COL4A3 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL4A3, collagen type IV alpha 3 chain, ATS2, ATS3 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 120070 MGI: 104688 HomoloGene: 68033 GeneCards: COL4A3 |
---|
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • extracellular matrix structural constituent • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase inhibitor activity • integrin binding • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • колаген • endoplasmic reticulum lumen • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум • extracellular region • базальна мембрана • collagen type IV trimer • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • extracellular matrix organization • слух • кровообіг • адгезія клітин • endothelial cell apoptotic process • проліферація • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • negative regulation of cell population proliferation • cell surface receptor signaling pathway • negative regulation of endopeptidase activity • negative regulation of angiogenesis • glomerular basement membrane development • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • response to glucose |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/6/6e/PBB_GE_COL4A3_216893_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL4A3_216893_s_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/90/PBB_GE_COL4A3_214641_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL4A3_214641_at_fs.png)
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/bd/PBB_GE_COL4A3_222073_at_fs.png/250px-PBB_GE_COL4A3_222073_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_000091 NM_031362 NM_031363 NM_031364 NM_031365
| NM_031366 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 2: 227.16 – 227.31 Mb | Хр. 1: 82.56 – 82.7 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL4A3 (англ. Collagen type IV alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 161 813[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSARTAPRPQ | | VLLLPLLLVL | | LAAAPAASKG | | CVCKDKGQCF | | CDGAKGEKGE |
KGFPGPPGSP | | GQKGFTGPEG | | LPGPQGPKGF | | PGLPGLTGSK | | GVRGISGLPG |
FSGSPGLPGT | | PGNTGPYGLV | | GVPGCSGSKG | | EQGFPGLPGT | | LGYPGIPGAA |
GLKGQKGAPA | | KEEDIELDAK | | GDPGLPGAPG | | PQGLPGPPGF | | PGPVGPPGPP |
GFFGFPGAMG | | PRGPKGHMGE | | RVIGHKGERG | | VKGLTGPPGP | | PGTVIVTLTG |
PDNRTDLKGE | | KGDKGAMGEP | | GPPGPSGLPG | | ESYGSEKGAP | | GDPGLQGKPG |
KDGVPGFPGS | | EGVKGNRGFP | | GLMGEDGIKG | | QKGDIGPPGF | | RGPTEYYDTY |
QEKGDEGTPG | | PPGPRGARGP | | QGPSGPPGVP | | GSPGSSRPGL | | RGAPGWPGLK |
GSKGERGRPG | | KDAMGTPGSP | | GCAGSPGLPG | | SPGPPGPPGD | | IVFRKGPPGD |
HGLPGYLGSP | | GIPGVDGPKG | | EPGLLCTQCP | | YIPGPPGLPG | | LPGLHGVKGI |
PGRQGAAGLK | | GSPGSPGNTG | | LPGFPGFPGA | | QGDPGLKGEK | | GETLQPEGQV |
GVPGDPGLRG | | QPGRKGLDGI | | PGTPGVKGLP | | GPKGELALSG | | EKGDQGPPGD |
PGSPGSPGPA | | GPAGPPGYGP | | QGEPGLQGTQ | | GVPGAPGPPG | | EAGPRGELSV |
STPVPGPPGP | | PGPPGHPGPQ | | GPPGIPGSLG | | KCGDPGLPGP | | DGEPGIPGIG |
FPGPPGPKGD | | QGFPGTKGSL | | GCPGKMGEPG | | LPGKPGLPGA | | KGEPAVAMPG |
GPGTPGFPGE | | RGNSGEHGEI | | GLPGLPGLPG | | TPGNEGLDGP | | RGDPGQPGPP |
GEQGPPGRCI | | EGPRGAQGLP | | GLNGLKGQQG | | RRGKTGPKGD | | PGIPGLDRSG |
FPGETGSPGI | | PGHQGEMGPL | | GQRGYPGNPG | | ILGPPGEDGV | | IGMMGFPGAI |
GPPGPPGNPG | | TPGQRGSPGI | | PGVKGQRGTP | | GAKGEQGDKG | | NPGPSEISHV |
IGDKGEPGLK | | GFAGNPGEKG | | NRGVPGMPGL | | KGLKGLPGPA | | GPPGPRGDLG |
STGNPGEPGL | | RGIPGSMGNM | | GMPGSKGKRG | | TLGFPGRAGR | | PGLPGIHGLQ |
GDKGEPGYSE | | GTRPGPPGPT | | GDPGLPGDMG | | KKGEMGQPGP | | PGHLGPAGPE |
GAPGSPGSPG | | LPGKPGPHGD | | LGFKGIKGLL | | GPPGIRGPPG | | LPGFPGSPGP |
MGIRGDQGRD | | GIPGPAGEKG | | ETGLLRAPPG | | PRGNPGAQGA | | KGDRGAPGFP |
GLPGRKGAMG | | DAGPRGPTGI | | EGFPGPPGLP | | GAIIPGQTGN | | RGPPGSRGSP |
GAPGPPGPPG | | SHVIGIKGDK | | GSMGHPGPKG | | PPGTAGDMGP | | PGRLGAPGTP |
GLPGPRGDPG | | FQGFPGVKGE | | KGNPGFLGSI | | GPPGPIGPKG | | PPGVRGDPGT |
LKIISLPGSP | | GPPGTPGEPG | | MQGEPGPPGP | | PGNLGPCGPR | | GKPGKDGKPG |
TPGPAGEKGN | | KGSKGEPGPA | | GSDGLPGLKG | | KRGDSGSPAT | | WTTRGFVFTR |
HSQTTAIPSC | | PEGTVPLYSG | | FSFLFVQGNQ | | RAHGQDLGTL | | GSCLQRFTTM |
PFLFCNVNDV | | CNFASRNDYS | | YWLSTPALMP | | MNMAPITGRA | | LEPYISRCTV |
CEGPAIAIAV | | HSQTTDIPPC | | PHGWISLWKG | | FSFIMFTSAG | | SEGTGQALAS |
PGSCLEEFRA | | SPFLECHGRG | | TCNYYSNSYS | | FWLASLNPER | | MFRKPIPSTV |
KAGELEKIIS | | RCQVCMKKRH |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Raya A., Revert F., Navarro S., Saus J. (1999). Characterization of a novel type of serine/threonine kinase that specifically phosphorylates the human goodpasture antigen. J. Biol. Chem. 274: 12642—12649. PMID 10212244 DOI:10.1074/jbc.274.18.12642
- Maeshima Y., Colorado P.C., Kalluri R. (2000). Two RGD-independent alpha vbeta 3 integrin binding sites on tumstatin regulate distinct anti-tumor properties. J. Biol. Chem. 275: 23745—23750. PMID 10837460 DOI:10.1074/jbc.C000186200
- Nagel M., Nagorka S., Gross O. (2005). Novel COL4A5, COL4A4, and COL4A3 mutations in Alport syndrome. Hum. Mutat. 26: 60—60. PMID 15954103 DOI:10.1002/humu.9349
- Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 23013—23017. PMID 8083201
- Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1992). Exon/intron structure of the human alpha 3(IV) gene encompassing the Goodpasture antigen (alpha 3(IV)NC1). Identification of a potentially antigenic region at the triple helix/NC1 domain junction. J. Biol. Chem. 267: 19780—19784. PMID 1400291
- Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1994). J. Biol. Chem. 269: 17358—17358.
{{cite journal}}
: Пропущений або порожній |title=
(довідка) PMID 8006044
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2204 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q01955 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |