COL22A1

COL22A1
Ідентифікатори
Символи COL22A1, collagen, type XXII, alpha 1, collagen type XXII alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 610026 MGI: 1916950 HomoloGene: 43567 GeneCards: COL22A1
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• extracellular matrix structural constituent

Клітинна компонента

• цитоплазма
• extracellular region
• колаген
• endoplasmic reticulum lumen
• міжклітинний простір
• GO:0005578 Позаклітинна матриця

Біологічний процес

• extracellular matrix organization

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
169044
69700
Ensembl
н/д
ENSMUSG00000079022
UniProt
Q8NFW1
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_152888
NM_027174
RefSeq (білок)
NP_690848
н/д
Локус (UCSC) н/д Хр. 15: 71.67 – 71.91 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL22A1 (англ. Collagen type XXII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 161 145[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAGLRGNAVAGLLWMLLLWSGGGGCQAQRAGCKSVHYDLVFLLDTSSSVG
KEDFEKVRQWVANLVDTFEVGPDRTRVGVVRYSDRPTTAFELGLFGSQEE
VKAAARRLAYHGGNTNTGDALRYITARSFSPHAGGRPRDRAYKQVAILLT
DGRSQDLVLDAAAAAHRAGIRIFAVGVGEALKEELEEIASEPKSAHVFHV
SDFNAIDKIRGKLRRRLCENVLCPSVRVEGDRFKHTNGGTKEITGFDLMD
LFSVKEILGKRENGAQSSYVRMGSFPVVQSTEDVFPQGLPDEYAFVTTFR
FRKTSRKEDWYIWQVIDQYSIPQVSIRLDGENKAVEYNAVGAMKDAVRVV
FRGSRVNDLFDRDWHKMALSIQAQNVSLHIDCALVQTLPIEERENIDIQG
KTVIGKRLYDSVPIDFDLQRIVIYCDSRHAELETCCDIPSGPCQVTVVTE
PPPPPPPQRPPTPGSEQIGFLKTINCSCPAGEKGEMGVAGPMGLPGPKGD
IGAIGPVGAPGPKGEKGDVGIGPFGQGEKGEKGSLGLPGPPGRDGSKGMR
GEPGELGEPGLPGEVGMRGPQGPPGLPGPPGRVGAPGLQGERGEKGTRGE
KGERGLDGFPGKPGDTGQQGRPGPSGVAGPQGEKGDVGPAGPPGVPGSVV
QQEGLKGEQGAPGPRGHQGAPGPPGARGPIGPEGRDGPPGLQGLRGKKGD
MGPPGIPGLLGLQGPPGPPGVPGPPGPGGSPGLPGEIGFPGKPGPPGPTG
PPGKDGPNGPPGPPGTKGEPGERGEDGLPGKPGLRGEIGEQGLAGRPGEK
GEAGLPGAPGFPGVRGEKGDQGEKGELGLPGLKGDRGEKGEAGPAGPPGL
PGTTSLFTPHPRMPGEQGPKGEKGDPGLPGEPGLQGRPGELGPQGPTGPP
GAKGQEGAHGAPGAAGNPGAPGHVGAPGPSGPPGSVGAPGLRGTPGKDGE
RGEKGAAGEEGSPGPVGPRGDPGAPGLPGPPGKGKDGEPGLRGSPGLPGP
LGTKAACGKVRGSENCALGGQCVKGDRGAPGIPGSPGSRGDPGIGVAGPP
GPSGPPGDKGSPGSRGLPGFPGPQGPAGRDGAPGNPGERGPPGKPGLSSL
LSPGDINLLAKDVCNDCPPGPPGLPGLPGFKGDKGVPGKPGREGTEGKKG
EAGPPGLPGPPGIAGPQGSQGERGADGEVGQKGDQGHPGVPGFMGPPGNP
GPPGADGIAGAAGPPGIQGSPGKEGPPGPQGPSGLPGIPGEEGKEGRDGK
PGPPGEPGKAGEPGLPGPEGARGPPGFKGHTGDSGAPGPRGESGAMGLPG
QEGLPGKDGDTGPTGPQGPQGPRGPPGKNGSPGSPGEPGPSGTPGQKGSK
GENGSPGLPGFLGPRGPPGEPGEKGVPGKEGVPGKPGEPGFKGERGDPGI
KGDKGPPGGKGQPGDPGIPGHKGHTGLMGPQGLPGENGPVGPPGPPGQPG
FPGLRGESPSMETLRRLIQEELGKQLETRLAYLLAQMPPAYMKSSQGRPG
PPGPPGKDGLPGRAGPMGEPGRPGQGGLEGPSGPIGPKGERGAKGDPGAP
GVGLRGEMGPPGIPGQPGEPGYAKDGLPGIPGPQGETGPAGHPGLPGPPG
PPGQCDPSQCAYFASLAARPGNVKGP

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL22A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22989 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q8NFW1 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 8
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші