| GRIK2 |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 3QXM, 5CMM | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | GRIK2, EAA4, GLR6, GLUK6, GLUR6, GluK2, MRT6, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2, NEDLAS |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 138244 MGI: 95815 HomoloGene: 40717 GeneCards: GRIK2 |
|---|
| |
| Реагує на сполуку |
|---|
| selurampanel, топірамат[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • glutamate receptor activity
• PDZ domain binding
• kainate selective glutamate receptor activity
• protein homodimerization activity
• ion channel activity
• ionotropic glutamate receptor activity
• identical protein binding
• ligand-gated ion channel activity
• extracellularly glutamate-gated ion channel activity
• signaling receptor activity
• ubiquitin conjugating enzyme binding
• ubiquitin protein ligase binding
• ligand-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential
• transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
|
|---|
| Клітинна компонента | • integral component of membrane
• перикаріон
• postsynaptic membrane
• мембрана
• клітинна мембрана
• синапс
• integral component of plasma membrane
• міжклітинні контакти
• terminal bouton
• аксон
• дендрит (нейробіологія)
• dendrite cytoplasm
• ionotropic glutamate receptor complex
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• kainate selective glutamate receptor complex
• presynaptic membrane
• neuronal cell body
• hippocampal mossy fiber to CA3 synapse
• glutamatergic synapse
|
|---|
| Біологічний процес | • neuron apoptotic process
• glutamate receptor signaling pathway
• modulation of chemical synaptic transmission
• ion transport
• receptor clustering
• ion transmembrane transport
• positive regulation of neuron apoptotic process
• regulation of JNK cascade
• ionotropic glutamate receptor signaling pathway
• positive regulation of synaptic transmission
• excitatory postsynaptic potential
• negative regulation of synaptic transmission, glutamatergic
• chemical synaptic transmission
• behavioral fear response
• cellular calcium ion homeostasis
• intracellular protein transport
• neuronal action potential
• synaptic transmission, glutamatergic
• regulation of membrane potential
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process
• regulation of long-term neuronal synaptic plasticity
• regulation of short-term neuronal synaptic plasticity
• Гальмівний постсинаптичний потенціал
• regulation of presynaptic membrane potential
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_001166247
NM_021956
NM_175768 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001159719
NP_068775
NP_786944 |
| | NP_001104738
NP_034479
NP_001345795 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 6: 100.96 – 102.08 Mb | Хр. 10: 49.09 – 49.79 Mb |
|---|
| PubMed search | [2] | [3] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
GRIK2 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 908 амінокислот, а молекулярна маса — 102 583[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MKIIFPILSN | | PVFRRTVKLL | | LCLLWIGYSQ | | GTTHVLRFGG | | IFEYVESGPM |
| GAEELAFRFA | | VNTINRNRTL | | LPNTTLTYDT | | QKINLYDSFE | | ASKKACDQLS |
| LGVAAIFGPS | | HSSSANAVQS | | ICNALGVPHI | | QTRWKHQVSD | | NKDSFYVSLY |
| PDFSSLSRAI | | LDLVQFFKWK | | TVTVVYDDST | | GLIRLQELIK | | APSRYNLRLK |
| IRQLPADTKD | | AKPLLKEMKR | | GKEFHVIFDC | | SHEMAAGILK | | QALAMGMMTE |
| YYHYIFTTLD | | LFALDVEPYR | | YSGVNMTGFR | | ILNTENTQVS | | SIIEKWSMER |
| LQAPPKPDSG | | LLDGFMTTDA | | ALMYDAVHVV | | SVAVQQFPQM | | TVSSLQCNRH |
| KPWRFGTRFM | | SLIKEAHWEG | | LTGRITFNKT | | NGLRTDFDLD | | VISLKEEGLE |
| KIGTWDPASG | | LNMTESQKGK | | PANITDSLSN | | RSLIVTTILE | | EPYVLFKKSD |
| KPLYGNDRFE | | GYCIDLLREL | | STILGFTYEI | | RLVEDGKYGA | | QDDANGQWNG |
| MVRELIDHKA | | DLAVAPLAIT | | YVREKVIDFS | | KPFMTLGISI | | LYRKPNGTNP |
| GVFSFLNPLS | | PDIWMYILLA | | YLGVSCVLFV | | IARFSPYEWY | | NPHPCNPDSD |
| VVENNFTLLN | | SFWFGVGALM | | QQGSELMPKA | | LSTRIVGGIW | | WFFTLIIISS |
| YTANLAAFLT | | VERMESPIDS | | ADDLAKQTKI | | EYGAVEDGAT | | MTFFKKSKIS |
| TYDKMWAFMS | | SRRQSVLVKS | | NEEGIQRVLT | | SDYAFLMEST | | TIEFVTQRNC |
| NLTQIGGLID | | SKGYGVGTPM | | GSPYRDKITI | | AILQLQEEGK | | LHMMKEKWWR |
| GNGCPEEESK | | EASALGVQNI | | GGIFIVLAAG | | LVLSVFVAVG | | EFLYKSKKNA |
| QLEKRSFCSA | | MVEELRMSLK | | CQRRLKHKPQ | | APVIVKTEEV | | INMHTFNDRR |
| LPGKETMA |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Paschen W., Blackstone C.D., Huganir R.L., Ross C.A. (1994). Human GluR6 kainate receptor (GRIK2): molecular cloning, expression, polymorphism, and chromosomal assignment. Genomics. 20: 435—440. PMID 8034316 DOI:10.1006/geno.1994.1198
- Barbon A., Vallini I., Barlati S. (2001). Genomic organization of the human GRIK2 gene and characterization of multiple splicing variants. Gene. 274: 187—197. PMID 11675011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00611-4
- Wilkinson K.A., Konopacki F., Henley J.M. (2012). Modification and movement: Phosphorylation and SUMOylation regulate endocytosis of GluK2-containing kainate receptors. Commun. Integr. Biol. 5: 223—226. PMID 22808340 DOI:10.4161/cib.19195
- Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue. J. Neurochem. 63: 1596—1602. PMID 7523595
- Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits. NeuroReport. 5: 2625—2629. PMID 7696618
Примітки
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4580 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q13002 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
