CHRNA4

CHRNA4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2LLY

Ідентифікатори
Символи CHRNA4, BFNC, EBN, EBN1, NACHR, NACHRA4, NACRA4, cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit
Зовнішні ІД OMIM: 118504 MGI: 87888 HomoloGene: 592 GeneCards: CHRNA4
Пов'язані генетичні захворювання
epilepsy, nocturnal frontal lobe[1]
Реагує на сполуку
rivanicline, hexamethonium, mecamylamine[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

acetylcholine binding
acetylcholine receptor activity
ion channel activity
ligand-gated ion channel activity
extracellular ligand-gated ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
acetylcholine-gated cation-selective channel activity
transmembrane signaling receptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
acetylcholine-gated channel complex
postsynaptic membrane
мембрана
клітинна мембрана
синапс
міжклітинні контакти
neuronal cell body
дендрит (нейробіологія)
external side of plasma membrane
dopaminergic synapse
integral component of presynaptic membrane
integral component of plasma membrane
neuron projection

Біологічний процес

regulation of dopamine secretion
Гальмівний постсинаптичний потенціал
response to hypoxia
когнітивність
locomotory behavior
regulation of membrane potential
response to nicotine
membrane depolarization
nervous system process
synaptic transmission, cholinergic
ion transport
GO:0001306 response to oxidative stress
respiratory gaseous exchange by respiratory system
behavioral response to nicotine
B cell activation
neuromuscular synaptic transmission
exploration behavior
потенціал дії
sensory perception of pain
GO:0100026 Репарація ДНК
calcium ion transport
GO:0072468 сигнальна трансдукція
chemical synaptic transmission
excitatory postsynaptic potential
acetylcholine receptor signaling pathway
ion transmembrane transport
regulation of synaptic vesicle exocytosis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1137
11438
Ensembl
ENSG00000101204
ENSMUSG00000027577
UniProt
P43681
O70174
RefSeq (мРНК)
NM_000744
NM_001256573
NM_015730
RefSeq (білок)
NP_000735
NP_001243502
NP_056545
Локус (UCSC) Хр. 20: 63.34 – 63.38 Mb Хр. 2: 180.66 – 180.69 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CHRNA4 (англ. Cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 627 амінокислот, а молекулярна маса — 69 957[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MELGGPGAPRLLPPLLLLLGTGLLRASSHVETRAHAEERLLKKLFSGYNK
WSRPVANISDVVLVRFGLSIAQLIDVDEKNQMMTTNVWVKQEWHDYKLRW
DPADYENVTSIRIPSELIWRPDIVLYNNADGDFAVTHLTKAHLFHDGRVQ
WTPPAIYKSSCSIDVTFFPFDQQNCTMKFGSWTYDKAKIDLVNMHSRVDQ
LDFWESGEWVIVDAVGTYNTRKYECCAEIYPDITYAFVIRRLPLFYTINL
IIPCLLISCLTVLVFYLPSECGEKITLCISVLLSLTVFLLLITEIIPSTS
LVIPLIGEYLLFTMIFVTLSIVITVFVLNVHHRSPRTHTMPTWVRRVFLD
IVPRLLLMKRPSVVKDNCRRLIESMHKMASAPRFWPEPEGEPPATSGTQS
LHPPSPSFCVPLDVPAEPGPSCKSPSDQLPPQQPLEAEKASPHPSPGPCR
PPHGTQAPGLAKARSLSVQHMSSPGEAVEGGVRCRSRSIQYCVPRDDAAP
EADGQAAGALASRNTHSAELPPPDQPSPCKCTCKKEPSSVSPSATVKTRS
TKAPPPHLPLSPALTRAVEGVQYIADHLKAEDTDFSVKEDWKYVAMVIDR
IFLWMFIIVCLLGTVGLFLPPWLAGMI

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • Steinlein O.K., Weiland S., Stood J., Propping P. (1996). Exon-intron structure of the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha 4 subunit (CHRNA4). Genomics. 32: 289—294. PMID 8833159 DOI:10.1006/geno.1996.0119
  • Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CHRNA4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1958 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  6. UniProt, P43681 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 20
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Cys-петельні
Серотонін
ГАМК
  • ГАМКА
    • α1
    • α2
    • α3
    • α4
    • α5
    • α6
    • β1
    • β2
    • β3
    • γ1
    • γ2
    • γ3
    • δ
    • ε
    • π
    • θ
  • ГАМКА
    • ρ1
    • ρ2
    • ρ3
Гліцин
  • α1
  • α2
  • α3
  • α4
  • β
Нікотин ацетилхолін
  • пентамери: (α3)2(β4)3
  • (α4)2(β2)3
  • (α7)5
  • (α1)2(β4)3
  • (α1)2β1δε
Цинк
Іонотропні глутаматні
Тільки ліганд-залежні
Потенціал- та ліганд-залежні
Орфанні
  • GluD
    • δ1
    • δ2
АТФ-залежні
Пуринові рецептори