GATA1

GATA1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1GNF, 1Y0J, 2L5E, 2L6Y, 2L6Z, 3VD6, 3VEK

Ідентифікатори
Символи GATA1, ERYF1, GATA-1, GF-1, GF1, NF-E1, NFE1, XLANP, XLTDA, XLTT, GATA binding protein 1
Зовнішні ІД OMIM: 305371 MGI: 95661 HomoloGene: 1549 GeneCards: GATA1
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked dyserythropoetic anemia with abnormal platelets and neutropenia, Diamond-Blackfan anemia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

C2H2 zinc finger domain binding
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding
sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding
DNA binding
p53 binding
DNA binding, bending
chromatin DNA binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
chromatin binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
zinc ion binding
зв'язування з іоном металу
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

клітинне ядро
нуклеоплазма
transcription repressor complex
transcription regulator complex
protein-DNA complex

Біологічний процес

negative regulation of cell population proliferation
negative regulation of transcription regulatory region DNA binding
eosinophil fate commitment
in utero embryonic development
regulation of glycoprotein biosynthetic process
cellular response to thyroid hormone stimulus
зсідання крові
erythrocyte differentiation
Тромбоцитопоез
positive regulation of osteoblast proliferation
transcription by RNA polymerase II
platelet aggregation
negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of primitive erythrocyte differentiation
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of definitive erythrocyte differentiation
cell-cell signaling
embryonic hemopoiesis
розвиток клітин
positive regulation of erythrocyte differentiation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
megakaryocyte differentiation
dendritic cell differentiation
positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
negative regulation of bone mineralization
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
male gonad development
myeloid cell differentiation
negative regulation of apoptotic process
homeostasis of number of cells within a tissue
transcription, DNA-templated
basophil differentiation
eosinophil differentiation
erythrocyte development
regulation of megakaryocyte differentiation
regulation of hematopoietic stem cell differentiation
heart development
animal organ morphogenesis
гістогенез
anatomical structure formation involved in morphogenesis
digestive tract development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2623
14460
Ensembl
ENSG00000102145
ENSMUSG00000031162
UniProt
P15976
P17679
RefSeq (мРНК)
NM_002049
NM_008089
RefSeq (білок)
NP_002040
NP_032115
Локус (UCSC) Хр. X: 48.79 – 48.79 Mb Хр. X: 7.83 – 7.84 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GATA1 (англ. GATA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 42 751[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEFPGLGSLGTSEPLPQFVDPALVSSTPESGVFFPSGPEGLDAAASSTAP
STATAAAAALAYYRDAEAYRHSPVFQVYPLLNCMEGIPGGSPYAGWAYGK
TGLYPASTVCPTREDSPPQAVEDLDGKGSTSFLETLKTERLSPDLLTLGP
ALPSSLPVPNSAYGGPDFSSTFFSPTGSPLNSAAYSSPKLRGTLPLPPCE
ARECVNCGATATPLWRRDRTGHYLCNACGLYHKMNGQNRPLIRPKKRLIV
SKRAGTQCTNCQTTTTTLWRRNASGDPVCNACGLYYKLHQVNRPLTMRKD
GIQTRNRKASGKGKKKRGSSLGGTGAAEGPAGGFMVVAGGSGSGNCGEVA
SGLTLGPPGTAHLYQGLGPVVLSGPVSHLMPFPGPLLGSPTGSFPTGPMP
PTTSTTVVAPLSS

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Trainor C.D., Evans T., Felsenfeld G., Boguski M.S. (1990). Structure and evolution of a human erythroid transcription factor. Nature. 343: 92—96. PMID 2104960 DOI:10.1038/343092a0
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Calligaris R., Bottardi S., Cogoi S., Apezteguia I., Santoro C. (1995). Alternative translation initiation site usage results in two functionally distinct forms of the GATA-1 transcription factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11598—11602. PMID 8524811 DOI:10.1073/pnas.92.25.11598
  • Boyes J., Byfield P., Nakatani Y., Ogryzko V. (1998). Regulation of activity of the transcription factor GATA-1 by acetylation. Nature. 396: 594—598. PMID 9859997 DOI:10.1038/25166
  • Kuo Y.-Y., Chang Z.-F. (2007). GATA-1 and Gfi-1B interplay to regulate Bcl-xL transcription. Mol. Cell. Biol. 27: 4261—4272. PMID 17420275 DOI:10.1128/MCB.02212-06
  • Mehaffey M.G., Newton A.L., Gandhi M.J., Crossley M., Drachman J.G. (2001). X-linked thrombocytopenia caused by a novel mutation of GATA-1. Blood. 98: 2681—2688. PMID 11675338 DOI:10.1182/blood.V98.9.2681

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GATA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4170 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P15976 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші