NFATC2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1A02, 1OWR, 1P7H, 1PZU, 2AS5, 2O93, 3QRF

Ідентифікатори

Символи

NFATC2, NFAT1, NFATP, nuclear factor of activated T-cells 2, nuclear factor of activated T cells 2

Зовнішні ІД

OMIM: 600490 MGI: 102463 HomoloGene: 7861 GeneCards: NFATC2

Пов'язані генетичні захворювання

бічний аміотрофічний склероз^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • phosphatase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0032617 cytokine production • calcineurin-NFAT signaling cascade • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • myotube cell development • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • Fc-epsilon receptor signaling pathway • positive regulation of myoblast fusion • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of B cell proliferation • cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of regulatory T cell differentiation • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


4773


18019

Ensembl


ENSG00000101096


ENSMUSG00000027544

UniProt


Q13469


Q60591

RefSeq (мРНК)

NM_001136021 NM_001258292 NM_001258294 NM_001258295 NM_001258296
NM_001258297 NM_012340 NM_173091

NM_001037177 NM_001037178 NM_001136073 NM_001291168 NM_001291169
NM_001291170 NM_001291171 NM_001291172 NM_001291173 NM_001291174 NM_001291175 NM_001291176 NM_001291177 NM_001291178 NM_001291179 NM_010899

RefSeq (білок)

NP_001129493 NP_001245221 NP_001245223 NP_001245224 NP_001245225
NP_001245226 NP_036472 NP_775114

NP_001032254 NP_001032255 NP_001129545 NP_001278097 NP_001278098
NP_001278099 NP_001278100 NP_001278101 NP_001278102 NP_001278103 NP_001278104 NP_001278105 NP_001278106 NP_001278107 NP_001278108 NP_035029

Локус (UCSC)

Хр. 20: 51.39 – 51.56 Mb

Хр. 2: 168.32 – 168.44 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NFATC2 (англ. Nuclear factor of activated T-cells 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 925 амінокислот, а молекулярна маса — 100 146^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNAPERQPQP	DGGDAPGHEP	GGSPQDELDF	SILFDYEYLN	PNEEEPNAHK
VASPPSGPAY	PDDVLDYGLK	PYSPLASLSG	EPPGRFGEPD	RVGPQKFLSA
AKPAGASGLS	PRIEITPSHE	LIQAVGPLRM	RDAGLLVEQP	PLAGVAASPR
FTLPVPGFEG	YREPLCLSPA	SSGSSASFIS	DTFSPYTSPC	VSPNNGGPDD
LCPQFQNIPA	HYSPRTSPIM	SPRTSLAEDS	CLGRHSPVPR	PASRSSSPGA
KRRHSCAEAL	VALPPGASPQ	RSRSPSPQPS	SHVAPQDHGS	PAGYPPVAGS
AVIMDALNSL	ATDSPCGIPP	KMWKTSPDPS	PVSAAPSKAG	LPRHIYPAVE
FLGPCEQGER	RNSAPESILL	VPPTWPKPLV	PAIPICSIPV	TASLPPLEWP
LSSQSGSYEL	RIEVQPKPHH	RAHYETEGSR	GAVKAPTGGH	PVVQLHGYME
NKPLGLQIFI	GTADERILKP	HAFYQVHRIT	GKTVTTTSYE	KIVGNTKVLE
IPLEPKNNMR	ATIDCAGILK	LRNADIELRK	GETDIGRKNT	RVRLVFRVHI
PESSGRIVSL	QTASNPIECS	QRSAHELPMV	ERQDTDSCLV	YGGQQMILTG
QNFTSESKVV	FTEKTTDGQQ	IWEMEATVDK	DKSQPNMLFV	EIPEYRNKHI
RTPVKVNFYV	INGKRKRSQP	QHFTYHPVPA	IKTEPTDEYD	PTLICSPTHG
GLGSQPYYPQ	HPMVAESPSC	LVATMAPCQQ	FRTGLSSPDA	RYQQQNPAAV
LYQRSKSLSP	SLLGYQQPAL	MAAPLSLADA	HRSVLVHAGS	QGQSSALLHP
SPTNQQASPV	IHYSPTNQQL	RCGSHQEFQH	IMYCENFAPG	TTRPGPPPVS
QGQRLSPGSY	PTVIQQQNAT	SQRAAKNGPP	VSDQKEVLPA	GVTIKQEQNL
DQTYLDDVNE	IIRKEFSGPP	ARNQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Vihma H., Pruunsild P., Timmusk T. (2008). Alternative splicing and expression of human and mouse NFAT genes. Genomics. 92: 279—291. PMID 18675896 DOI:10.1016/j.ygeno.2008.06.011
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Crabtree G.R. (1999). Generic signals and specific outcomes: signaling through Ca2+, calcineurin, and NF-AT. Cell. 96: 611—614. PMID 10089876 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80571-1
Bettelli E., Dastrange M., Oukka M. (2005). Foxp3 interacts with nuclear factor of activated T cells and NF-kappa B to repress cytokine gene expression and effector functions of T helper cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 5138—5143. PMID 15790681 DOI:10.1073/pnas.0501675102
Yiu G.K., Kaunisto A., Chin Y.R., Toker A. (2011). NFAT promotes carcinoma invasive migration through glypican-6. Biochem. J. 440: 157—166. PMID 21871017 DOI:10.1042/BJ20110530

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NFATC2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7776 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13469 (англ.) . Архів оригіналу за 29 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма