| GLRB |
|---|
 |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | GLRB, HKPX2, glycine receptor beta |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 138492 MGI: 95751 HomoloGene: 20224 GeneCards: GLRB |
|---|
| |
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| hyperekplexia 2[1] |
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| bilobalide, ніфедипін, pregnenolone sulfate, picrotoxin[2] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • glycine binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• extracellularly glycine-gated ion channel activity
• chloride channel activity
• extracellular ligand-gated ion channel activity
• extracellularly glycine-gated chloride channel activity
• ion channel activity
• transmembrane signaling receptor activity
• transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• integral component of membrane
• postsynaptic membrane
• cell projection
• мембрана
• синапс
• chloride channel complex
• glycine-gated chloride channel complex
• міжклітинні контакти
• дендрит (нейробіологія)
• integral component of plasma membrane
• клітинна мембрана
• GABA-ergic synapse
• glycinergic synapse
• neuron projection
|
|---|
| Біологічний процес | • response to amino acid
• переляк
• protein heterooligomerization
• regulation of membrane potential
• gamma-aminobutyric acid receptor clustering
• chloride transmembrane transport
• нейробіологія розвитку
• акросомна реакція
• neuromuscular process
• righting reflex
• chloride transport
• neuropeptide signaling pathway
• зір
• adult walking behavior
• ion transport
• synaptic transmission, glycinergic
• excitatory postsynaptic potential
• chemical synaptic transmission
• ion transmembrane transport
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• nervous system process
• regulation of postsynaptic membrane potential
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_000824
NM_001166060
NM_001166061 |
| NM_001281969
NM_010298
NM_001345955
NM_001345956
NM_001345957
| NM_001345958
NM_001345959
NM_001345996 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_000815
NP_001159532
NP_001159533 |
| NP_001268898
NP_001332884
NP_001332885
NP_001332886
NP_001332887
| NP_001332888
NP_001332925
NP_034428 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 4: 157.08 – 157.17 Mb | Хр. 3: 80.75 – 80.82 Mb |
|---|
| PubMed search | [3] | [4] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GLRB (англ. Glycine receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 56 122[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MKFLLTTAFL | | ILISLWVEEA | | YSKEKSSKKG | | KGKKKQYLCP | | SQQSAEDLAR |
| VPANSTSNIL | | NRLLVSYDPR | | IRPNFKGIPV | | DVVVNIFINS | | FGSIQETTMD |
| YRVNIFLRQK | | WNDPRLKLPS | | DFRGSDALTV | | DPTMYKCLWK | | PDLFFANEKS |
| ANFHDVTQEN | | ILLFIFRDGD | | VLVSMRLSIT | | LSCPLDLTLF | | PMDTQRCKMQ |
| LESFGYTTDD | | LRFIWQSGDP | | VQLEKIALPQ | | FDIKKEDIEY | | GNCTKYYKGT |
| GYYTCVEVIF | | TLRRQVGFYM | | MGVYAPTLLI | | VVLSWLSFWI | | NPDASAARVP |
| LGIFSVLSLA | | SECTTLAAEL | | PKVSYVKALD | | VWLIACLLFG | | FASLVEYAVV |
| QVMLNNPKRV | | EAEKARIAKA | | EQADGKGGNV | | AKKNTVNGTG | | TPVHISTLQV |
| GETRCKKVCT | | SKSDLRSNDF | | SIVGSLPRDF | | ELSNYDCYGK | | PIEVNNGLGK |
| SQAKNNKKPP | | PAKPVIPTAA | | KRIDLYARAL | | FPFCFLFFNV | | IYWSIYL |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Miller P.S., Harvey R.J., Smart T.G. (2004). Differential agonist sensitivity of glycine receptor alpha2 subunit splice variants. Br. J. Pharmacol. 143: 19—26. PMID 15302677 DOI:10.1038/sj.bjp.0705875
- Miller P.S., Da Silva H.M., Smart T.G. (2005). Molecular basis for zinc potentiation at strychnine-sensitive glycine receptors. J. Biol. Chem. 280: 37877—37884. PMID 16144831 DOI:10.1074/jbc.M508303200
- Yang Z., Taran E., Webb T.I., Lynch J.W. (2012). Stoichiometry and subunit arrangement of alpha1beta glycine receptors as determined by atomic force microscopy. Biochemistry. 51: 5229—5231. PMID 22715885 DOI:10.1021/bi300063m
- Zhang Y., Dixon C.L., Keramidas A., Lynch J.W. (2015). Functional reconstitution of glycinergic synapses incorporating defined glycine receptor subunit combinations. Neuropharmacology. 89: 391—397. PMID 25445488 DOI:10.1016/j.neuropharm.2014.10.026
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з GLRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Glycine receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4329 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P48167 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
