COL19A1

COL19A1
Ідентифікатори
Символи COL19A1, COL9A1L, D6S228E, collagen type XIX alpha 1, collagen type XIX alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 120165 MGI: 1095415 HomoloGene: 55608 GeneCards: COL19A1
Онтологія гена
Молекулярна функція

• protein-macromolecule adaptor activity
• extracellular matrix structural constituent
• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength

Клітинна компонента

• endoplasmic reticulum lumen
• колаген
• extracellular region
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• міжклітинний простір
• collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

• collagen catabolic process
• multicellular organism development
• skeletal system development
• диференціація клітин
• muscle organ development
• skeletal muscle tissue development
• extracellular matrix organization
• адгезія клітин
• cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1310
12823
Ensembl
ENSG00000082293
ENSMUSG00000026141
UniProt
Q14993
Q0VF58
RefSeq (мРНК)
NM_001858
NM_007733
RefSeq (білок)
NP_001849
NP_031759
Локус (UCSC) Хр. 6: 69.87 – 70.21 Mb Хр. 1: 24.3 – 24.63 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL19A1 (англ. Collagen type XIX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 142 амінокислот, а молекулярна маса — 115 221[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRLTGPWKLWLWMSIFLLPASTSVTVRDKTEESCPILRIEGHQLTYDNIN
KLEVSGFDLGDSFSLRRAFCESDKTCFKLGSALLIRDTIKIFPKGLPEEY
SVAAMFRVRRNAKKERWFLWQVLNQQNIPQISIVVDGGKKVVEFMFQATE
GDVLNYIFRNRELRPLFDRQWHKLGISIQSQVISLYMDCNLIARRQTDEK
DTVDFHGRTVIATRASDGKPVDIELHQLKIYCSANLIAQETCCEISDTKC
PEQDGFGNIASSWVTAHASKMSSYLPAKQELKDQCQCIPNKGEAGLPGAP
GSPGQKGHKGEPGENGLHGAPGFPGQKGEQGFEGSKGETGEKGEQGEKGD
PALAGLNGENGLKGDLGPHGPPGPKGEKGDTGPPGPPALPGSLGIQGPQG
PPGKEGQRGRRGKTGPPGKPGPPGPPGPPGIQGIHQTLGGYYNKDNKGND
EHEAGGLKGDKGETGLPGFPGSVGPKGQKGEPGEPFTKGEKGDRGEPGVI
GSQGVKGEPGDPGPPGLIGSPGLKGQQGSAGSMGPRGPPGDVGLPGEHGI
PGKQGIKGEKGDPGGIIGPPGLPGPKGEAGPPGKSLPGEPGLDGNPGAPG
PRGPKGERGLPGVHGSPGDIGPQGIGIPGRTGAQGPAGEPGIQGPRGLPG
LPGTPGTPGNDGVPGRDGKPGLPGPPGDPIALPLLGDIGALLKNFCGNCQ
ASVPGLKSNKGEEGGAGEPGKYDSMARKGDIGPRGPPGIPGREGPKGSKG
ERGYPGIPGEKGDEGLQGIPGIPGAPGPTGPPGLMGRTGHPGPTGAKGEK
GSDGPPGKPGPPGPPGIPFNERNGMSSLYKIKGGVNVPSYPGPPGPPGPK
GDPGPVGEPGAMGLPGLEGFPGVKGDRGPAGPPGIAGMSGKPGAPGPPGV
PGEPGERGPVGDIGFPGPEGPSGKPGINGKDGIPGAQGIMGKPGDRGPKG
ERGDQGIPGDRGSQGERGKPGLTGMKGAIGPMGPPGNKGSMGSPGHQGPP
GSPGIPGIPADAVSFEEIKKYINQEVLRIFEERMAVFLSQLKLPAAMLAA
QAYGRPGPPGKDGLPGPPGDPGPQGYRGQKGERGEPGIGLPGSPGLPGTS
ALGLPGSPGAPGPQGPPGPSGRCNPEDCLYPVSHAHQRTGGN

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, міогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Inoguchi K., Yoshioka H., Khaleduzzaman M., Ninomiya Y. (1995). The mRNA for alpha 1(XIX) collagen chain, a new member of FACITs, contains a long unusual 3' untranslated region and displays many unique splicing variants. J. Biochem. 117: 137—146. PMID 7775380

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2196 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q14993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 6
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші