ZNF423 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZNF423, Ebfaz, JBTS19, NPHP14, OAZ, Roaz, ZFP423, Zfp104, hOAZ, zinc finger protein 423 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604557 MGI: 1891217 HomoloGene: 9010 GeneCards: ZNF423 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
nephronophthisis 14[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • Сигнальний шлях Notch • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of BMP signaling pathway • negative regulation of cold-induced thermogenesis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/71/PBB_GE_ZNF423_214761_at_fs.png/250px-PBB_GE_ZNF423_214761_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001271620 NM_015069 NM_001330533 NM_001379286 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001258549 NP_001317462 NP_055884 NP_001366215 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 49.49 – 49.86 Mb | Хр. 8: 88.39 – 88.69 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZNF423 (англ. Zinc finger protein 423) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 284 амінокислот, а молекулярна маса — 144 605[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHKKRVEEGE | | ASDFSLAWDS | | SVTAAGGLEG | | EPECDQKTSR | | ALEDRNSVTS |
QEERNEDDED | | MEDESIYTCD | | HCQQDFESLA | | DLTDHRAHRC | | PGDGDDDPQL |
SWVASSPSSK | | DVASPTQMIG | | DGCDLGLGEE | | EGGTGLPYPC | | QFCDKSFIRL |
SYLKRHEQIH | | SDKLPFKCTY | | CSRLFKHKRS | | RDRHIKLHTG | | DKKYHCHECE |
AAFSRSDHLK | | IHLKTHSSSK | | PFKCTVCKRG | | FSSTSSLQSH | | MQAHKKNKEH |
LAKSEKEAKK | | DDFMCDYCED | | TFSQTEELEK | | HVLTRHPQLS | | EKADLQCIHC |
PEVFVDENTL | | LAHIHQAHAN | | QKHKCPMCPE | | QFSSVEGVYC | | HLDSHRQPDS |
SNHSVSPDPV | | LGSVASMSSA | | TPDSSASVER | | GSTPDSTLKP | | LRGQKKMRDD |
GQGWTKVVYS | | CPYCSKRDFN | | SLAVLEIHLK | | TIHADKPQQS | | HTCQICLDSM |
PTLYNLNEHV | | RKLHKNHAYP | | VMQFGNISAF | | HCNYCPEMFA | | DINSLQEHIR |
VSHCGPNANP | | SDGNNAFFCN | | QCSMGFLTES | | SLTEHIQQAH | | CSVGSAKLES |
PVVQPTQSFM | | EVYSCPYCTN | | SPIFGSILKL | | TKHIKENHKN | | IPLAHSKKSK |
AEQSPVSSDV | | EVSSPKRQRL | | SASANSISNG | | EYPCNQCDLK | | FSNFESFQTH |
LKLHLELLLR | | KQACPQCKED | | FDSQESLLQH | | LTVHYMTTST | | HYVCESCDKQ |
FSSVDDLQKH | | LLDMHTFVLY | | HCTLCQEVFD | | SKVSIQVHLA | | VKHSNEKKMY |
RCTACNWDFR | | KEADLQVHVK | | HSHLGNPAKA | | HKCIFCGETF | | STEVELQCHI |
TTHSKKYNCK | | FCSKAFHAII | | LLEKHLREKH | | CVFDAATENG | | TANGVPPMAT |
KKAEPADLQG | | MLLKNPEAPN | | SHEASEDDVD | | ASEPMYGCDI | | CGAAYTMEVL |
LQNHRLRDHN | | IRPGEDDGSR | | KKAEFIKGSH | | KCNVCSRTFF | | SENGLREHLQ |
THRGPAKHYM | | CPICGERFPS | | LLTLTEHKVT | | HSKSLDTGTC | | RICKMPLQSE |
EEFIEHCQMH | | PDLRNSLTGF | | RCVVCMQTVT | | STLELKIHGT | | FHMQKLAGSS |
AASSPNGQGL | | QKLYKCALCL | | KEFRSKQDLV | | KLDVNGLPYG | | LCAGCMARSA |
NGQVGGLAPP | | EPADRPCAGL | | RCPECSVKFE | | SAEDLESHMQ | | VDHRDLTPET |
SGPRKGTQTS | | PVPRKKTYQC | | IKCQMTFENE | | REIQIHVANH | | MIEEGINHEC |
KLCNQMFDSP | | AKLLCHLIEH | | SFEGMGGTFK | | CPVCFTVFVQ | | ANKLQQHIFA |
VHGQEDKIYD | | CSQCPQKFFF | | QTELQNHTMS | | QHAQ |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZNF423 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16762 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q2M1K9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|