COL22A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL22A1, collagen, type XXII, alpha 1, collagen type XXII alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610026 MGI: 1916950 HomoloGene: 43567 GeneCards: COL22A1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
бронхіальна астма[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця |
---|
Біологічний процес | • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | н/д | Хр. 15: 71.67 – 71.91 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL22A1 (англ. Collagen type XXII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 161 145[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAGLRGNAVA | | GLLWMLLLWS | | GGGGCQAQRA | | GCKSVHYDLV | | FLLDTSSSVG |
KEDFEKVRQW | | VANLVDTFEV | | GPDRTRVGVV | | RYSDRPTTAF | | ELGLFGSQEE |
VKAAARRLAY | | HGGNTNTGDA | | LRYITARSFS | | PHAGGRPRDR | | AYKQVAILLT |
DGRSQDLVLD | | AAAAAHRAGI | | RIFAVGVGEA | | LKEELEEIAS | | EPKSAHVFHV |
SDFNAIDKIR | | GKLRRRLCEN | | VLCPSVRVEG | | DRFKHTNGGT | | KEITGFDLMD |
LFSVKEILGK | | RENGAQSSYV | | RMGSFPVVQS | | TEDVFPQGLP | | DEYAFVTTFR |
FRKTSRKEDW | | YIWQVIDQYS | | IPQVSIRLDG | | ENKAVEYNAV | | GAMKDAVRVV |
FRGSRVNDLF | | DRDWHKMALS | | IQAQNVSLHI | | DCALVQTLPI | | EERENIDIQG |
KTVIGKRLYD | | SVPIDFDLQR | | IVIYCDSRHA | | ELETCCDIPS | | GPCQVTVVTE |
PPPPPPPQRP | | PTPGSEQIGF | | LKTINCSCPA | | GEKGEMGVAG | | PMGLPGPKGD |
IGAIGPVGAP | | GPKGEKGDVG | | IGPFGQGEKG | | EKGSLGLPGP | | PGRDGSKGMR |
GEPGELGEPG | | LPGEVGMRGP | | QGPPGLPGPP | | GRVGAPGLQG | | ERGEKGTRGE |
KGERGLDGFP | | GKPGDTGQQG | | RPGPSGVAGP | | QGEKGDVGPA | | GPPGVPGSVV |
QQEGLKGEQG | | APGPRGHQGA | | PGPPGARGPI | | GPEGRDGPPG | | LQGLRGKKGD |
MGPPGIPGLL | | GLQGPPGPPG | | VPGPPGPGGS | | PGLPGEIGFP | | GKPGPPGPTG |
PPGKDGPNGP | | PGPPGTKGEP | | GERGEDGLPG | | KPGLRGEIGE | | QGLAGRPGEK |
GEAGLPGAPG | | FPGVRGEKGD | | QGEKGELGLP | | GLKGDRGEKG | | EAGPAGPPGL |
PGTTSLFTPH | | PRMPGEQGPK | | GEKGDPGLPG | | EPGLQGRPGE | | LGPQGPTGPP |
GAKGQEGAHG | | APGAAGNPGA | | PGHVGAPGPS | | GPPGSVGAPG | | LRGTPGKDGE |
RGEKGAAGEE | | GSPGPVGPRG | | DPGAPGLPGP | | PGKGKDGEPG | | LRGSPGLPGP |
LGTKAACGKV | | RGSENCALGG | | QCVKGDRGAP | | GIPGSPGSRG | | DPGIGVAGPP |
GPSGPPGDKG | | SPGSRGLPGF | | PGPQGPAGRD | | GAPGNPGERG | | PPGKPGLSSL |
LSPGDINLLA | | KDVCNDCPPG | | PPGLPGLPGF | | KGDKGVPGKP | | GREGTEGKKG |
EAGPPGLPGP | | PGIAGPQGSQ | | GERGADGEVG | | QKGDQGHPGV | | PGFMGPPGNP |
GPPGADGIAG | | AAGPPGIQGS | | PGKEGPPGPQ | | GPSGLPGIPG | | EEGKEGRDGK |
PGPPGEPGKA | | GEPGLPGPEG | | ARGPPGFKGH | | TGDSGAPGPR | | GESGAMGLPG |
QEGLPGKDGD | | TGPTGPQGPQ | | GPRGPPGKNG | | SPGSPGEPGP | | SGTPGQKGSK |
GENGSPGLPG | | FLGPRGPPGE | | PGEKGVPGKE | | GVPGKPGEPG | | FKGERGDPGI |
KGDKGPPGGK | | GQPGDPGIPG | | HKGHTGLMGP | | QGLPGENGPV | | GPPGPPGQPG |
FPGLRGESPS | | METLRRLIQE | | ELGKQLETRL | | AYLLAQMPPA | | YMKSSQGRPG |
PPGPPGKDGL | | PGRAGPMGEP | | GRPGQGGLEG | | PSGPIGPKGE | | RGAKGDPGAP |
GVGLRGEMGP | | PGIPGQPGEP | | GYAKDGLPGI | | PGPQGETGPA | | GHPGLPGPPG |
PPGQCDPSQC | | AYFASLAARP | | GNVKGP |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL22A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22989 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NFW1 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |