GLI3

GLI3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4BLD

Ідентифікатори
Символи GLI3, ACLS, GCPS, GLI3-190, GLI3FL, PAP-A, PAPA, PAPA1, PAPB, PHS, PPDIV, GLI family zinc finger 3
Зовнішні ІД OMIM: 165240 MGI: 95729 HomoloGene: 139 GeneCards: GLI3
Пов'язані генетичні захворювання
макулодистрофія, поліноз, Greig cephalopolysyndactyly syndrome, Pallister-Hall syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
histone deacetylase binding
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
зв'язування з іоном металу
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
beta-catenin binding
chromatin binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
histone acetyltransferase binding
nucleic acid binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
mediator complex binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
transcription repressor complex
клітинне ядро
nuclear speck
cell projection
mediator complex
війка
GO:0035085 Аксонема
нуклеоплазма
ciliary base
ciliary tip

Біологічний процес

embryonic skeletal system morphogenesis
pattern specification process
lateral semicircular canal development
negative regulation of neuron differentiation
T cell differentiation in thymus
tongue development
nose morphogenesis
optic nerve morphogenesis
smoothened signaling pathway involved in ventral spinal cord interneuron specification
anatomical structure formation involved in morphogenesis
oligodendrocyte differentiation
hindgut morphogenesis
spinal cord dorsal/ventral patterning
thymocyte apoptotic process
mammary gland development
limb development
odontogenesis of dentin-containing tooth
positive regulation of chondrocyte differentiation
embryonic digestive tract morphogenesis
inner ear development
metanephros development
melanocyte differentiation
negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
negative regulation of cell population proliferation
regulation of apoptotic process
positive regulation of neuroblast proliferation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
limb morphogenesis
negative regulation of smoothened signaling pathway
розвиток нирки
lung development
tube development
embryonic organ development
lateral ganglionic eminence cell proliferation
negative regulation of cell differentiation
embryonic digit morphogenesis
negative regulation of alpha-beta T cell differentiation
in utero embryonic development
transcription, DNA-templated
negative thymic T cell selection
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
heart development
central nervous system development
telencephalon development
branching involved in ureteric bud morphogenesis
embryonic limb morphogenesis
neural tube development
positive regulation of protein import into nucleus
smoothened signaling pathway
camera-type eye development
spinal cord motor neuron differentiation
positive regulation of alpha-beta T cell differentiation
lambdoid suture morphogenesis
regulation of bone development
roof of mouth development
proximal/distal pattern formation
GO:1903374 anatomical structure development
Загоєння ран
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
response to estrogen
cerebral cortex radial glia-guided migration
positive regulation of osteoblast differentiation
developmental growth
pallium development
mammary gland specification
frontal suture morphogenesis
anterior semicircular canal development
регуляція експресії генів
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
dorsal/ventral pattern formation
branching morphogenesis of an epithelial tube
embryonic digestive tract development
subpallium development
sagittal suture morphogenesis
forebrain dorsal/ventral pattern formation
protein processing
axon guidance
brain development
smoothened signaling pathway involved in dorsal/ventral neural tube patterning
forebrain radial glial cell differentiation
regulation of cell population proliferation
smoothened signaling pathway involved in spinal cord motor neuron cell fate specification
layer formation in cerebral cortex
embryonic morphogenesis
artery development
cell differentiation involved in kidney development
регуляція диференціювання клітин
forebrain development
neuron fate commitment
hippocampus development
camera-type eye morphogenesis
anterior/posterior pattern specification
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
transcription by RNA polymerase II
prostate gland development
liver regeneration

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2737
14634
Ensembl
ENSG00000106571
ENSMUSG00000021318
UniProt
P10071
Q61602
RefSeq (мРНК)
NM_000168
NM_008130
RefSeq (білок)
NP_000159
NP_032156
Локус (UCSC) Хр. 7: 41.96 – 42.26 Mb Хр. 13: 15.64 – 15.9 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GLI3 (англ. GLI family zinc finger 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 580 амінокислот, а молекулярна маса — 169 863[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEAQSHSSTTTEKKKVENSIVKCSTRTDVSEKAVASSTTSNEDESPGQTY
HRERRNAITMQPQNVQGLSKVSEEPSTSSDERASLIKKEIHGSLPHVAEP
SVPYRGTVFAMDPRNGYMEPHYHPPHLFPAFHPPVPIDARHHEGRYHYDP
SPIPPLHMTSALSSSPTYPDLPFIRISPHRNPTAASESPFSPPHPYINPY
MDYIRSLHSSPSLSMISATRGLSPTDAPHAGVSPAEYYHQMALLTGQRSP
YADIIPSAATAGTGAIHMEYLHAMDSTRFSSPRLSARPSRKRTLSISPLS
DHSFDLQTMIRTSPNSLVTILNNSRSSSSASGSYGHLSASAISPALSFTY
SSAPVSLHMHQQILSRQQSLGSAFGHSPPLIHPAPTFPTQRPIPGIPTVL
NPVQVSSGPSESSQNKPTSESAVSSTGDPMHNKRSKIKPDEDLPSPGARG
QQEQPEGTTLVKEEGDKDESKQEPEVIYETNCHWEGCAREFDTQEQLVHH
INNDHIHGEKKEFVCRWLDCSREQKPFKAQYMLVVHMRRHTGEKPHKCTF
EGCTKAYSRLENLKTHLRSHTGEKPYVCEHEGCNKAFSNASDRAKHQNRT
HSNEKPYVCKIPGCTKRYTDPSSLRKHVKTVHGPEAHVTKKQRGDIHPRP
PPPRDSGSHSQSRSPGRPTQGALGEQQDLSNTTSKREECLQVKTVKAEKP
MTSQPSPGGQSSCSSQQSPISNYSNSGLELPLTDGGSIGDLSAIDETPIM
DSTISTATTALALQARRNPAGTKWMEHVKLERLKQVNGMFPRLNPILPPK
APAVSPLIGNGTQSNNTCSLGGPMTLLPGRSDLSGVDVTMLNMLNRRDSS
ASTISSAYLSSRRSSGISPCFSSRRSSEASQAEGRPQNVSVADSYDPIST
DASRRSSEASQSDGLPSLLSLTPAQQYRLKAKYAAATGGPPPTPLPNMER
MSLKTRLALLGDALEPGVALPPVHAPRRCSDGGAHGYGRRHLQPHDAPGH
GVRRASDPVRTGSEGLALPRVPRFSSLSSCNPPAMATSAEKRSLVLQNYT
RPEGGQSRNFHSSPCPPSITENVTLESLTMDADANLNDEDFLPDDVVQYL
NSQNQAGYEQHFPSALPDDSKVPHGPGDFDAPGLPDSHAGQQFHALEQPC
PEGSKTDLPIQWNEVSSGSADLSSSKLKCGPRPAVPQTRAFGFCNGMVVH
PQNPLRSGPAGGYQTLGENSNPYGGPEHLMLHNSPGSGTSGNAFHEQPCK
APQYGNCLNRQPVAPGALDGACGAGIQASKLKSTPMQGSGGQLNFGLPVA
PNESAGSMVNGMQNQDPVGQGYLAHQLLGDSMQHPGAGRPGQQMLGQISA
TSHINIYQGPESCLPGAHGMGSQPSSLAVVRGYQPCASFGGSRRQAMPRD
SLALQSGQLSDTSQTCRVNGIKMEMKGQPHPLCSNLQNYSGQFYDQTVGF
SQQDTKAGSFSISDASCLLQGTSAKNSELLSPGANQVTSTVDSLDSHDLE
GVQIDFDAIIDDGDHSSLMSGALSPSIIQNLSHSSSRLTTPRASLPFPAL
SMSTTNMAIGDMSSLLTSLAEESKFLAVMQ

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, клітинних відростках, війках.

Література

  • Ruppert J.M., Vogelstein B., Arheden K., Kinzler K.W. (1990). GLI3 encodes a 190-kilodalton protein with multiple regions of GLI similarity. Mol. Cell. Biol. 10: 5408—5415. PMID 2118997 DOI:10.1128/MCB.10.10.5408
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Wang B., Fallon J.F., Beachy P.A. (2000). Hedgehog-regulated processing of Gli3 produces an anterior/posterior repressor gradient in the developing vertebrate limb. Cell. 100: 423—434. PMID 10693759 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80678-9
  • Koyabu Y., Nakata K., Mizugishi K., Aruga J., Mikoshiba K. (2001). Physical and functional interactions between Zic and Gli proteins. J. Biol. Chem. 276: 6889—6892. PMID 11238441 DOI:10.1074/jbc.C000773200
  • Tempe D., Casas M., Karaz S., Blanchet-Tournier M.F., Concordet J.P. (2006). Multisite protein kinase A and glycogen synthase kinase 3beta phosphorylation leads to Gli3 ubiquitination by SCFbetaTrCP. Mol. Cell. Biol. 26: 4316—4326. PMID 16705181 DOI:10.1128/MCB.02183-05
  • Wang B., Li Y. (2006). Evidence for the direct involvement of {beta}TrCP in Gli3 protein processing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 33—38. PMID 16371461 DOI:10.1073/pnas.0509927103

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GLI3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4319 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.
  5. UniProt, P10071 (англ.) . Архів оригіналу за 18 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 7
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші