COL8A2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL8A2, FECD, FECD1, PPCD, PPCD2, collagen type VIII alpha 2, collagen type VIII alpha 2 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120252 MGI: 88464 HomoloGene: 55879 GeneCards: COL8A2 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
Fuchs' endothelial dystrophy[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein-macromolecule adaptor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • базальна мембрана • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • collagen catabolic process • extracellular matrix organization • epithelial cell proliferation • адгезія клітин • camera-type eye morphogenesis • Ангіогенез • cell-cell adhesion |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/d/da/PBB_GE_COL8A2_52651_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL8A2_52651_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c4/PBB_GE_COL8A2_221900_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL8A2_221900_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 36.1 – 36.13 Mb | Хр. 4: 126.18 – 126.21 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL8A2 (англ. Collagen type VIII alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 67 244[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLGTLTPLSS | | LLLLLLVLVL | | GCGPRASSGG | | GAGGAAGYAP | | VKYIQPMQKG |
PVGPPFREGK | | GQYLEMPLPL | | LPMDLKGEPG | | PPGKPGPRGP | | PGPPGFPGKP |
GMGKPGLHGQ | | PGPAGPPGFS | | RMGKAGPPGL | | PGKVGPPGQP | | GLRGEPGIRG |
DQGLRGPPGP | | PGLPGPSGIT | | IPGKPGAQGV | | PGPPGFQGEP | | GPQGEPGPPG |
DRGLKGDNGV | | GQPGLPGAPG | | QGGAPGPPGL | | PGPAGLGKPG | | LDGLPGAPGD |
KGESGPPGVP | | GPRGEPGAVG | | PKGPPGVDGV | | GVPGAAGLPG | | PQGPSGAKGE |
PGTRGPPGLI | | GPTGYGMPGL | | PGPKGDRGPA | | GVPGLLGDRG | | EPGEDGEPGE |
QGPQGLGGPP | | GLPGSAGLPG | | RRGPPGPKGE | | AGPGGPPGVP | | GIRGDQGPSG |
LAGKPGVPGE | | RGLPGAHGPP | | GPTGPKGEPG | | FTGRPGGPGV | | AGALGQKGDL |
GLPGQPGLRG | | PSGIPGLQGP | | AGPIGPQGLP | | GLKGEPGLPG | | PPGEGRAGEP |
GTAGPTGPPG | | VPGSPGITGP | | PGPPGPPGPP | | GAPGAFDETG | | IAGLHLPNGG |
VEGAVLGKGG | | KPQFGLGELS | | AHATPAFTAV | | LTSPFPASGM | | PVKFDRTLYN |
GHSGYNPATG | | IFTCPVGGVY | | YFAYHVHVKG | | TNVWVALYKN | | NVPATYTYDE |
YKKGYLDQAS | | GGAVLQLRPN | | DQVWVQMPSD | | QANGLYSTEY | | IHSSFSGFLL |
CPT |
Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, ангіогенез, поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Kittelberger R., Neale T.J., Francky K.T., Greenhill N.S., Gibson G.J. (1992). Cleavage of type VIII collagen by human neutrophil elastase. Biochim. Biophys. Acta. 1139: 295—299. PMID 1515454 DOI:10.1016/0925-4439(92)90103-T
- Greenhill N.S., Ruger B.M., Hasan Q., Davis P.F. (2000). The alpha1(VIII) and alpha2(VIII) collagen chains form two distinct homotrimeric proteins in vivo. Matrix Biol. 19: 19—28. PMID 10686422 DOI:10.1016/S0945-053X(99)00053-0
- Stephan S., Sherratt M.J., Hodson N., Shuttleworth C.A., Kielty C.M. (2004). Expression and supramolecular assembly of recombinant alpha1(viii) and alpha2(viii) collagen homotrimers. J. Biol. Chem. 279: 21469—21477. PMID 14990571 DOI:10.1074/jbc.M305805200
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL8A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2216 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P25067 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |