GRIK1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2ZNS, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3

Ідентифікатори

Символи

GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1

Зовнішні ІД

OMIM: 138245 MGI: 95814 HomoloGene: 68992 GeneCards: GRIK1

Пов'язані генетичні захворювання

періодонтит, гепатоцелюлярна карцинома, рак молочної залози^[1]

Реагує на сполуку

Iodo-Willardiine, ACET (речовина), UBP310, dasolampanel, selurampanel, топірамат^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• ion channel activity • kainate selective glutamate receptor activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • ionotropic glutamate receptor activity • ligand-gated ion channel activity • signaling receptor activity • glutamate receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential
Клітинна компонента	• integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • postsynaptic membrane • integral component of plasma membrane • синапс • мембрана • kainate selective glutamate receptor complex • presynaptic membrane
Біологічний процес	• glutamate receptor signaling pathway • central nervous system development • ion transmembrane transport • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • ion transport • нейробіологія розвитку • chemical synaptic transmission • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • excitatory postsynaptic potential • synaptic transmission, glutamatergic • modulation of chemical synaptic transmission • regulation of postsynaptic membrane potential
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2897


14805

Ensembl


ENSG00000171189


ENSMUSG00000022935

UniProt


P39086


Q60934

RefSeq (мРНК)

NM_000830 NM_175611 NM_001320616 NM_001320618 NM_001320621
NM_001320630 NM_001330993 NM_001330994 NM_001393424 NM_001393425 NM_001393426


NM_010348 NM_146072 NM_001346964

RefSeq (білок)

NP_000821 NP_001307545 NP_001307547 NP_001307550 NP_001307559
NP_001317922 NP_001317923 NP_783300


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 21: 29.54 – 29.94 Mb

Хр. 16: 87.69 – 88.09 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GRIK1 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 918 амінокислот, а молекулярна маса — 103 981^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEHGTLLAQP	GLWTRDTSWA	LLYFLCYILP	QTAPQVLRIG	GIFETVENEP
VNVEELAFKF	AVTSINRNRT	LMPNTTLTYD	IQRINLFDSF	EASRRACDQL
ALGVAALFGP	SHSSSVSAVQ	SICNALEVPH	IQTRWKHPSV	DNKDLFYINL
YPDYAAISRA	ILDLVLYYNW	KTVTVVYEDS	TGLIRLQELI	KAPSRYNIKI
KIRQLPSGNK	DAKPLLKEMK	KGKEFYVIFD	CSHETAAEIL	KQILFMGMMT
EYYHYFFTTL	DLFALDLELY	RYSGVNMTGF	RLLNIDNPHV	SSIIEKWSME
RLQAPPRPET	GLLDGMMTTE	AALMYDAVYM	VAIASHRASQ	LTVSSLQCHR
HKPWRLGPRF	MNLIKEARWD	GLTGHITFNK	TNGLRKDFDL	DIISLKEEGT
EKAAGEVSKH	LYKVWKKIGI	WNSNSGLNMT	DSNKDKSSNI	TDSLANRTLI
VTTILEEPYV	MYRKSDKPLY	GNDRFEGYCL	DLLKELSNIL	GFIYDVKLVP
DGKYGAQNDK	GEWNGMVKEL	IDHRADLAVA	PLTITYVREK	VIDFSKPFMT
LGISILYRKP	NGTNPGVFSF	LNPLSPDIWM	YVLLACLGVS	CVLFVIARFT
PYEWYNPHPC	NPDSDVVENN	FTLLNSFWFG	VGALMQQGSE	LMPKALSTRI
VGGIWWFFTL	IIISSYTANL	AAFLTVERME	SPIDSADDLA	KQTKIEYGAV
RDGSTMTFFK	KSKISTYEKM	WAFMSSRQQT	ALVRNSDEGI	QRVLTTDYAL
LMESTSIEYV	TQRNCNLTQI	GGLIDSKGYG	VGTPIGSPYR	DKITIAILQL
QEEGKLHMMK	EKWWRGNGCP	EEDNKEASAL	GVENIGGIFI	VLAAGLVLSV
FVAIGEFIYK	SRKNNDIEQA	FCFFYGLQCK	QTHPTNSTSG	TTLSTDLECG
KLIREERGIR	KQSSVHTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Gregor P., O'Hara B.F., Yang X., Uhl G.R. (1993). Expression and novel subunit isoforms of glutamate receptor genes GluR5 and GluR6. NeuroReport. 4: 1343—1346. PMID 8260617
Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits. NeuroReport. 5: 2625—2629. PMID 7696618

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GRIK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4579 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P39086 (англ.) . Архів оригіналу за 3 січня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Ліганд-залежні іонні канали

Cys-петельні

Серотонін	5-HT₃ A B C D E

ГАМК	ГАМК_А α₁ α₂ α₃ α₄ α₅ α₆ β₁ β₂ β₃ γ₁ γ₂ γ₃ δ ε π θ ГАМК_А-ρ ρ₁ ρ₂ ρ₃

Гліцин	α₁ α₂ α₃ α₄ β

Нікотин ацетилхолін	мономери: α1 α2 α3 α4 α5 α6 α7 α9 α10 β1 β2 β3 β4 δ ε пентамери: (α3)₂(β4)₃ (α4)₂(β2)₃ (α7)₅ (α1)₂(β4)₃ (α1)₂β1δε

Цинк	ZACN

Іонотропні глутаматні

Тільки ліганд-залежні	AMPA (1 2 3 4) Каїнат 1 2 3 4 5

Потенціал- та ліганд-залежні	NMDA 1 2A 2B 2C 2D 3A 3B L1A L1B

Орфанні	GluD δ₁ δ₂