COL28A1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | COL28A1, COL28, collagen type XXVIII alpha 1, collagen type XXVIII alpha 1 chain |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609996 MGI: 2685312 HomoloGene: 66345 GeneCards: COL28A1 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
натуральна віспа[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
ocriplasmin[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • peptidase inhibitor activity • serine-type endopeptidase inhibitor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength |
---|
Клітинна компонента | • extracellular region • базальна мембрана • колаген • endoplasmic reticulum lumen • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • negative regulation of peptidase activity • адгезія клітин • negative regulation of endopeptidase activity • extracellular matrix organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 7: 7.36 – 7.54 Mb | Хр. 6: 8 – 8.19 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
COL28A1 (англ. Collagen type XXVIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 125 амінокислот, а молекулярна маса — 116 657[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MWNRYFVFYL | | LLLSAFTSQT | | VSGQRKKGPK | | SNLLARKSDV | | QGSICFIDIV |
FIVDSSESSK | | IALFDKQKDF | | VDSLSDKIFQ | | LTPGRSLEYD | | IKLAALQFSS |
SVQIDPPFSS | | WKDLQTFKQK | | VKSMNLIGQG | | TFSYYAISNA | | TRLLKREGRK |
DGVKVVLLMT | | DGIDHPKNPD | | VQSISEDARI | | SGISFITIAL | | STVVNEAKLR |
LISGDSSSEP | | TLLLSDPTLV | | DKIQDRLDIL | | FEKKCERKIC | | ECEKGDPGDP |
GPPGTHGNPG | | IKGERGPKGN | | PGNAQKGEAG | | ERGPGGIPGY | | KGDKGERGEC |
GKPGIKGDKG | | SPGPYGPKGP | | RGIQGITGPP | | GDPGPKGFQG | | NKGEPGPPGP |
YGSPGAPGIG | | QQGIKGERGQ | | EGRPGAPGPI | | GVGEPGQPGP | | RGPEGVPGER |
GLPGEGFPGP | | KGEKGSEGPT | | GPQGLQGLSI | | KGEKGDIGPV | | GPQGPMGIPG |
IGSQGEQGIQ | | GPIGPPGPQG | | PAGQGLPGSK | | GEVGQMGPTG | | PRGPVGIGVQ |
GPKGEPGSIG | | LPGQPGVPGE | | DGAAGKKGEA | | GLPGARGPEG | | PPGKGQPGPK |
GDEGKKGSKG | | NQGQRGLPGP | | EGPKGEPGIM | | GPFGMPGTSI | | PGPPGPKGDR |
GGPGIPGFKG | | EPGLSIRGPK | | GVQGPRGPVG | | APGLKGDGYP | | GVPGPRGLPG |
PPGPMGLRGV | | GDTGAKGEPG | | VRGPPGPSGP | | RGVGTQGPKG | | DTGQKGLPGP |
PGPPGYGSQG | | IKGEQGPQGF | | PGPKGTMGHG | | LPGQKGEHGE | | RGDVGKKGDK |
GEIGEPGSPG | | KQGLQGPKGD | | LGLTKEEIIK | | LITEICGCGP | | KCKETPLELV |
FVIDSSESVG | | PENFQIIKNF | | VKTMADRVAL | | DLATARIGII | | NYSHKVEKVA |
NLKQFSSKDD | | FKLAVDNMQY | | LGEGTYTATA | | LQAANDMFED | | ARPGVKKVAL |
VITDGQTDSR | | DKEKLTEVVK | | NASDTNVEIF | | VIGVVKKNDP | | NFEIFHKEMN |
LIATDPEHVY | | QFDDFFTLQD | | TLKQKLFQKI | | CEDFDSYLVQ | | IFGSSSPQPG |
FGMSGEELSE | | STPEPQKEIS | | ESLSVTRDQD | | EDDKAPEPTW | | ADDLPATTSS |
EATTTPRPLL | | STPVDGAEDP | | RCLEALKPGN | | CGEYVVRWYY | | DKQVNSCARF |
WFSGCNGSGN | | RFNSEKECQE | | TCIQG |
Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL28A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22442 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q2UY09 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |