GRIN2D

GRIN2D
Ідентифікатори
Символи GRIN2D, EB11, GluN2D, NMDAR2D, NR2D, glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2D, EIEE46, DEE46
Зовнішні ІД OMIM: 602717 MGI: 95823 HomoloGene: 648 GeneCards: GRIN2D
Реагує на сполуку
Гліцин, Аспарагінова кислота, homoquinolinic acid, Tetrazolylglycine, N-метил-D-аспартат, 5,7-dichlorokynurenic acid, d-CCPene, selfotel, амантадин, dizocilpine, кетамін, фенциклідин, lanicemine, neboglamine, priralfinamide, esketamine, кетамін, cns-5161, ketamine hydrochloride, amantadine hydrochloride, orphenadrine citrate[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

ion channel activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
extracellularly glutamate-gated ion channel activity
ionotropic glutamate receptor activity
NMDA glutamate receptor activity
glutamate-gated calcium ion channel activity
signaling receptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
postsynaptic membrane
мембрана
клітинна мембрана
синапс
міжклітинні контакти
внутрішньоклітинний
integral component of plasma membrane
NMDA selective glutamate receptor complex
postsynaptic density membrane

Біологічний процес

переляк
regulation of sensory perception of pain
adult locomotory behavior
ion transport
MAPK cascade
ionotropic glutamate receptor signaling pathway
excitatory postsynaptic potential
calcium-mediated signaling
GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol
regulation of molecular function
brain development
regulation of synaptic plasticity
довготривала потенціація
excitatory chemical synaptic transmission

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2906
14814
Ensembl
ENSG00000105464
ENSMUSG00000002771
UniProt
O15399
Q03391
RefSeq (мРНК)
NM_000836
NM_008172
RefSeq (білок)
NP_000827
NP_032198
Локус (UCSC) Хр. 19: 48.39 – 48.44 Mb Хр. 7: 45.83 – 45.88 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GRIN2D (англ. Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 336 амінокислот, а молекулярна маса — 143 752[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MRGAGGPRGPRGPAKMLLLLALACASPFPEEAPGPGGAGGPGGGLGGARP
LNVALVFSGPAYAAEAARLGPAVAAAVRSPGLDVRPVALVLNGSDPRSLV
LQLCDLLSGLRVHGVVFEDDSRAPAVAPILDFLSAQTSLPIVAVHGGAAL
VLTPKEKGSTFLQLGSSTEQQLQVIFEVLEEYDWTSFVAVTTRAPGHRAF
LSYIEVLTDGSLVGWEHRGALTLDPGAGEAVLSAQLRSVSAQIRLLFCAR
EEAEPVFRAAEEAGLTGSGYVWFMVGPQLAGGGGSGAPGEPPLLPGGAPL
PAGLFAVRSAGWRDDLARRVAAGVAVVARGAQALLRDYGFLPELGHDCRA
QNRTHRGESLHRYFMNITWDNRDYSFNEDGFLVNPSLVVISLTRDRTWEV
VGSWEQQTLRLKYPLWSRYGRFLQPVDDTQHLTVATLEERPFVIVEPADP
ISGTCIRDSVPCRSQLNRTHSPPPDAPRPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIG
FSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIV
DFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEPYSPAVWVMMFVMCLTVVAVT
VFIFEYLSPVGYNRSLATGKRPGGSTFTIGKSIWLLWALVFNNSVPVENP
RGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDTVSGLSDRKFQR
PQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKA
GKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWK
RPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICHNDKIEVMSSKLDIDNMAGVFY
MLLVAMGLSLLVFAWEHLVYWRLRHCLGPTHRMDFLLAFSRGMYSCCSAE
AAPPPAKPPPPPQPLPSPAYPAPRPAPGPAPFVPRERASVDRWRRTKGAG
PPGGAGLADGFHRYYGPIEPQGLGLGLGEARAAPRGAAGRPLSPPAAQPP
QKPPPSYFAIVRDKEPAEPPAGAFPGFPSPPAPPAAAATAVGPPLCRLAF
EDESPPAPARWPRSDPESQPLLGPGAGGAGGTGGAGGGAPAAPPPCRAAP
PPCPYLDLEPSPSDSEDSESLGGASLGGLEPWWFADFPYPYAERLGPPPG
RYWSVDKLGGWRAGSWDYLPPRSGPAAWHCRHCASLELLPPPRHLSCSHD
GLDGGWWAPPPPPWAAGPLPRRRARCGCPRSHPHRPRASHRTPAAAAPHH
HRHRRAAGGWDLPPPAPTSRSLEDLSSCPRAAPARRLTGPSRHARRCPHA
AHWGPPLPTASHRRHRGGDLGTRRGSAHFSSLESEV

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Примітки

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2D переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4588 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, O15399 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 19
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Cys-петельні
Серотонін
ГАМК
  • ГАМКА
    • α1
    • α2
    • α3
    • α4
    • α5
    • α6
    • β1
    • β2
    • β3
    • γ1
    • γ2
    • γ3
    • δ
    • ε
    • π
    • θ
  • ГАМКА
    • ρ1
    • ρ2
    • ρ3
Гліцин
  • α1
  • α2
  • α3
  • α4
  • β
Нікотин ацетилхолін
  • пентамери: (α3)2(β4)3
  • (α4)2(β2)3
  • (α7)5
  • (α1)2(β4)3
  • (α1)2β1δε
Цинк
Іонотропні глутаматні
Тільки ліганд-залежні
Потенціал- та ліганд-залежні
Орфанні
  • GluD
    • δ1
    • δ2
АТФ-залежні
Пуринові рецептори