HTR3A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4PIR

Ідентифікатори

Символи

HTR3A, 5-HT-3, 5-HT3A, 5-HT3R, 5HT3R, HTR3, 5-hydroxytryptamine receptor 3A

Зовнішні ІД

OMIM: 182139 MGI: 96282 HomoloGene: 671 GeneCards: HTR3A

Реагує на сполуку

2-methyl-5-HT, Серотонін, 1-(3-chlorophenyl)biguanide, quipazine, алосетрон, azasetron, cilansetron, Кокаїн, метоклопрамід, ондансетрон, ramosetron, tubocurarine, вортіоксетин, bilobalide, дилтіазем, dolasetron, zimeldine, metoclopramide hydrochloride hydrate^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ligand-gated ion channel activity • serotonin binding • extracellular ligand-gated ion channel activity • serotonin-gated cation-selective channel activity • ion channel activity • transmembrane signaling receptor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • аксон • міжклітинні контакти • neuronal cell body • serotonin-activated cation-selective channel complex • Борозна розщеплення • glutamatergic synapse • integral component of postsynaptic membrane • integral component of presynaptic membrane • integral component of plasma membrane • neuron projection
Біологічний процес	• response to cocaine • cellular response to growth factor stimulus • ion transport • response to ethanol • positive regulation of ion transmembrane transporter activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ion transmembrane transport • serotonin receptor signaling pathway • chemical synaptic transmission • regulation of membrane potential • nervous system process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3359


15561

Ensembl


ENSG00000166736


ENSMUSG00000032269

UniProt


P46098


P23979

RefSeq (мРНК)


NM_000869 NM_001161772 NM_213621


NM_001099644 NM_013561

RefSeq (білок)


NP_000860 NP_001155244 NP_998786


NP_001093114 NP_038589

Локус (UCSC)

Хр. 11: 113.98 – 113.99 Mb

Хр. 9: 48.81 – 48.82 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

HTR3A (англ. 5-hydroxytryptamine receptor 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 55 280^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLWVQQALL	ALLLPTLLAQ	GEARRSRNTT	RPALLRLSDY	LLTNYRKGVR
PVRDWRKPTT	VSIDVIVYAI	LNVDEKNQVL	TTYIWYRQYW	TDEFLQWNPE
DFDNITKLSI	PTDSIWVPDI	LINEFVDVGK	SPNIPYVYIR	HQGEVQNYKP
LQVVTACSLD	IYNFPFDVQN	CSLTFTSWLH	TIQDINISLW	RLPEKVKSDR
SVFMNQGEWE	LLGVLPYFRE	FSMESSNYYA	EMKFYVVIRR	RPLFYVVSLL
LPSIFLMVMD	IVGFYLPPNS	GERVSFKITL	LLGYSVFLII	VSDTLPATAI
GTPLIGVYFV	VCMALLVISL	AETIFIVRLV	HKQDLQQPVP	AWLRHLVLER
IAWLLCLREQ	STSQRPPATS	QATKTDDCSA	MGNHCSHMGG	PQDFEKSPRD
RCSPPPPPRE	ASLAVCGLLQ	ELSSIRQFLE	KRDEIREVAR	DWLRVGSVLD
KLLFHIYLLA	VLAYSITLVM	LWSIWQYA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Bruess M., Goethert M., Hayer M., Bonisch H. (1998). Molecular cloning of alternatively spliced human 5HT3 receptor cDNAs. Ann. N. Y. Acad. Sci. 861: 234—235. PMID 9928262 DOI:10.1111/j.1749-6632.1998.tb10196.x
Bruess M., Eucker T., Goethert M., Bonisch H. (2000). Exon-intron organization of the human 5-HT3A receptor gene. Neuropharmacology. 39: 308—315. PMID 10670426 DOI:10.1016/S0028-3908(99)00116-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kelley S.P., Dunlop J.I., Kirkness E.F., Lambert J.J., Peters J.A. (2003). A cytoplasmic region determines single-channel conductance in 5-HT3 receptors. Nature. 424: 321—324. PMID 12867984 DOI:10.1038/nature01788
Cheng A., McDonald N.A., Connolly C.N. (2005). Cell surface expression of 5-hydroxytryptamine type 3 receptors is promoted by RIC-3. J. Biol. Chem. 280: 22502—22507. PMID 15809299 DOI:10.1074/jbc.M414341200
Miyake A., Mochizuki S., Takemoto Y., Akuzawa S. (1995). Molecular cloning of human 5-hydroxytryptamine3 receptor: heterogeneity in distribution and function among species. Mol. Pharmacol. 48: 407—416. PMID 7565620

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з 5-hydroxytryptamine receptor 3A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5297 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P46098 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Ліганд-залежні іонні канали

Cys-петельні

Серотонін	5-HT₃ A B C D E

ГАМК	ГАМК_А α₁ α₂ α₃ α₄ α₅ α₆ β₁ β₂ β₃ γ₁ γ₂ γ₃ δ ε π θ ГАМК_А-ρ ρ₁ ρ₂ ρ₃

Гліцин	α₁ α₂ α₃ α₄ β

Нікотин ацетилхолін	мономери: α1 α2 α3 α4 α5 α6 α7 α9 α10 β1 β2 β3 β4 δ ε пентамери: (α3)₂(β4)₃ (α4)₂(β2)₃ (α7)₅ (α1)₂(β4)₃ (α1)₂β1δε

Цинк	ZACN

Іонотропні глутаматні

Тільки ліганд-залежні	AMPA (1 2 3 4) Каїнат 1 2 3 4 5

Потенціал- та ліганд-залежні	NMDA 1 2A 2B 2C 2D 3A 3B L1A L1B

Орфанні	GluD δ₁ δ₂