| CHRNA7 |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 5AFK, 5AFJ, 5AFL, 2MAW, 5AFN, 5AFM, 5AFH | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | CHRNA7, CHRNA7-2, NACHRA7, cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 118511 MGI: 99779 HomoloGene: 593 GeneCards: CHRNA7 |
|---|
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| encenicline, PNU-120596, mecamylamine, AZD0328, encenicline[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • protein homodimerization activity
• acetylcholine binding
• acetylcholine-gated cation-selective channel activity
• amyloid-beta binding
• acetylcholine receptor activity
• ion channel activity
• chloride channel regulator activity
• extracellular ligand-gated ion channel activity
• toxic substance binding
• ligand-gated ion channel activity
• transmembrane signaling receptor activity
• calcium channel activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• acetylcholine-gated channel complex
• postsynaptic membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• синапс
• міжклітинні контакти
• integral component of plasma membrane
• neuron projection
• plasma membrane raft
• postsynapse
|
|---|
| Біологічний процес | • response to hypoxia
• когнітивність
• cellular calcium ion homeostasis
• ion transport
• positive regulation of angiogenesis
• ion transmembrane transport
• positive regulation of cell population proliferation
• GO:0015915 транспорт
• calcium ion transport
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• synaptic transmission, cholinergic
• пам'ять
• negative regulation of tumor necrosis factor production
• response to nicotine
• regulation of postsynaptic membrane potential
• excitatory postsynaptic potential
• positive regulation of protein phosphorylation
• chemical synaptic transmission
• learning or memory
• короткочасна пам'ять
• regulation of membrane potential
• synapse organization
• nervous system process
• sensory processing
• positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
• calcium ion transmembrane transport
• acetylcholine receptor signaling pathway
• dendritic spine organization
• modulation of excitatory postsynaptic potential
• dendrite arborization
• positive regulation of long-term synaptic potentiation
• regulation of neuron death
• positive regulation of amyloid-beta formation
• negative regulation of amyloid-beta formation
• regulation of amyloid precursor protein catabolic process
• response to amyloid-beta
• response to acetylcholine
• regulation of amyloid fibril formation
• positive regulation of CoA-transferase activity
• positive regulation of excitatory postsynaptic potential
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | ENSG00000274542
ENSG00000175344
ENSG00000282088 |
| |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | |
|---|
| RefSeq (білок) | | |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 15: 31.92 – 32.17 Mb | Хр. 7: 62.75 – 62.86 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHRNA7 (англ. CHRNA7 (exons 5-10) and FAM7A (exons A-E) fusion) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 502 амінокислот, а молекулярна маса — 56 449[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MRCSPGGVWL | | ALAASLLHVS | | LQGEFQRKLY | | KELVKNYNPL | | ERPVANDSQP |
| LTVYFSLSLL | | QIMDVDEKNQ | | VLTTNIWLQM | | SWTDHYLQWN | | VSEYPGVKTV |
| RFPDGQIWKP | | DILLYNSADE | | RFDATFHTNV | | LVNSSGHCQY | | LPPGIFKSSC |
| YIDVRWFPFD | | VQHCKLKFGS | | WSYGGWSLDL | | QMQEADISGY | | IPNGEWDLVG |
| IPGKRSERFY | | ECCKEPYPDV | | TFTVTMRRRT | | LYYGLNLLIP | | CVLISALALL |
| VFLLPADSGE | | KISLGITVLL | | SLTVFMLLVA | | EIMPATSDSV | | PLIAQYFAST |
| MIIVGLSVVV | | TVIVLQYHHH | | DPDGGKMPKW | | TRVILLNWCA | | WFLRMKRPGE |
| DKVRPACQHK | | QRRCSLASVE | | MSAVAPPPAS | | NGNLLYIGFR | | GLDGVHCVPT |
| PDSGVVCGRM | | ACSPTHDEHL | | LHGGQPPEGD | | PDLAKILEEV | | RYIANRFRCQ |
| DESEAVCSEW | | KFAACVVDRL | | CLMAFSVFTI | | ICTIGILMSA | | PNFVEAVSKD |
| FA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Riley B., Williamson M., Collier D., Wilkie H., Makoff A. (2002). A 3-Mb map of a large segmental duplication overlapping the alpha7-nicotinic acetylcholine receptor gene (CHRNA7) at human 15q13-q14. Genomics. 79: 197—209. PMID 11829490 DOI:10.1006/geno.2002.6694
- Peng X., Katz M., Gerzanich V., Anand R., Lindstrom J. (1994). Human alpha 7 acetylcholine receptor: cloning of the alpha 7 subunit from the SH-SY5Y cell line and determination of pharmacological properties of native receptors and functional alpha 7 homomers expressed in Xenopus oocytes. Mol. Pharmacol. 45: 546—554. PMID 8145738
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1960 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P36544 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
