CUX1

Ідентифікатори

Символи

CUX1, CASP, CDP, CDP/Cut, CDP1, COY1, CUTL1, CUX, Clox, Cux/CDP, GOLIM6, Nbla10317, p100, p110, p200, p75, cut like homeobox 1, GDDI

Зовнішні ІД

OMIM: 116896 HomoloGene: 22551 GeneCards: CUX1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein tyrosine kinase activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• гіалоплазма • комплекс Ґольджі • клітинне ядро • нуклеоплазма • Golgi membrane • integral component of membrane • integral component of Golgi membrane • мембрана
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multicellular organism development • retrograde transport, vesicle recycling within Golgi • positive regulation of dendrite morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • peptidyl-tyrosine phosphorylation • Golgi vesicle transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1523


116639

Ensembl


ENSG00000257923


ENSRNOG00000001424

UniProt


P39880 Q13948


P53565

RefSeq (мРНК)

NM_001202543 NM_001202544 NM_001202545 NM_001202546 NM_001913
NM_181500 NM_181552


NM_053860

RefSeq (білок)

NP_001189472 NP_001189473 NP_001189474 NP_001189475 NP_001904
NP_852477 NP_853530 NP_001189473.1 NP_001189474.1 NP_001189475.1 NP_001904.2 NP_852477.1


NP_446312

Локус (UCSC)

Хр. 7: 101.82 – 102.28 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CUX1 (англ. Homeobox protein cut-like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 505 амінокислот, а молекулярна маса — 164 187^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLCVAGARLK	RELDATATVL	ANRQDESEQS	RKRLIEQSRE	FKKNTPEDLR
KQVAPLLKSF	QGEIDALSKR	SKEAEAAFLN	VYKRLIDVPD	PVPALDLGQQ
LQLKVQRLHD	IETENQKLRE	TLEEYNKEFA	EVKNQEVTIK	ALKEKIREYE
QTLKNQAETI	ALEKEQKLQN	DFAEKERKLQ	ETQMSTTSKL	EEAEHKVQSL
QTALEKTRTE	LFDLKTKYDE	ETTAKADEIE	MIMTDLERAN	QRAEVAQREA
ETLREQLSSA	NHSLQLASQI	QKAPDVEQAI	EVLTRSSLEV	ELAAKEREIA
QLVEDVQRLQ	ASLTKLRENS	ASQISQLEQQ	LSAKNSTLKQ	LEEKLKGQAD
YEEVKKELNI	LKSMEFAPSE	GAGTQDAAKP	LEVLLLEKNR	SLQSENAALR
ISNSDLSGSA	RRKGKDQPES	RRPGSLPAPP	PSQLPRNPGE	QASNTNGTHQ
FSPAGLSQDF	FSSSLASPSL	PLASTGKFAL	NSLLQRQLMQ	SFYSKAMQEA
GSTSMIFSTG	PYSTNSISSQ	SPLQQSPDVN	GMAPSPSQSE	SAGSVSEGEE
MDTAEIARQV	KEQLIKHNIG	QRIFGHYVLG	LSQGSVSEIL	ARPKPWNKLT
VRGKEPFHKM	KQFLSDEQNI	LALRSIQGRQ	RENPGQSLNR	LFQEVPKRRN
GSEGNITTRI	RASETGSDEA	IKSILEQAKR	ELQVQKTAEP	AQPSSASGSG
NSDDAIRSIL	QQARREMEAQ	QAALDPALKQ	APLSQSDITI	LTPKLLSTSP
MPTVSSYPPL	AISLKKPSAA	PEAGASALPN	PPALKKEAQD	APGLDPQGAA
DCAQGVLRQV	KNEVGRSGAW	KDHWWSAVQP	ERRNAASSEE	AKAEETGGGK
EKGSGGSGGG	SQPRAERSQL	QGPSSSEYWK	EWPSAESPYS	QSSELSLTGA
SRSETPQNSP	LPSSPIVPMS	KPTKPSVPPL	TPEQYEVYMY	QEVDTIELTR
QVKEKLAKNG	ICQRIFGEKV	LGLSQGSVSD	MLSRPKPWSK	LTQKGREPFI
RMQLWLNGEL	GQGVLPVQGQ	QQGPVLHSVT	SLQDPLQQGC	VSSESTPKTS
ASCSPAPESP	MSSSESVKSL	TELVQQPCPP	IEASKDSKPP	EPSDPPASDS
QPTTPLPLSG	HSALSIQELV	AMSPELDTYG	ITKRVKEVLT	DNNLGQRLFG
ETILGLTQGS	VSDLLARPKP	WHKLSLKGRE	PFVRMQLWLN	DPNNVEKLMD
MKRMEKKAYM	KRRHSSVSDS	QPCEPPSVGT	EYSQGASPQP	QHQLKKPRVV
LAPEEKEALK	RAYQQKPYPS	PKTIEDLATQ	LNLKTSTVIN	WFHNYRSRIR
RELFIEEIQA	GSQGQAGASD	SPSARSGRAA	PSSEGDSCDG	VEATEGPGSA
DTEEPKSQGE	AEREEVPRPA	EQTEPPPSGT	PGPDDARDDD	HEGGPVEGPG
PLPSPASATA	TAAPAAPEDA	ATSAAAAPGE	GPAAPSSAPP	PSNSSSSSAP
RRPSSLQSLF	GLPEAAGARD	SRDNPLRKKK	AANLNSIIHR	LEKAASREEP
IEWEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Neufeld E.J., Skalnik D.G., Lievens P.M.-J., Orkin S.H. (1992). Human CCAAT displacement protein is homologous to the Drosophila homeoprotein, cut. Nat. Genet. 1: 50—55. PMID 1301999 DOI:10.1038/ng0492-50
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2557 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P39880 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма