TAF15 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук для людей: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | TAF15, Npl3, RBP56, TAF2N, TAFII68, TATA-box binding protein associated factor 15 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 601574 MGI: 1917689 HomoloGene: 131088 GeneCards: TAF15 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of signal transduction by p53 class mediator |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/9/90/PBB_GE_TAF15_202840_at_fs.png/250px-PBB_GE_TAF15_202840_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000270647 ENSG00000276833 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 35.81 – 35.86 Mb | Хр. 11: 83.47 – 83.51 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
TAF15 (англ. TATA-box binding protein associated factor 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 592 амінокислот, а молекулярна маса — 61 830[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSDSGSYGQS | | GGEQQSYSTY | | GNPGSQGYGQ | | ASQSYSGYGQ | | TTDSSYGQNY |
SGYSSYGQSQ | | SGYSQSYGGY | | ENQKQSSYSQ | | QPYNNQGQQQ | | NMESSGSQGG |
RAPSYDQPDY | | GQQDSYDQQS | | GYDQHQGSYD | | EQSNYDQQHD | | SYSQNQQSYH |
SQRENYSHHT | | QDDRRDVSRY | | GEDNRGYGGS | | QGGGRGRGGY | | DKDGRGPMTG |
SSGGDRGGFK | | NFGGHRDYGP | | RTDADSESDN | | SDNNTIFVQG | | LGEGVSTDQV |
GEFFKQIGII | | KTNKKTGKPM | | INLYTDKDTG | | KPKGEATVSF | | DDPPSAKAAI |
DWFDGKEFHG | | NIIKVSFATR | | RPEFMRGGGS | | GGGRRGRGGY | | RGRGGFQGRG |
GDPKSGDWVC | | PNPSCGNMNF | | ARRNSCNQCN | | EPRPEDSRPS | | GGDFRGRGYG |
GERGYRGRGG | | RGGDRGGYGG | | DRSGGGYGGD | | RSSGGGYSGD | | RSGGGYGGDR |
SGGGYGGDRG | | GGYGGDRGGG | | YGGDRGGGYG | | GDRGGYGGDR | | GGGYGGDRGG |
YGGDRGGYGG | | DRGGYGGDRG | | GYGGDRSRGG | | YGGDRGGGSG | | YGGDRSGGYG |
GDRSGGGYGG | | DRGGGYGGDR | | GGYGGKMGGR | | NDYRNDQRNR | | PY |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Morohoshi F., Arai K., Takahashi E., Tanigami A., Ohki M. (1996). Cloning and mapping of a human RBP56 gene encoding a putative RNA binding protein similar to FUS/TLS and EWS proteins. Genomics. 38: 51—57. PMID 8954779 DOI:10.1006/geno.1996.0591
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Zhang D., Paley A.J., Childs G. (1998). The transcriptional repressor ZFM1 interacts with and modulates the ability of EWS to activate transcription. J. Biol. Chem. 273: 18086—18091. PMID 9660765 DOI:10.1074/jbc.273.29.18086
- Jobert L., Argentini M., Tora L. (2009). PRMT1 mediated methylation of TAF15 is required for its positive gene regulatory function. Exp. Cell Res. 315: 1273—1286. PMID 19124016 DOI:10.1016/j.yexcr.2008.12.008
- Bertolotti A., Lutz Y., Heard D.J., Chambon P., Tora L. (1996). hTAF(II)68, a novel RNA/ssDNA-binding protein with homology to the pro-oncoproteins TLS/FUS and EWS is associated with both TFIID and RNA polymerase II. EMBO J. 15: 5022—5031. PMID 8890175
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11547 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q92804 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|