COL4A3

COL4A3
Ідентифікатори
Символи COL4A3, collagen type IV alpha 3 chain, ATS2, ATS3
Зовнішні ІД OMIM: 120070 MGI: 104688 HomoloGene: 68033 GeneCards: COL4A3
Реагує на сполуку
ocriplasmin[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

extracellular matrix structural constituent
structural molecule activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
metalloendopeptidase inhibitor activity
integrin binding
extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength

Клітинна компонента

колаген
endoplasmic reticulum lumen
внутрішньоклітинна мембранна органела
ендоплазматичний ретикулум
extracellular region
базальна мембрана
collagen type IV trimer
міжклітинний простір
GO:0005578 Позаклітинна матриця
collagen-containing extracellular matrix

Біологічний процес

extracellular matrix organization
слух
кровообіг
адгезія клітин
endothelial cell apoptotic process
проліферація
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
negative regulation of cell population proliferation
cell surface receptor signaling pathway
negative regulation of endopeptidase activity
negative regulation of angiogenesis
glomerular basement membrane development
collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway
response to glucose

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1285
12828
Ensembl
ENSG00000169031
ENSMUSG00000079465
UniProt
Q01955
Q9QZS0
RefSeq (мРНК)
NM_000091
NM_031362
NM_031363
NM_031364
NM_031365
NM_031366
NM_007734
RefSeq (білок)
NP_000082
NP_031760
Локус (UCSC) Хр. 2: 227.16 – 227.31 Mb Хр. 1: 82.56 – 82.7 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL4A3 (англ. Collagen type IV alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 161 813[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSARTAPRPQVLLLPLLLVLLAAAPAASKGCVCKDKGQCFCDGAKGEKGE
KGFPGPPGSPGQKGFTGPEGLPGPQGPKGFPGLPGLTGSKGVRGISGLPG
FSGSPGLPGTPGNTGPYGLVGVPGCSGSKGEQGFPGLPGTLGYPGIPGAA
GLKGQKGAPAKEEDIELDAKGDPGLPGAPGPQGLPGPPGFPGPVGPPGPP
GFFGFPGAMGPRGPKGHMGERVIGHKGERGVKGLTGPPGPPGTVIVTLTG
PDNRTDLKGEKGDKGAMGEPGPPGPSGLPGESYGSEKGAPGDPGLQGKPG
KDGVPGFPGSEGVKGNRGFPGLMGEDGIKGQKGDIGPPGFRGPTEYYDTY
QEKGDEGTPGPPGPRGARGPQGPSGPPGVPGSPGSSRPGLRGAPGWPGLK
GSKGERGRPGKDAMGTPGSPGCAGSPGLPGSPGPPGPPGDIVFRKGPPGD
HGLPGYLGSPGIPGVDGPKGEPGLLCTQCPYIPGPPGLPGLPGLHGVKGI
PGRQGAAGLKGSPGSPGNTGLPGFPGFPGAQGDPGLKGEKGETLQPEGQV
GVPGDPGLRGQPGRKGLDGIPGTPGVKGLPGPKGELALSGEKGDQGPPGD
PGSPGSPGPAGPAGPPGYGPQGEPGLQGTQGVPGAPGPPGEAGPRGELSV
STPVPGPPGPPGPPGHPGPQGPPGIPGSLGKCGDPGLPGPDGEPGIPGIG
FPGPPGPKGDQGFPGTKGSLGCPGKMGEPGLPGKPGLPGAKGEPAVAMPG
GPGTPGFPGERGNSGEHGEIGLPGLPGLPGTPGNEGLDGPRGDPGQPGPP
GEQGPPGRCIEGPRGAQGLPGLNGLKGQQGRRGKTGPKGDPGIPGLDRSG
FPGETGSPGIPGHQGEMGPLGQRGYPGNPGILGPPGEDGVIGMMGFPGAI
GPPGPPGNPGTPGQRGSPGIPGVKGQRGTPGAKGEQGDKGNPGPSEISHV
IGDKGEPGLKGFAGNPGEKGNRGVPGMPGLKGLKGLPGPAGPPGPRGDLG
STGNPGEPGLRGIPGSMGNMGMPGSKGKRGTLGFPGRAGRPGLPGIHGLQ
GDKGEPGYSEGTRPGPPGPTGDPGLPGDMGKKGEMGQPGPPGHLGPAGPE
GAPGSPGSPGLPGKPGPHGDLGFKGIKGLLGPPGIRGPPGLPGFPGSPGP
MGIRGDQGRDGIPGPAGEKGETGLLRAPPGPRGNPGAQGAKGDRGAPGFP
GLPGRKGAMGDAGPRGPTGIEGFPGPPGLPGAIIPGQTGNRGPPGSRGSP
GAPGPPGPPGSHVIGIKGDKGSMGHPGPKGPPGTAGDMGPPGRLGAPGTP
GLPGPRGDPGFQGFPGVKGEKGNPGFLGSIGPPGPIGPKGPPGVRGDPGT
LKIISLPGSPGPPGTPGEPGMQGEPGPPGPPGNLGPCGPRGKPGKDGKPG
TPGPAGEKGNKGSKGEPGPAGSDGLPGLKGKRGDSGSPATWTTRGFVFTR
HSQTTAIPSCPEGTVPLYSGFSFLFVQGNQRAHGQDLGTLGSCLQRFTTM
PFLFCNVNDVCNFASRNDYSYWLSTPALMPMNMAPITGRALEPYISRCTV
CEGPAIAIAVHSQTTDIPPCPHGWISLWKGFSFIMFTSAGSEGTGQALAS
PGSCLEEFRASPFLECHGRGTCNYYSNSYSFWLASLNPERMFRKPIPSTV
KAGELEKIISRCQVCMKKRH

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • Raya A., Revert F., Navarro S., Saus J. (1999). Characterization of a novel type of serine/threonine kinase that specifically phosphorylates the human goodpasture antigen. J. Biol. Chem. 274: 12642—12649. PMID 10212244 DOI:10.1074/jbc.274.18.12642
  • Maeshima Y., Colorado P.C., Kalluri R. (2000). Two RGD-independent alpha vbeta 3 integrin binding sites on tumstatin regulate distinct anti-tumor properties. J. Biol. Chem. 275: 23745—23750. PMID 10837460 DOI:10.1074/jbc.C000186200
  • Nagel M., Nagorka S., Gross O. (2005). Novel COL4A5, COL4A4, and COL4A3 mutations in Alport syndrome. Hum. Mutat. 26: 60—60. PMID 15954103 DOI:10.1002/humu.9349
  • Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 23013—23017. PMID 8083201
  • Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1992). Exon/intron structure of the human alpha 3(IV) gene encompassing the Goodpasture antigen (alpha 3(IV)NC1). Identification of a potentially antigenic region at the triple helix/NC1 domain junction. J. Biol. Chem. 267: 19780—19784. PMID 1400291
  • Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1994). J. Biol. Chem. 269: 17358—17358. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8006044

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2204 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, Q01955 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Позаклітинний матрикс
Колаген
Фібрилотворчі
Інші
  • мультиплексин: COL15A1
  • тип XVIII
Ензими
Ламінін
Інші
Інші