NEUROD1

NEUROD1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2QL2

Ідентифікатори
Символи NEUROD1, BETA2, BHF-1, MODY6, NEUROD, bHLHa3, neuronal differentiation 1, T2D
Зовнішні ІД OMIM: 601724 MGI: 1339708 HomoloGene: 1871 GeneCards: NEUROD1
Онтологія гена
Молекулярна функція

sequence-specific DNA binding
GO:0001105 transcription coactivator activity
DNA binding
protein dimerization activity
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
chromatin binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
E-box binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein heterodimerization activity
double-stranded DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
внутрішньоклітинний
нуклеоплазма
RNA polymerase II transcription regulator complex
клітинне ядро

Біологічний процес

positive regulation of transcription regulatory region DNA binding
regulation of neuron differentiation
Нейрогенез
диференціація клітин
cell fate commitment
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
pancreatic PP cell fate commitment
glucose homeostasis
regulation of insulin secretion
enteroendocrine cell differentiation
dentate gyrus development
signal transduction involved in regulation of gene expression
neuron development
insulin secretion
positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
response to glucose
transcription by RNA polymerase II
embryonic organ morphogenesis
cerebellum development
transcription, DNA-templated
нейробіологія розвитку
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
multicellular organism development
hindbrain development
nucleocytoplasmic transport
positive regulation of neuron differentiation
positive regulation of cell differentiation
nitric oxide mediated signal transduction
positive regulation of apoptotic process
regulation of intestinal epithelial structure maintenance
inner ear development
camera-type eye development
pancreatic A cell fate commitment
amacrine cell differentiation
negative regulation of type B pancreatic cell apoptotic process
cellular response to glucose stimulus
anterior/posterior pattern specification
endocrine pancreas development
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4760
18012
Ensembl
ENSG00000162992
ENSMUSG00000034701
UniProt
Q13562
Q60867
RefSeq (мРНК)
NM_002500
NM_010894
RefSeq (білок)
NP_002491
NP_035024
Локус (UCSC) Хр. 2: 181.67 – 181.68 Mb Хр. 2: 79.28 – 79.29 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NEUROD1 (англ. Neuronal differentiation 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 39 920[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTKSYSESGLMGEPQPQGPPSWTDECLSSQDEEHEADKKEDDLETMNAEE
DSLRNGGEEEDEDEDLEEEEEEEEEDDDQKPKRRGPKKKKMTKARLERFK
LRRMKANARERNRMHGLNAALDNLRKVVPCYSKTQKLSKIETLRLAKNYI
WALSEILRSGKSPDLVSFVQTLCKGLSQPTTNLVAGCLQLNPRTFLPEQN
QDMPPHLPTASASFPVHPYSYQSPGLPSPPYGTMDSSHVFHVKPPPHAYS
AALEPFFESPLTDCTSPSFDGPLSPPLSINGNFSFKHEPSAEFEKNYAFT
MHYPAATLAGAQSHGSIFSGTAAPRCEIPIDNIMSFDSHSHHERVMSAQL
NAIFHD

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, нейрогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Miyachi T., Maruyama H., Kitamura T., Nakamura S., Kawakami H. (1999). Structure and regulation of the human NeuroD (BETA2/BHF1) gene. Brain Res. Mol. Brain Res. 69: 223—231. PMID 10366743 DOI:10.1016/S0169-328X(99)00112-6
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Acharya H.R., Dooley C.M., Thoreson W.B., Ahmad I. (1997). cDNA cloning and expression analysis of NeuroD mRNA in human retina. Biochem. Biophys. Res. Commun. 233: 459—463. PMID 9144558 DOI:10.1006/bbrc.1997.6483
  • Ray S.K., Nishitani J., Petry M.W., Fessing M.Y., Leiter A.B. (2003). Novel transcriptional potentiation of BETA2/NeuroD on the secretin gene promoter by the DNA-binding protein Finb/RREB-1. Mol. Cell. Biol. 23: 259—271. PMID 12482979 DOI:10.1128/MCB.23.1.259-271.2003

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7762 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q13562 (англ.) . Архів оригіналу за 25 лютого 2018. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші