COL5A3

COL5A3
Ідентифікатори
Символи COL5A3, collagen type V alpha 3 chain
Зовнішні ІД OMIM: 120216 MGI: 1858212 HomoloGene: 9253 GeneCards: COL5A3
Реагує на сполуку
ocriplasmin[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• heparin binding
• extracellular matrix structural constituent
• collagen binding
• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
• proteoglycan binding

Клітинна компонента

• collagen type V trimer
• extracellular region
• колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• міжклітинний простір
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• collagen catabolic process
• cell-matrix adhesion
• extracellular matrix organization
• skin development
• collagen fibril organization
• адгезія клітин

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
50509
53867
Ensembl
ENSG00000080573
ENSMUSG00000004098
UniProt
P25940
Q9JLI2
RefSeq (мРНК)
NM_015719
NM_016919
NM_001317388
RefSeq (білок)
NP_056534
NP_001304317
NP_058615
Локус (UCSC) Хр. 19: 9.96 – 10.01 Mb Хр. 9: 20.68 – 20.73 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL5A3 (англ. Collagen type V alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 745 амінокислот, а молекулярна маса — 172 121[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGNRRDLGQPRAGLCLLLAALQLLPGTQADPVDVLKALGVQGGQAGVPEG
PGFCPQRTPEGDRAFRIGQASTLGIPTWELFPEGHFPENFSLLITLRGQP
ANQSVLLSIYDERGARQLGLALGPALGLLGDPFRPLPQQVNLTDGRWHRV
AVSIDGEMVTLVADCEAQPPVLGHGPRFISIAGLTVLGTQDLGEKTFEGD
IQELLISPDPQAAFQACERYLPDCDNLAPAATVAPQGEPETPRPRRKGKG
KGRKKGRGRKGKGRKKNKEIWTSSPPPDSAENQTSTDIPKTETPAPNLPP
TPTPLVVTSTVTTGLNATILERSLDPDSGTELGTLETKAAREDEEGDDST
MGPDFRAAEYPSRTQFQIFPGAGEKGAKGEPAVIEKGQQFEGPPGAPGPQ
GVVGPSGPPGPPGFPGDPGPPGPAGLPGIPGIDGIRGPPGTVIMMPFQFA
GGSFKGPPVSFQQAQAQAVLQQTQLSMKGPPGPVGLTGRPGPVGLPGHPG
LKGEEGAEGPQGPRGLQGPHGPPGRVGKMGRPGADGARGLPGDTGPKGDR
GFDGLPGLPGEKGQRGDFGHVGQPGPPGEDGERGAEGPPGPTGQAGEPGP
RGLLGPRGSPGPTGRPGVTGIDGAPGAKGNVGPPGEPGPPGQQGNHGSQG
LPGPQGLIGTPGEKGPPGNPGIPGLPGSDGPLGHPGHEGPTGEKGAQGPP
GSAGPPGYPGPRGVKGTSGNRGLQGEKGEKGEDGFPGFKGDVGLKGDQGK
PGAPGPRGEDGPEGPKGQAGQAGEEGPPGSAGEKGKLGVPGLPGYPGRPG
PKGSIGFPGPLGPIGEKGKSGKTGQPGLEGERGPPGSRGERGQPGATGQP
GPKGDVGQDGAPGIPGEKGLPGLQGPPGFPGPKGPPGHQGKDGRPGHPGQ
RGELGFQGQTGPPGPAGVLGPQGKTGEVGPLGERGPPGPPGPPGEQGLPG
LEGREGAKGELGPPGPLGKEGPAGLRGFPGPKGGPGDPGPTGLKGDKGPP
GPVGANGSPGERGPLGPAGGIGLPGQSGSEGPVGPAGKKGSRGERGPPGP
TGKDGIPGPLGPLGPPGAAGPSGEEGDKGDVGAPGHKGSKGDKGDAGPPG
QPGIRGPAGHPGPPGADGAQGRRGPPGLFGQKGDDGVRGFVGVIGPPGLQ
GLPGPPGEKGEVGDVGSMGPHGAPGPRGPQGPTGSEGTPGLPGGVGQPGA
VGEKGERGDAGDPGPPGAPGIPGPKGDIGEKGDSGPSGAAGPPGKKGPPG
EDGAKGSVGPTGLPGDLGPPGDPGVSGIDGSPGEKGDPGDVGGPGPPGAS
GEPGAPGPPGKRGPSGHMGREGREGEKGAKGEPGPDGPPGRTGPMGARGP
PGRVGPEGLRGIPGPVGEPGLLGAPGQMGPPGPLGPSGLPGLKGDTGPKG
EKGHIGLIGLIGPPGEAGEKGDQGLPGVQGPPGPKGDPGPPGPIGSLGHP
GPPGVAGPLGQKGSKGSPGSMGPRGDTGPAGPPGPPGAPAELHGLRRRRR
FVPVPLPVVEGGLEEVLASLTSLSLELEQLRRPPGTAERPGLVCHELHRN
HPHLPDGEYWIDPNQGCARDSFRVFCNFTAGGETCLYPDKKFEIVKLASW
SKEKPGGWYSTFRRGKKFSYVDADGSPVNVVQLNFLKLLSATARQNFTYS
CQNAAAWLDEATGDYSHSARFLGTNGEELSFNQTTAATVSVPQDGCRLRK
GQTKTLFEFSSSRAGFLPLWDVAATDFGQTNQKFGFELGPVCFSS

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Imamura Y., Scott I.C., Greenspan D.S. (2000). The pro-alpha3 (V) collagen chain. Complete primary structure, expression domains in adult and developing tissues, and comparison to the structures and expression domains of the other types V and XI procollagen chains. J. Biol. Chem. 275: 8749—8759. PMID 10722718 DOI:10.1074/jbc.275.12.8749
  • Mann K. (1992). Isolation of the alpha 3-chain of human type V collagen and characterization by partial sequencing. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 373: 69—75. PMID 1571108

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL5A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14864 (англ.) . Архів оригіналу за 13 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, P25940 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.