GABRD

GABRD
Ідентифікатори
Символи GABRD, EIG10, EJM7, GEFSP5, gamma-aminobutyric acid type A receptor delta subunit, gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit delta
Зовнішні ІД OMIM: 137163 MGI: 95622 HomoloGene: 55489 GeneCards: GABRD
Пов'язані генетичні захворювання
generalized epilepsy with febrile seizures plus[1]
Реагує на сполуку
gaboxadol, picrotoxin, metharbital, triclofos, butalbital, хлордіазепоксид, діазепам, prazepam, топірамат, clotiazepam, allopregnanolone, chlordiazepoxide hydrochloride, clorazepate dipotassium, methohexital sodium, pentobarbital sodium[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001948, GO:0016582 protein binding
chloride channel activity
extracellular ligand-gated ion channel activity
GABA-A receptor activity
ion channel activity
transmembrane signaling receptor activity
transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential

Клітинна компонента

chloride channel complex
integral component of membrane
міжклітинні контакти
GABA-A receptor complex
postsynaptic membrane
клітинна мембрана
синапс
integral component of plasma membrane
мембрана
glutamatergic synapse
GABA-ergic synapse
integral component of postsynaptic membrane
neuron projection

Біологічний процес

ion transmembrane transport
chloride transport
chloride transmembrane transport
ion transport
chemical synaptic transmission
GO:0072468 сигнальна трансдукція
regulation of membrane potential
nervous system process
regulation of postsynaptic membrane potential

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2563
14403
Ensembl
ENSG00000187730
ENSMUSG00000029054
UniProt
O14764
P22933
RefSeq (мРНК)
NM_000815
NM_008072
RefSeq (білок)
NP_000806
NP_032098
Локус (UCSC) Хр. 1: 2.02 – 2.03 Mb Хр. 4: 155.47 – 155.48 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GABRD (англ. Gamma-aminobutyric acid type A receptor delta subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот, а молекулярна маса — 50 708[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDAPARLLAPLLLLCAQQLRGTRAMNDIGDYVGSNLEISWLPNLDGLIAG
YARNFRPGIGGPPVNVALALEVASIDHISEANMEYTMTVFLHQSWRDSRL
SYNHTNETLGLDSRFVDKLWLPDTFIVNAKSAWFHDVTVENKLIRLQPDG
VILYSIRITSTVACDMDLAKYPMDEQECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQ
EHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKSAGQFPRLSLHFHLRRNRGVY
IIQSYMPSVLLVAMSWVSFWISQAAVPARVSLGITTVLTMTTLMVSARSS
LPRASAIKALDVYFWICYVFVFAALVEYAFAHFNADYRKKQKAKVKVSRP
RAEMDVRNAIVLFSLSAAGVTQELAISRRQRRVPGNLMGSYRSVGVETGE
TKKEGAARSGGQGGIRARLRPIDADTIDIYARAVFPAAFAAVNVIYWAAY
AM

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з GABRD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit delta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4084 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
  6. UniProt, O14764 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Cys-петельні
Серотонін
ГАМК
  • ГАМКА
    • α1
    • α2
    • α3
    • α4
    • α5
    • α6
    • β1
    • β2
    • β3
    • γ1
    • γ2
    • γ3
    • δ
    • ε
    • π
    • θ
  • ГАМКА
    • ρ1
    • ρ2
    • ρ3
Гліцин
  • α1
  • α2
  • α3
  • α4
  • β
Нікотин ацетилхолін
  • пентамери: (α3)2(β4)3
  • (α4)2(β2)3
  • (α7)5
  • (α1)2(β4)3
  • (α1)2β1δε
Цинк
Іонотропні глутаматні
Тільки ліганд-залежні
Потенціал- та ліганд-залежні
Орфанні
  • GluD
    • δ1
    • δ2
АТФ-залежні
Пуринові рецептори