MYRF

Ідентифікатори

Символи

MYRF, C11orf9, MRF, Ndt80, pqn-47, myelin regulatory factor, 11orf9, MMERV, CUGS

Зовнішні ІД

OMIM: 608329 MGI: 2684944 HomoloGene: 32167 GeneCards: MYRF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента	• endoplasmic reticulum membrane • клітинне ядро • мембрана • цитоплазма • integral component of membrane • ендоплазматичний ретикулум • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі • гіалоплазма
Біологічний процес	• positive regulation of myelination • oligodendrocyte differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • протеоліз • central nervous system myelination • central nervous system myelin maintenance • диференціація клітин • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • oligodendrocyte development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein autoprocessing
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


745


225908

Ensembl


ENSG00000124920


ENSMUSG00000036098

UniProt


Q9Y2G1


Q3UR85

RefSeq (мРНК)


NM_001127392 NM_013279


NM_001033481

RefSeq (білок)


NP_001120864 NP_037411


NP_001028653 NP_001391042

Локус (UCSC)

Хр. 11: 61.75 – 61.79 Mb

Хр. 19: 10.19 – 10.22 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MYRF (англ. Myelin regulatory factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 151 амінокислот, а молекулярна маса — 124 397^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVVDETEAL	QRFFEGHDIN	GALEPSNIDT	SILEEYISKE	DASDLCFPDI
SAPASSASYS	HGQPAMPGSS	GVHHLSPPGG	GPSPGRHGPL	PPPGYGTPLN
CNNNNGMGAA	PKPFPGGTGP	PIKAEPKAPY	APGTLPDSPP	DSGSEAYSPQ
QVNEPHLLRT	ITPETLCHVG	VPSRLEHPPP	PPAHLPGPPP	PPPPPPHYPV
LQRDLYMKAE	PPIPHYAAMG	QGLVPTDLHH	TQQSQMLHQL	LQQHGAELPT
HPSKKRKHSE	SPPSTLNAQM	LNGMIKQEPG	TVTALPLHPT	RAPSPPWPPQ
GPLSPGPGSL	PLSIARVQTP	PWHPPGAPSP	GLLQDSDSLS	GSYLDPNYQS
IKWQPHQQNK	WATLYDANYK	ELPMLTYRVD	ADKGFNFSVG	DDAFVCQKKN
HFQVTVYIGM	LGEPKYVKTP	EGLKPLDCFY	LKLHGVKLEA	LNQSINIEQS
QSDRSKRPFN	PVTVNLPPEQ	VTKVTVGRLH	FSETTANNMR	KKGKPNPDQR
YFMLVVALQA	HAQNQNYTLA	AQISERIIVR	ASNPGQFESD	SDVLWQRAQV
PDTVFHHGRV	GINTDRPDEA	LVVHGNVKVM	GSLMHPSDLR	AKEHVQEVDT
TEQLKRISRM	RLVHYRYKPE	FAASAGIEAT	APETGVIAQE	VKEILPEAVK
DTGDMVFANG	KTIENFLVVN	KERIFMENVG	AVKELCKLTD	NLETRIDELE
RWSHKLAKLR	RLDSLKSTGS	SGAFSHAGSQ	FSRAGSVPHK	KRPPKVASKS
SSVVPDQACI	SQRFLQGTII	ALVVVMAFSV	VSMSTLYVLS	LRTEEDLVDT
DGSFAVSTSC	LLALLRPQPP	GGSEALCPWS	SQSFGTTQLR	QSPLTTGLPG
IQPSLLLVTT	SLTSSAPGSA	VRTLDMCSSH	PCPVICCSSP	TTNPTTGPSL
GPSFNPGHVL	SPSPSPSTNR	SGPSQMALLP	VTNIRAKSWG	LSVNGIGHSK
HHKSLEPLAS	PAVPFPGGQG	KAKNSPSLGF	HGRARRGALQ	SSVGPAEPTW
AQGQSASLLA	EPVPSLTSIQ	VLENSMSITS	QYCAPGDACR	PGNFTYHIPV
SSGTPLHLSL	TLQMNSSSPV	SVVLCSLRSK	EEPCEEGSLP	QSLHTHQDTQ
GTSHRWPITI	LSFREFTYHF	RVALLGQANC	SSEALAQPAT	DYHFHFYRLC
D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

Cooper P.R., Nowak N.J., Higgins M.J., Church D.M., Shows T.B. (1998). Transcript mapping of the human chromosome 11q12-q13.1 gene-rich region identifies several newly described conserved genes. Genomics. 49: 419—429. PMID 9615227 DOI:10.1006/geno.1998.5291
Li Z., Park Y., Marcotte E.M. (2013). A bacteriophage tailspike domain promotes self-cleavage of a human membrane-bound transcription factor, the myelin regulatory factor MYRF. PLoS Biol. 11: E1001624—E1001624. PMID 23966832 DOI:10.1371/journal.pbio.1001624
Stoehr H., Marquardt A., White K., Weber B.H.F. (2000). cDNA cloning and genomic structure of a novel gene (C11orf9) localized to chromosome 11q12-->q13.1 which encodes a highly conserved, potential membrane-associated protein. Cytogenet. Cell Genet. 88: 211—216. PMID 10828591

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1181 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9Y2G1 (англ.) . Архів оригіналу за 18 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма