CHRNA4 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | CHRNA4, BFNC, EBN, EBN1, NACHR, NACHRA4, NACRA4, cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 118504 MGI: 87888 HomoloGene: 592 GeneCards: CHRNA4 |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
epilepsy, nocturnal frontal lobe[1] |
|
Реагує на сполуку |
---|
rivanicline, hexamethonium, mecamylamine[2] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • acetylcholine binding • acetylcholine receptor activity • ion channel activity • ligand-gated ion channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • acetylcholine-gated cation-selective channel activity • transmembrane signaling receptor activity |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • acetylcholine-gated channel complex • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • міжклітинні контакти • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • external side of plasma membrane • dopaminergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of plasma membrane • neuron projection |
---|
Біологічний процес | • regulation of dopamine secretion • Гальмівний постсинаптичний потенціал • response to hypoxia • когнітивність • locomotory behavior • regulation of membrane potential • response to nicotine • membrane depolarization • nervous system process • synaptic transmission, cholinergic • ion transport • GO:0001306 response to oxidative stress • respiratory gaseous exchange by respiratory system • behavioral response to nicotine • B cell activation • neuromuscular synaptic transmission • exploration behavior • потенціал дії • sensory perception of pain • GO:0100026 Репарація ДНК • calcium ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chemical synaptic transmission • excitatory postsynaptic potential • acetylcholine receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • regulation of synaptic vesicle exocytosis |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 63.34 – 63.38 Mb | Хр. 2: 180.66 – 180.69 Mb |
---|
PubMed search | [3] | [4] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
CHRNA4 (англ. Cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 627 амінокислот, а молекулярна маса — 69 957[6].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MELGGPGAPR | | LLPPLLLLLG | | TGLLRASSHV | | ETRAHAEERL | | LKKLFSGYNK |
WSRPVANISD | | VVLVRFGLSI | | AQLIDVDEKN | | QMMTTNVWVK | | QEWHDYKLRW |
DPADYENVTS | | IRIPSELIWR | | PDIVLYNNAD | | GDFAVTHLTK | | AHLFHDGRVQ |
WTPPAIYKSS | | CSIDVTFFPF | | DQQNCTMKFG | | SWTYDKAKID | | LVNMHSRVDQ |
LDFWESGEWV | | IVDAVGTYNT | | RKYECCAEIY | | PDITYAFVIR | | RLPLFYTINL |
IIPCLLISCL | | TVLVFYLPSE | | CGEKITLCIS | | VLLSLTVFLL | | LITEIIPSTS |
LVIPLIGEYL | | LFTMIFVTLS | | IVITVFVLNV | | HHRSPRTHTM | | PTWVRRVFLD |
IVPRLLLMKR | | PSVVKDNCRR | | LIESMHKMAS | | APRFWPEPEG | | EPPATSGTQS |
LHPPSPSFCV | | PLDVPAEPGP | | SCKSPSDQLP | | PQQPLEAEKA | | SPHPSPGPCR |
PPHGTQAPGL | | AKARSLSVQH | | MSSPGEAVEG | | GVRCRSRSIQ | | YCVPRDDAAP |
EADGQAAGAL | | ASRNTHSAEL | | PPPDQPSPCK | | CTCKKEPSSV | | SPSATVKTRS |
TKAPPPHLPL | | SPALTRAVEG | | VQYIADHLKA | | EDTDFSVKED | | WKYVAMVIDR |
IFLWMFIIVC | | LLGTVGLFLP | | PWLAGMI |
Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.
Література
- Steinlein O.K., Weiland S., Stood J., Propping P. (1996). Exon-intron structure of the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha 4 subunit (CHRNA4). Genomics. 32: 289—294. PMID 8833159 DOI:10.1006/geno.1996.0119
- Groot Kormelink P.J., Luyten W.H.M.L. (1997). Cloning and sequence of full-length cDNAs encoding the human neuronal nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) subunits beta3 and beta4 and expression of seven nAChR subunits in the human neuroblastoma cell line SH-SY5Y and/or IMR-32. FEBS Lett. 400: 309—314. PMID 9009220 DOI:10.1016/S0014-5793(96)01383-X
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з CHRNA4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1958 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P43681 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |