GRIN2C

GRIN2C
Ідентифікатори
Символи GRIN2C, GluN2C, NMDAR2C, NR2C, glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C
Зовнішні ІД OMIM: 138254 MGI: 95822 HomoloGene: 647 GeneCards: GRIN2C
Реагує на сполуку
Гліцин, Аспарагінова кислота, homoquinolinic acid, Tetrazolylglycine, N-метил-D-аспартат, 5,7-dichlorokynurenic acid, d-CCPene, selfotel, амантадин, декстрометорфан, dizocilpine, кетамін, L-morphan, фенциклідин, lanicemine, neboglamine, priralfinamide, esketamine, кетамін, cns-5161, ketamine hydrochloride, amantadine hydrochloride, orphenadrine citrate[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• ion channel activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• ionotropic glutamate receptor activity
• cation channel activity
• extracellularly glutamate-gated ion channel activity
• NMDA glutamate receptor activity
• glutamate-gated calcium ion channel activity
• signaling receptor activity
• transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential

Клітинна компонента

• integral component of membrane
• postsynaptic membrane
• мембрана
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення
• клітинна мембрана
• синапс
• міжклітинні контакти
• внутрішньоклітинний
• integral component of plasma membrane
• NMDA selective glutamate receptor complex
• postsynaptic density membrane
• glutamatergic synapse

Біологічний процес

• GO:0034613 protein localization
• glutamate receptor signaling pathway
• neuromuscular process controlling balance
• GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process
• regulation of membrane potential
• directional locomotion
• ion transport
• MAPK cascade
• ionotropic glutamate receptor signaling pathway
• response to wounding
• excitatory postsynaptic potential
• calcium-mediated signaling
• GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol
• regulation of molecular function
• GO:0015915 транспорт
• brain development
• regulation of synaptic plasticity
• довготривала потенціація
• excitatory chemical synaptic transmission
• protein localization to postsynaptic membrane

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
2905
14813
Ensembl
ENSG00000161509
ENSMUSG00000020734
UniProt
Q14957
Q01098
RefSeq (мРНК)
NM_000835
NM_001278553
NM_010350
RefSeq (білок)
NP_000826
NP_001265482
NP_034480
Локус (UCSC) Хр. 17: 74.84 – 74.86 Mb Хр. 11: 115.14 – 115.16 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

GRIN2C (англ. Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 233 амінокислот, а молекулярна маса — 134 209[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGGALGPALLLTSLFGAWAGLGPGQGEQGMTVAVVFSSSGPPQAQFRARL
TPQSFLDLPLEIQPLTVGVNTTNPSSLLTQICGLLGAAHVHGIVFEDNVD
TEAVAQILDFISSQTHVPILSISGGSAVVLTPKEPGSAFLQLGVSLEQQL
QVLFKVLEEYDWSAFAVITSLHPGHALFLEGVRAVADASHVSWRLLDVVT
LELGPGGPRARTQRLLRQLDAPVFVAYCSREEAEVLFAEAAQAGLVGPGH
VWLVPNLALGSTDAPPATFPVGLISVVTESWRLSLRQKVRDGVAILALGA
HSYWRQHGTLPAPAGDCRVHPGPVSPAREAFYRHLLNVTWEGRDFSFSPG
GYLVQPTMVVIALNRHRLWEMVGRWEHGVLYMKYPVWPRYSASLQPVVDS
RHLTVATLEERPFVIVESPDPGTGGCVPNTVPCRRQSNHTFSSGDVAPYT
KLCCKGFCIDILKKLARVVKFSYDLYLVTNGKHGKRVRGVWNGMIGEVYY
KRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARSNGTVSPSAFLEP
YSPAVWVMMFVMCLTVVAITVFMFEYFSPVSYNQNLTRGKKSGGPAFTIG
KSVWLLWALVFNNSVPIENPRGTTSKIMVLVWAFFAVIFLASYTANLAAF
MIQEQYIDTVSGLSDKKFQRPQDQYPPFRFGTVPNGSTERNIRSNYRDMH
THMVKFNQRSVEDALTSLKMGKLDAFIYDAAVLNYMAGKDEGCKLVTIGS
GKVFATTGYGIAMQKDSHWKRAIDLALLQFLGDGETQKLETVWLSGICQN
EKNEVMSSKLDIDNMAGVFYMLLVAMGLALLVFAWEHLVYWKLRHSVPNS
SQLDFLLAFSRGIYSCFSGVQSLASPPRQASPDLTASSAQASVLKMLQAA
RDMVTTAGVSSSLDRATRTIENWGGGRRAPPPSPCPTPRSGPSPCLPTPD
PPPEPSPTGWGPPDGGRAALVRRAPQPPGRPPTPGPPLSDVSRVSRRPAW
EARWPVRTGHCGRHLSASERPLSPARCHYSSFPRADRSGRPFLPLFPELE
DLPLLGPEQLARREALLHAAWARGSRPRHASLPSSVAEAFARPSSLPAGC
TGPACARPDGHSACRRLAQAQSMCLPIYREACQEGEQAGAPAWQHRQHVC
LHAHAHLPFCWGAVCPHLPPCASHGSWLSGAWGPLGHRGRTLGLGTGYRD
SGGLDEISRVARGTQGFPGPCTWRRISSLESEV

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

  • Lin Y.J., Bovetto S., Carver J.M., Giordano T. (1996). Cloning of the cDNA for the human NMDA receptor NR2C subunit and its expression in the central nervous system and periphery. Brain Res. Mol. Brain Res. 43: 57—64. PMID 9037519 DOI:10.1016/S0169-328X(96)00146-5
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cai L., Loo L.S., Atlashkin V., Hanson B.J., Hong W. (2011). Deficiency of sorting nexin 27 (SNX27) leads to growth retardation and elevated levels of N-methyl-D-aspartate receptor 2C (NR2C). Mol. Cell. Biol. 31: 1734—1747. PMID 21300787 DOI:10.1128/MCB.01044-10

Примітки

  1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4587 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q14957 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Cys-петельні
Серотонін
ГАМК
  • ГАМКА
    • α1
    • α2
    • α3
    • α4
    • α5
    • α6
    • β1
    • β2
    • β3
    • γ1
    • γ2
    • γ3
    • δ
    • ε
    • π
    • θ
  • ГАМКА-ρ
    • ρ1
    • ρ2
    • ρ3
Гліцин
  • α1
  • α2
  • α3
  • α4
  • β
Нікотин ацетилхолін
  • пентамери: (α3)2(β4)3
  • (α4)2(β2)3
  • (α7)5
  • (α1)2(β4)3
  • (α1)2β1δε
Цинк
Іонотропні глутаматні
Тільки ліганд-залежні
Потенціал- та ліганд-залежні
Орфанні
  • GluD
    • δ1
    • δ2
АТФ-залежні
Пуринові рецептори