GRIN2A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3NFL, 5H8Q, 5H8H, 5H8N, 5H8F, 5I2N, 5I2K, 5KDT, 5KCJ

Ідентифікатори

Символи

GRIN2A, EPND, FESD, GluN2A, LKS, NMDAR2A, NR2A, glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A

Зовнішні ІД

OMIM: 138253 MGI: 95820 HomoloGene: 645 GeneCards: GRIN2A

Пов'язані генетичні захворювання

гепатит B, Landau–Kleffner syndrome, rolandic epilepsy-speech dyspraxia syndrome, benign epilepsy with centrotemporal spikes^[1]

Реагує на сполуку

Гліцин, Аспарагінова кислота, homoquinolinic acid, Tetrazolylglycine, N-метил-D-аспартат, 5,7-dichlorokynurenic acid, d-CCPene, selfotel, амантадин, dizocilpine, кетамін, фенциклідин, lanicemine, neboglamine, priralfinamide, esketamine, кетамін, cns-5161, ketamine hydrochloride, amantadine hydrochloride, orphenadrine citrate^[2]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium channel activity • zinc ion binding • NMDA glutamate receptor activity • зв'язування з іоном металу • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ionotropic glutamate receptor activity • cation channel activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • amyloid-beta binding • glutamate-gated calcium ion channel activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • postsynaptic membrane • мембрана • Синаптичні бульбашки • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • NMDA selective glutamate receptor complex • cell surface • міжклітинні контакти • ендоплазматичний ретикулум • neuron projection • presynaptic membrane • postsynaptic density membrane • integral component of postsynaptic density membrane • synaptic membrane • glutamatergic synapse • cell projection • dendritic spine
Біологічний процес	• visual learning • GO:0034613 protein localization • glutamate receptor signaling pathway • Нейрогенез • переляк • regulation of sensory perception of pain • positive regulation of long-term synaptic potentiation • GO:1903363 negative regulation of protein catabolic process • response to amphetamine • regulation of membrane potential • directional locomotion • modulation of chemical synaptic transmission • пам'ять • serotonin metabolic process • ion transport • навчення • cation transmembrane transport • MAPK cascade • regulation of synaptic plasticity • сон • dopamine metabolic process • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • response to wounding • calcium ion transmembrane transport • locomotion • regulation of postsynaptic membrane potential • excitatory postsynaptic potential • learning or memory • positive regulation of apoptotic process • sensory perception of pain • response to ethanol • calcium ion transport • довготривала потенціація • chemical synaptic transmission • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • ion transmembrane transport • regulation of ion transmembrane transport • GO:0015915 транспорт • brain development • calcium-mediated signaling • activation of cysteine-type endopeptidase activity • GO:0060401 calcium ion transmembrane import into cytosol • excitatory chemical synaptic transmission • protein localization to postsynaptic membrane • cellular response to amyloid-beta • regulation of NMDA receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


2903


14811

Ensembl


ENSG00000183454


ENSMUSG00000059003

UniProt


Q12879


P35436

RefSeq (мРНК)


NM_000833 NM_001134407 NM_001134408


NM_008170

RefSeq (білок)


NP_000824 NP_001127879 NP_001127880


NP_032196

Локус (UCSC)

Хр. 16: 9.75 – 10.18 Mb

Хр. 16: 9.39 – 9.81 Mb

PubMed search

^[3]

^[4]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

GRIN2A (англ. Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 464 амінокислот, а молекулярна маса — 165 283^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRVGYWTLL	VLPALLVWRG	PAPSAAAEKG	PPALNIAVML	GHSHDVTERE
LRTLWGPEQA	AGLPLDVNVV	ALLMNRTDPK	SLITHVCDLM	SGARIHGLVF
GDDTDQEAVA	QMLDFISSHT	FVPILGIHGG	ASMIMADKDP	TSTFFQFGAS
IQQQATVMLK	IMQDYDWHVF	SLVTTIFPGY	REFISFVKTT	VDNSFVGWDM
QNVITLDTSF	EDAKTQVQLK	KIHSSVILLY	CSKDEAVLIL	SEARSLGLTG
YDFFWIVPSL	VSGNTELIPK	EFPSGLISVS	YDDWDYSLEA	RVRDGIGILT
TAASSMLEKF	SYIPEAKASC	YGQMERPEVP	MHTLHPFMVN	VTWDGKDLSF
TEEGYQVHPR	LVVIVLNKDR	EWEKVGKWEN	HTLSLRHAVW	PRYKSFSDCE
PDDNHLSIVT	LEEAPFVIVE	DIDPLTETCV	RNTVPCRKFV	KINNSTNEGM
NVKKCCKGFC	IDILKKLSRT	VKFTYDLYLV	TNGKHGKKVN	NVWNGMIGEV
VYQRAVMAVG	SLTINEERSE	VVDFSVPFVE	TGISVMVSRS	NGTVSPSAFL
EPFSASVWVM	MFVMLLIVSA	IAVFVFEYFS	PVGYNRNLAK	GKAPHGPSFT
IGKAIWLLWG	LVFNNSVPVQ	NPKGTTSKIM	VSVWAFFAVI	FLASYTANLA
AFMIQEEFVD	QVTGLSDKKF	QRPHDYSPPF	RFGTVPNGST	ERNIRNNYPY
MHQYMTKFNQ	KGVEDALVSL	KTGKLDAFIY	DAAVLNYKAG	RDEGCKLVTI
GSGYIFATTG	YGIALQKGSP	WKRQIDLALL	QFVGDGEMEE	LETLWLTGIC
HNEKNEVMSS	QLDIDNMAGV	FYMLAAAMAL	SLITFIWEHL	FYWKLRFCFT
GVCSDRPGLL	FSISRGIYSC	IHGVHIEEKK	KSPDFNLTGS	QSNMLKLLRS
AKNISSMSNM	NSSRMDSPKR	AADFIQRGSL	IMDMVSDKGN	LMYSDNRSFQ
GKESIFGDNM	NELQTFVANR	QKDNLNNYVF	QGQHPLTLNE	SNPNTVEVAV
STESKANSRP	RQLWKKSVDS	IRQDSLSQNP	VSQRDEATAE	NRTHSLKSPR
YLPEEMAHSD	ISETSNRATC	HREPDNSKNH	KTKDNFKRSV	ASKYPKDCSE
VERTYLKTKS	SSPRDKIYTI	DGEKEPGFHL	DPPQFVENVT	LPENVDFPDP
YQDPSENFRK	GDSTLPMNRN	PLHNEEGLSN	NDQYKLYSKH	FTLKDKGSPH
SETSERYRQN	STHCRSCLSN	MPTYSGHFTM	RSPFKCDACL	RMGNLYDIDE
DQMLQETGNP	ATGEQVYQQD	WAQNNALQLQ	KNKLRISRQH	SYDNIVDKPR
ELDLSRPSRS	ISLKDRERLL	EGNFYGSLFS	VPSSKLSGKK	SSLFPQGLED
SKRSKSLLPD	HTSDNPFLHS	HRDDQRLVIG	RCPSDPYKHS	LPSQAVNDSY
LRSSLRSTAS	YCSRDSRGHN	DVYISEHVMP	YAANKNNMYS	TPRVLNSCSN
RRVYKKMPSI	ESDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Foldes R.L., Adams S.L., Fantaske R.P., Kamboj R.K. (1994). Human N-methyl-D-aspartate receptor modulatory subunit hNR2A: cloning and sequencing of the cDNA and primary structure of the protein. Biochim. Biophys. Acta. 1223: 155—159. PMID 8061049 DOI:10.1016/0167-4889(94)90086-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GRIN2A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4585 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q12879 (англ.) . Архів оригіналу за 11 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Ліганд-залежні іонні канали

Cys-петельні

Серотонін	5-HT₃ A B C D E

ГАМК	ГАМК_А α₁ α₂ α₃ α₄ α₅ α₆ β₁ β₂ β₃ γ₁ γ₂ γ₃ δ ε π θ ГАМК_А-ρ ρ₁ ρ₂ ρ₃

Гліцин	α₁ α₂ α₃ α₄ β

Нікотин ацетилхолін	мономери: α1 α2 α3 α4 α5 α6 α7 α9 α10 β1 β2 β3 β4 δ ε пентамери: (α3)₂(β4)₃ (α4)₂(β2)₃ (α7)₅ (α1)₂(β4)₃ (α1)₂β1δε

Цинк	ZACN

Іонотропні глутаматні

Тільки ліганд-залежні	AMPA (1 2 3 4) Каїнат 1 2 3 4 5

Потенціал- та ліганд-залежні	NMDA 1 2A 2B 2C 2D 3A 3B L1A L1B

Орфанні	GluD δ₁ δ₂