | | EEARKLAERH | | KQEADDIVRV |
| AKTANDTSTE | | AYNLLLRTLA | | GENQTAFEIE | | ELNRKYEQAK | | NISQDLEKQA |
| ARVHEEAKRA | | GDKAVEIYAS | | VAQLSPLDSE | | TLENEANNIK | | MEAENLEQLI |
| DQKLKDYEDL | | REDMRGKELE | | VKNLLEKGKT | | EQQTADQLLA | | RADAAKALAE |
| EAAKKGRDTL | | QEANDILNNL | | KDFDRRVNDN | | KTAAEEALRK | | IPAINQTITE |
| ANEKTREAQQ | | ALGSAAADAT | | EAKNKAHEAE | | RIASAVQKNA | | TSTKAEAERT |
| FAEVTDLDNE | | VNNMLKQLQE | | AEKELKRKQD | | DADQDMMMAG | | MASQAAQEAE |
| INARKAKNSV | | TSLLSIINDL | | LEQLGQLDTV | | DLNKLNEIEG | | TLNKAKDEMK |
| VSDLDRKVSD | | LENEAKKQEA | | AIMDYNRDIE | | EIMKDIRNLE | | DIRKTLPSGC |
| FNTPSIEKP |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Santos C.L.S., Sabbaga J., Brentani R. (1991). Differences in human laminin B2 sequences. DNA Seq. 1: 275—277. PMID 1806043 DOI:10.3109/10425179109020782
- Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827
- Pikkarainen T., Kallunki T., Tryggvason K. (1988). Human laminin B2 chain. Comparison of the complete amino acid sequence with the B1 chain reveals variability in sequence homology between different structural domains. J. Biol. Chem. 263: 6751—6758. PMID 3360804
- Kallunki T., Ikonen J., Chow L.T., Kallunki P., Tryggvason K. (1991). Structure of the human laminin B2 chain gene reveals extensive divergence from the laminin B1 chain gene. J. Biol. Chem. 266: 221—228. PMID 1985895
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6492 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P11047 (англ.) . Архів оригіналу за 22 січня 2018. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
