| LAMA5 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | LAMA5, Laminin, alpha 5, laminin subunit alpha 5 |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 GeneCards: LAMA5 |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| колоректальний рак[1] |
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| ocriplasmin[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • structural molecule activity
• integrin binding
• signaling receptor binding
• extracellular matrix structural constituent
|
|---|
| Клітинна компонента | • GO:0005578 Позаклітинна матриця
• laminin-5 complex
• extracellular region
• базальна мембрана
• laminin-10 complex
• laminin-11 complex
• екзосома
• клітинне ядро
• міжклітинний простір
• synaptic cleft
• neuromuscular junction
• collagen-containing extracellular matrix
|
|---|
| Біологічний процес | • hair follicle development
• диференціація клітин
• regulation of embryonic development
• regulation of cell migration
• cell recognition
• embryo development
• lung development
• muscle organ development
• extracellular matrix organization
• morphogenesis of a polarized epithelium
• odontogenesis of dentin-containing tooth
• focal adhesion assembly
• branching involved in ureteric bud morphogenesis
• regulation of cell adhesion
• адгезія клітин
• regulation of cell population proliferation
• cytoskeleton organization
• Ангіогенез
• neural crest cell migration
• animal organ morphogenesis
• integrin-mediated signaling pathway
• endothelial cell differentiation
• substrate adhesion-dependent cell spreading
• morphogenesis of embryonic epithelium
• проліферація
• cell migration
• branching morphogenesis of an epithelial tube
• branching involved in salivary gland morphogenesis
• cilium assembly
• protein localization to plasma membrane
• cytokine-mediated signaling pathway
• гістогенез
• cell-cell adhesion
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 20: 62.31 – 62.37 Mb | Хр. 2: 179.82 – 179.87 Mb |
|---|
| PubMed search | [3] | [4] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
LAMA5 (англ. Laminin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 695 амінокислот, а молекулярна маса — 399 737[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAKRLCAGSA | | LCVRGPRGPA | | PLLLVGLALL | | GAARAREEAG | | GGFSLHPPYF |
| NLAEGARIAA | | SATCGEEAPA | | RGSPRPTEDL | | YCKLVGGPVA | | GGDPNQTIRG |
| QYCDICTAAN | | SNKAHPASNA | | IDGTERWWQS | | PPLSRGLEYN | | EVNVTLDLGQ |
| VFHVAYVLIK | | FANSPRPDLW | | VLERSMDFGR | | TYQPWQFFAS | | SKRDCLERFG |
| PQTLERITRD | | DAAICTTEYS | | RIVPLENGEI | | VVSLVNGRPG | | AMNFSYSPLL |
| REFTKATNVR | | LRFLRTNTLL | | GHLMGKALRD | | PTVTRRYYYS | | IKDISIGGRC |
| VCHGHADACD | | AKDPTDPFRL | | QCTCQHNTCG | | GTCDRCCPGF | | NQQPWKPATA |
| NSANECQSCN | | CYGHATDCYY | | DPEVDRRRAS | | QSLDGTYQGG | | GVCIDCQHHT |
| TGVNCERCLP | | GFYRSPNHPL | | DSPHVCRRCN | | CESDFTDGTC | | EDLTGRCYCR |
| PNFSGERCDV | | CAEGFTGFPS | | CYPTPSSSND | | TREQVLPAGQ | | IVNCDCSAAG |
| TQGNACRKDP | | RVGRCLCKPN | | FQGTHCELCA | | PGFYGPGCQP | | CQCSSPGVAD |
| DRCDPDTGQC | | RCRVGFEGAT | | CDRCAPGYFH | | FPLCQLCGCS | | PAGTLPEGCD |
| EAGRCLCQPE | | FAGPHCDRCR | | PGYHGFPNCQ | | ACTCDPRGAL | | DQLCGAGGLC |
| RCRPGYTGTA | | CQECSPGFHG | | FPSCVPCHCS | | AEGSLHAACD | | PRSGQCSCRP |
| RVTGLRCDTC | | VPGAYNFPYC | | EAGSCHPAGL | | APVDPALPEA | | QVPCMCRAHV |
| EGPSCDRCKP | | GFWGLSPSNP | | EGCTRCSCDL | | RGTLGGVAEC | | QPGTGQCFCK |
| PHVCGQACAS | | CKDGFFGLDQ | | ADYFGCRSCR | | CDIGGALGQS | | CEPRTGVCRC |
| RPNTQGPTCS | | EPARDHYLPD | | LHHLRLELEE | | AATPEGHAVR | | FGFNPLEFEN |
| FSWRGYAQMA | | PVQPRIVARL | | NLTSPDLFWL | | VFRYVNRGAM | | SVSGRVSVRE |
| EGRSATCANC | | TAQSQPVAFP | | PSTEPAFITV | | PQRGFGEPFV | | LNPGTWALRV |
| EAEGVLLDYV | | VLLPSAYYEA | | ALLQLRVTEA | | CTYRPSAQQS | | GDNCLLYTHL |
| PLDGFPSAAG | | LEALCRQDNS | | LPRPCPTEQL | | SPSHPPLITC | | TGSDVDVQLQ |
| VAVPQPGRYA | | LVVEYANEDA | | RQEVGVAVHT | | PQRAPQQGLL | | SLHPCLYSTL |
| CRGTARDTQD | | HLAVFHLDSE | | ASVRLTAEQA | | RFFLHGVTLV | | PIEEFSPEFV |
| EPRVSCISSH | | GAFGPNSAAC | | LPSRFPKPPQ | | PIILRDCQVI | | PLPPGLPLTH |
| AQDLTPAMSP | | AGPRPRPPTA | | VDPDAEPTLL | | REPQATVVFT | | THVPTLGRYA |
| FLLHGYQPAH | | PTFPVEVLIN | | AGRVWQGHAN | | ASFCPHGYGC | | RTLVVCEGQA |
| LLDVTHSELT | | VTVRVPKGRW | | LWLDYVLVVP | | ENVYSFGYLR | | EEPLDKSYDF |
| ISHCAAQGYH | | ISPSSSSLFC | | RNAAASLSLF | | YNNGARPCGC | | HEVGATGPTC |
| EPFGGQCPCH | | AHVIGRDCSR | | CATGYWGFPN | | CRPCDCGARL | | CDELTGQCIC |
| PPRTIPPDCL | | LCQPQTFGCH | | PLVGCEECNC | | SGPGIQELTD | | PTCDTDSGQC |
| KCRPNVTGRR | | CDTCSPGFHG | | YPRCRPCDCH | | EAGTAPGVCD | | PLTGQCYCKE |
| NVQGPKCDQC | | SLGTFSLDAA | | NPKGCTRCFC | | FGATERCRSS | | SYTRQEFVDM |
| EGWVLLSTDR | | QVVPHERQPG | | TEMLRADLRH | | VPEAVPEAFP | | ELYWQAPPSY |
| LGDRVSSYGG | | TLRYELHSET | | QRGDVFVPME | | SRPDVVLQGN | | QMSITFLEPA |
| YPTPGHVHRG | | QLQLVEGNFR | | HTETRNTVSR | | EELMMVLASL | | EQLQIRALFS |
| QISSAVFLRR | | VALEVASPAG | | QGALASNVEL | | CLCPASYRGD | | SCQECAPGFY |
| RDVKGLFLGR | | CVPCQCHGHS | | DRCLPGSGVC | | VDCQHNTEGA | | HCERCQAGFV |
| SSRDDPSAPC | | VSCPCPLSVP | | SNNFAEGCVL | | RGGRTQCLCK | | PGYAGASCER |
| CAPGFFGNPL | | VLGSSCQPCD | | CSGNGDPNLL | | FSDCDPLTGA | | CRGCLRHTTG |
| PRCEICAPGF | | YGNALLPGNC | | TRCDCTPCGT | | EACDPHSGHC | | LCKAGVTGRR |
| CDRCQEGHFG | | FDGCGGCRPC | | ACGPAAEGSE | | CHPQSGQCHC | | RPGTMGPQCR |
| ECAPGYWGLP | | EQGCRRCQCP | | GGRCDPHTGR | | CNCPPGLSGE | | RCDTCSQQHQ |
| VPVPGGPVGH | | SIHCEVCDHC | | VVLLLDDLER | | AGALLPAIHE | | QLRGINASSM |
| AWARLHRLNA | | SIADLQSQLR | | SPLGPRHETA | | QQLEVLEQQS | | TSLGQDARRL |
| GGQAVGTRDQ | | ASQLLAGTEA | | TLGHAKTLLA | | AIRAVDRTLS | | ELMSQTGHLG |
| LANASAPSGE | | QLLRTLAEVE | | RLLWEMRARD | | LGAPQAAAEA | | ELAAAQRLLA |
| RVQEQLSSLW | | EENQALATQT | | RDRLAQHEAG | | LMDLREALNR | | AVDATREAQE |
| LNSRNQERLE | | EALQRKQELS | | RDNATLQATL | | HAARDTLASV | | FRLLHSLDQA |
| KEELERLAAS | | LDGARTPLLQ | | RMQTFSPAGS | | KLRLVEAAEA | | HAQQLGQLAL |
| NLSSIILDVN | | QDRLTQRAIE | | ASNAYSRILQ | | AVQAAEDAAG | | QALQQADHTW |
| ATVVRQGLVD | | RAQQLLANST | | ALEEAMLQEQ | | QRLGLVWAAL | | QGARTQLRDV |
| RAKKDQLEAH | | IQAAQAMLAM | | DTDETSKKIA | | HAKAVAAEAQ | | DTATRVQSQL |
| QAMQENVERW | | QGQYEGLRGQ | | DLGQAVLDAG | | HSVSTLEKTL | | PQLLAKLSIL |
| ENRGVHNASL | | ALSASIGRVR | | ELIAQARGAA | | SKVKVPMKFN | | GRSGVQLRTP |
| RDLADLAAYT | | ALKFYLQGPE | | PEPGQGTEDR | | FVMYMGSRQA | | TGDYMGVSLR |
| DKKVHWVYQL | | GEAGPAVLSI | | DEDIGEQFAA | | VSLDRTLQFG | | HMSVTVERQM |
| IQETKGDTVA | | PGAEGLLNLR | | PDDFVFYVGG | | YPSTFTPPPL | | LRFPGYRGCI |
| EMDTLNEEVV | | SLYNFERTFQ | | LDTAVDRPCA | | RSKSTGDPWL | | TDGSYLDGTG |
| FARISFDSQI | | STTKRFEQEL | | RLVSYSGVLF | | FLKQQSQFLC | | LAVQEGSLVL |
| LYDFGAGLKK | | AVPLQPPPPL | | TSASKAIQVF | | LLGGSRKRVL | | VRVERATVYS |
| VEQDNDLELA | | DAYYLGGVPP | | DQLPPSLRRL | | FPTGGSVRGC | | VKGIKALGKY |
| VDLKRLNTTG | | VSAGCTADLL | | VGRAMTFHGH | | GFLRLALSNV | | APLTGNVYSG |
| FGFHSAQDSA | | LLYYRASPDG | | LCQVSLQQGR | | VSLQLLRTEV | | KTQAGFADGA |
| PHYVAFYSNA | | TGVWLYVDDQ | | LQQMKPHRGP | | PPELQPQPEG | | PPRLLLGGLP |
| ESGTIYNFSG | | CISNVFVQRL | | LGPQRVFDLQ | | QNLGSVNVST | | GCAPALQAQT |
| PGLGPRGLQA | | TARKASRRSR | | QPARHPACML | | PPHLRTTRDS | | YQFGGSLSSH |
| LEFVGILARH | | RNWPSLSMHV | | LPRSSRGLLL | | FTARLRPGSP | | SLALFLSNGH |
| FVAQMEGLGT | | RLRAQSRQRS | | RPGRWHKVSV | | RWEKNRILLV | | TDGARAWSQE |
| GPHRQHQGAE | | HPQPHTLFVG | | GLPASSHSSK | | LPVTVGFSGC | | VKRLRLHGRP |
| LGAPTRMAGV | | TPCILGPLEA | | GLFFPGSGGV | | ITLDLPGATL | | PDVGLELEVR |
| PLAVTGLIFH | | LGQARTPPYL | | QLQVTEKQVL | | LRADDGAGEF | | STSVTRPSVL |
| CDGQWHRLAV | | MKSGNVLRLE | | VDAQSNHTVG | | PLLAAAAGAP | | APLYLGGLPE |
| PMAVQPWPPA | | YCGCMRRLAV | | NRSPVAMTRS | | VEVHGAVGAS | | GCPAA |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6485 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15230 (англ.) . Архів оригіналу за 11 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
