LAMB3

LAMB3
Ідентифікатори
Символи LAMB3, BM600-125KDA, LAM5, LAMNB1, AI1A, Laminin, beta 3, laminin subunit beta 3, JEB1B, JEB1A
Зовнішні ІД OMIM: 150310 MGI: 99915 HomoloGene: 191 GeneCards: LAMB3
Пов'язані генетичні захворювання
amelogenesis imperfecta type 1A, hypoplastic amelogenesis imperfecta, Mitis junctional epidermolysis bullosa, junctional epidermolysis bullosa Herlitz type[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
structural molecule activity
GO:0032403 protein-containing complex binding
extracellular matrix structural constituent

Клітинна компонента

extracellular region
базальна мембрана
laminin-5 complex
collagen-containing extracellular matrix
laminin complex

Біологічний процес

hemidesmosome assembly
адгезія клітин
extracellular matrix organization
endodermal cell differentiation
brown fat cell differentiation
epidermis development
animal organ morphogenesis
гістогенез
cell migration
substrate adhesion-dependent cell spreading
basement membrane assembly

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3914
16780
Ensembl
ENSG00000196878
ENSMUSG00000026639
UniProt
Q13751
Q61087
RefSeq (мРНК)
NM_000228
NM_001017402
NM_001127641
NM_001277928
NM_008484
RefSeq (білок)
NP_000219
NP_001017402
NP_001121113
NP_001264857
NP_032510
Локус (UCSC) Хр. 1: 209.61 – 209.65 Mb Хр. 1: 192.89 – 193.03 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LAMB3 (англ. Laminin subunit beta 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 172 амінокислот, а молекулярна маса — 129 572[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRPFFLLCFALPGLLHAQQACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCGLT
KPETYCTQYGEWQMKCCKCDSRQPHNYYSHRVENVASSSGPMRWWQSQND
VNPVSLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLA
ADCTSTFPRVRQGRPQSWQDVRCQSLPQRPNARLNGGKVQLNLMDLVSGI
PATQSQKIQEVGEITNLRVNFTRLAPVPQRGYHPPSAYYAVSQLRLQGSC
FCHGHADRCAPKPGASAGPSTAVQVHDVCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNR
PWRPAEGQDAHECQRCDCNGHSETCHFDPAVFAASQGAYGGVCDNCRDHT
EGKNCERCQLHYFRNRRPGASIQETCISCECDPDGAVPGAPCDPVTGQCV
CKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGSRRDMPCDEESGR
CLCLPNVVGPKCDQCAPYHWKLASGQGCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQC
PCREGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKAS
GRCLCRPGLTGPRCDQCQRGYCNRYPVCVACHPCFQTYDADLREQALRFG
RLRNATASLWSGPGLEDRGLASRILDAKSKIEQIRAVLSSPAVTEQEVAQ
VASAILSLRRTLQGLQLDLPLEEETLSLPRDLESLDRSFNGLLTMYQRKR
EQFEKISSADPSGAFRMLSTAYEQSAQAAQQVSDSSRLLDQLRDSRREAE
RLVRQAGGGGGTGSPKLVALRLEMSSLPDLTPTFNKLCGNSRQMACTPIS
CPGELCPQDNGTACGSRCRGVLPRAGGAFLMAGQVAEQLRGFNAQLQRTR
QMIRAAEESASQIQSSAQRLETQVSASRSQMEEDVRRTRLLIQQVRDFLT
DPDTDAATIQEVSEAVLALWLPTDSATVLQKMNEIQAIAARLPNVDLVLS
QTKQDIARARRLQAEAEEARSRAHAVEGQVEDVVGNLRQGTVALQEAQDT
MQGTSRSLRLIQDRVAEVQQVLRPAEKLVTSMTKQLGDFWTRMEELRHQA
RQQGAEAVQAQQLAEGASEQALSAQEGFERIKQKYAELKDRLGQSSMLGE
QGARIQSVKTEAEELFGETMEMMDRMKDMELELLRGSQAIMLRSADLTGL
EKRVEQIRDHINGRVLYYATCK

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Pulkkinen L., McGrath J.A., Christiano A.M., Uitto J. (1995). Detection of sequence variants in the gene encoding the beta 3 chain of laminin 5 (LAMB3). Hum. Mutat. 6: 77—84. PMID 7550237 DOI:10.1002/humu.1380060115
  • Mellerio J.E., Eady R.A.J., Atherton D.J., Lake B.D., McGrath J.A. (1998). E210K mutation in the gene encoding the beta3 chain of laminin-5 (LAMB3) is predictive of a phenotype of generalized atrophic benign epidermolysis bullosa. Br. J. Dermatol. 139: 325—331. PMID 9767254 DOI:10.1046/j.1365-2133.1998.02377.x
  • Pasmooij A.M.G., Pas H.H., Bolling M.C., Jonkman M.F. (2007). Revertant mosaicism in junctional epidermolysis bullosa due to multiple correcting second-site mutations in LAMB3. J. Clin. Invest. 117: 1240—1248. PMID 17476356 DOI:10.1172/JCI30465
  • Gerecke D.R., Wagman D.W., Champliaud M.-F., Burgeson R.E. (1994). The complete primary structure for a novel laminin chain, the laminin B1k chain. J. Biol. Chem. 269: 11073—11080. PMID 7512558

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з LAMB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit beta 3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6490 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  6. UniProt, Q13751 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші