| COL23A1 |
|---|
|
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | COL23A1, collagen type XXIII alpha 1 chain |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 610043 MGI: 2653243 HomoloGene: 72101 GeneCards: COL23A1 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| нервова булімія, ожиріння[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• extracellular matrix structural constituent
• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• клітинна мембрана
• колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• мембрана
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • Ангіогенез
• endothelial cell morphogenesis
• extracellular matrix organization
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 5: 178.24 – 178.59 Mb | Хр. 11: 51.18 – 51.47 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL23A1 (англ. Collagen type XXIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 51 944[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MGPGERAGGG | | GDAGKGNAAG | | GGGGGRSATT | | AGSRAVSALC | | LLLSVGSAAA |
| CLLLGVQAAA | | LQGRVAALEE | | ERELLRRAGP | | PGALDAWAEP | | HLERLLREKL |
| DGLAKIRTAR | | EAPSECVCPP | | GPPGRRGKPG | | RRGDPGPPGQ | | SGRDGYPGPL |
| GLDGKPGLPG | | PKGEKGAPGD | | FGPRGDQGQD | | GAAGPPGPPG | | PPGARGPPGD |
| TGKDGPRGAQ | | GPAGPKGEPG | | QDGEMGPKGP | | PGPKGEPGVP | | GKKGDDGTPS |
| QPGPPGPKGE | | PGSMGPRGEN | | GVDGAPGPKG | | EPGHRGTDGA | | AGPRGAPGLK |
| GEQGDTVVID | | YDGRILDALK | | GPPGPQGPPG | | PPGIPGAKGE | | LGLPGAPGID |
| GEKGPKGQKG | | DPGEPGPAGL | | KGEAGEMGLS | | GLPGADGLKG | | EKGESASDSL |
| QESLAQLIVE | | PGPPGPPGPP | | GPMGLQGIQG | | PKGLDGAKGE | | KGASGERGPS |
| GLPGPVGPPG | | LIGLPGTKGE | | KGRPGEPGLD | | GFPGPRGEKG | | DRSERGEKGE |
| RGVPGRKGVK | | GQKGEPGPPG | | LDQPCPVGPD | | GLPVPGCWHK |
Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Banyard J., Bao L., Zetter B.R. (2003). Type XXIII collagen, a new transmembrane collagen identified in metastatic tumor cells. J. Biol. Chem. 278: 20989—20994. PMID 12644459 DOI:10.1074/jbc.M210616200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL23A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22990 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q86Y22 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
