COL5A3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL5A3, collagen type V alpha 3 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120216 MGI: 1858212 HomoloGene: 9253 GeneCards: COL5A3 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • heparin binding • extracellular matrix structural constituent • collagen binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength • proteoglycan binding |
---|
Клітинна компонента | • collagen type V trimer • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • collagen catabolic process • cell-matrix adhesion • extracellular matrix organization • skin development • collagen fibril organization • адгезія клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0d/PBB_GE_COL5A3_52255_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL5A3_52255_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/0d/PBB_GE_COL5A3_218975_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL5A3_218975_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 9.96 – 10.01 Mb | Хр. 9: 20.68 – 20.73 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL5A3 (англ. Collagen type V alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 745 амінокислот, а молекулярна маса — 172 121[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGNRRDLGQP | | RAGLCLLLAA | | LQLLPGTQAD | | PVDVLKALGV | | QGGQAGVPEG |
PGFCPQRTPE | | GDRAFRIGQA | | STLGIPTWEL | | FPEGHFPENF | | SLLITLRGQP |
ANQSVLLSIY | | DERGARQLGL | | ALGPALGLLG | | DPFRPLPQQV | | NLTDGRWHRV |
AVSIDGEMVT | | LVADCEAQPP | | VLGHGPRFIS | | IAGLTVLGTQ | | DLGEKTFEGD |
IQELLISPDP | | QAAFQACERY | | LPDCDNLAPA | | ATVAPQGEPE | | TPRPRRKGKG |
KGRKKGRGRK | | GKGRKKNKEI | | WTSSPPPDSA | | ENQTSTDIPK | | TETPAPNLPP |
TPTPLVVTST | | VTTGLNATIL | | ERSLDPDSGT | | ELGTLETKAA | | REDEEGDDST |
MGPDFRAAEY | | PSRTQFQIFP | | GAGEKGAKGE | | PAVIEKGQQF | | EGPPGAPGPQ |
GVVGPSGPPG | | PPGFPGDPGP | | PGPAGLPGIP | | GIDGIRGPPG | | TVIMMPFQFA |
GGSFKGPPVS | | FQQAQAQAVL | | QQTQLSMKGP | | PGPVGLTGRP | | GPVGLPGHPG |
LKGEEGAEGP | | QGPRGLQGPH | | GPPGRVGKMG | | RPGADGARGL | | PGDTGPKGDR |
GFDGLPGLPG | | EKGQRGDFGH | | VGQPGPPGED | | GERGAEGPPG | | PTGQAGEPGP |
RGLLGPRGSP | | GPTGRPGVTG | | IDGAPGAKGN | | VGPPGEPGPP | | GQQGNHGSQG |
LPGPQGLIGT | | PGEKGPPGNP | | GIPGLPGSDG | | PLGHPGHEGP | | TGEKGAQGPP |
GSAGPPGYPG | | PRGVKGTSGN | | RGLQGEKGEK | | GEDGFPGFKG | | DVGLKGDQGK |
PGAPGPRGED | | GPEGPKGQAG | | QAGEEGPPGS | | AGEKGKLGVP | | GLPGYPGRPG |
PKGSIGFPGP | | LGPIGEKGKS | | GKTGQPGLEG | | ERGPPGSRGE | | RGQPGATGQP |
GPKGDVGQDG | | APGIPGEKGL | | PGLQGPPGFP | | GPKGPPGHQG | | KDGRPGHPGQ |
RGELGFQGQT | | GPPGPAGVLG | | PQGKTGEVGP | | LGERGPPGPP | | GPPGEQGLPG |
LEGREGAKGE | | LGPPGPLGKE | | GPAGLRGFPG | | PKGGPGDPGP | | TGLKGDKGPP |
GPVGANGSPG | | ERGPLGPAGG | | IGLPGQSGSE | | GPVGPAGKKG | | SRGERGPPGP |
TGKDGIPGPL | | GPLGPPGAAG | | PSGEEGDKGD | | VGAPGHKGSK | | GDKGDAGPPG |
QPGIRGPAGH | | PGPPGADGAQ | | GRRGPPGLFG | | QKGDDGVRGF | | VGVIGPPGLQ |
GLPGPPGEKG | | EVGDVGSMGP | | HGAPGPRGPQ | | GPTGSEGTPG | | LPGGVGQPGA |
VGEKGERGDA | | GDPGPPGAPG | | IPGPKGDIGE | | KGDSGPSGAA | | GPPGKKGPPG |
EDGAKGSVGP | | TGLPGDLGPP | | GDPGVSGIDG | | SPGEKGDPGD | | VGGPGPPGAS |
GEPGAPGPPG | | KRGPSGHMGR | | EGREGEKGAK | | GEPGPDGPPG | | RTGPMGARGP |
PGRVGPEGLR | | GIPGPVGEPG | | LLGAPGQMGP | | PGPLGPSGLP | | GLKGDTGPKG |
EKGHIGLIGL | | IGPPGEAGEK | | GDQGLPGVQG | | PPGPKGDPGP | | PGPIGSLGHP |
GPPGVAGPLG | | QKGSKGSPGS | | MGPRGDTGPA | | GPPGPPGAPA | | ELHGLRRRRR |
FVPVPLPVVE | | GGLEEVLASL | | TSLSLELEQL | | RRPPGTAERP | | GLVCHELHRN |
HPHLPDGEYW | | IDPNQGCARD | | SFRVFCNFTA | | GGETCLYPDK | | KFEIVKLASW |
SKEKPGGWYS | | TFRRGKKFSY | | VDADGSPVNV | | VQLNFLKLLS | | ATARQNFTYS |
CQNAAAWLDE | | ATGDYSHSAR | | FLGTNGEELS | | FNQTTAATVS | | VPQDGCRLRK |
GQTKTLFEFS | | SSRAGFLPLW | | DVAATDFGQT | | NQKFGFELGP | | VCFSS |
Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Imamura Y., Scott I.C., Greenspan D.S. (2000). The pro-alpha3 (V) collagen chain. Complete primary structure, expression domains in adult and developing tissues, and comparison to the structures and expression domains of the other types V and XI procollagen chains. J. Biol. Chem. 275: 8749—8759. PMID 10722718 DOI:10.1074/jbc.275.12.8749
- Mann K. (1992). Isolation of the alpha 3-chain of human type V collagen and characterization by partial sequencing. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 373: 69—75. PMID 1571108
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL5A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14864 (англ.) . Архів оригіналу за 13 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P25940 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |