RACK1

RACK1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4AOW, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 5FLX

Ідентифікатори
Символи RACK1, Gnb2-rs1, H12.3, HLC-7, PIG21, GNB2L1, receptor for activated C kinase 1
Зовнішні ІД OMIM: 176981 MGI: 101849 HomoloGene: 4446 GeneCards: RACK1
Онтологія гена
Молекулярна функція

protein homodimerization activity
receptor tyrosine kinase binding
SH2 domain binding
signaling adaptor activity
protein tyrosine kinase inhibitor activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
enzyme binding
cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process
GO:0032947 molecular adaptor activity
protein phosphatase binding
signaling receptor binding
ion channel inhibitor activity
RNA binding
cadherin binding
ribosome binding
protein kinase C binding
cyclin binding

Клітинна компонента

цитоплазма
cell body
перикаріон
cell projection
мембрана
клітинна мембрана
neuronal cell body
дендрит (нейробіологія)
midbody
мітохондрія
perinuclear region of cytoplasm
neuron projection
phagocytic cup
екзосома
клітинне ядро
IRE1-RACK1-PP2A complex
нуклеоплазма
гіалоплазма
рибосома
small ribosomal subunit
cytosolic small ribosomal subunit

Біологічний процес

positive regulation of protein homooligomerization
positive regulation of Golgi to plasma membrane protein transport
negative regulation of protein kinase B signaling
positive regulation of protein phosphorylation
positive regulation of ceramide biosynthetic process
regulation of cell division
negative regulation of phagocytosis
positive regulation of gastrulation
ритмічний процес
positive regulation of cell migration
negative regulation of endoplasmic reticulum unfolded protein response
cellular response to growth factor stimulus
negative regulation of Wnt signaling pathway
regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway
negative regulation of gene expression
regulation of cell cycle
regulation of protein localization
multicellular organism development
GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity
negative regulation of hydrogen peroxide-induced neuron death
positive regulation of mitochondrial depolarization
гаструляція
negative regulation of cell growth
negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation
positive regulation of apoptotic process
клітинний цикл
regulation of growth
GO:0022415 viral process
regulation of establishment of cell polarity
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
regulation of translation
positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
cellular response to glucose stimulus
positive regulation of cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity
GO:0097285 апоптоз
negative regulation of protein tyrosine kinase activity
Біосинтез білків
pigmentation
Убіквітин-залежний протеоліз
rescue of stalled ribosome
negative regulation of translation
regulation of protein localization to plasma membrane

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10399
14694
Ensembl
ENSG00000204628
ENSMUSG00000020372
UniProt
P63244
P68040
RefSeq (мРНК)
NM_006098
NM_008143
RefSeq (білок)
NP_006089
NP_032169
Локус (UCSC) Хр. 5: 181.24 – 181.25 Mb Хр. 11: 48.69 – 48.7 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

RACK1 (англ. Receptor for activated C kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 077[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDET
NYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALSGSWDGTLRLWDLTTGTTTRR
FVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEW
VSCVRFSPNSSNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTV
SPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALCFSPNRYWLCA
ATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFA
GYTDNLVRVWQVTIGTR

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, взаємодія хазяїн-вірус, клітинний цикл, біологічні ритми, регуляція росту, гаструляція. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

  • Guillemot F., Billault A., Auffray C. (1989). Physical linkage of a guanine nucleotide-binding protein-related gene to the chicken major histocompatibility complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 4594—4598. PMID 2499885 DOI:10.1073/pnas.86.12.4594
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chang B.Y., Conroy K.B., Machleder E.M., Cartwright C.A. (1998). RACK1, a receptor for activated C kinase and a homolog of the beta subunit of G proteins, inhibits activity of src tyrosine kinases and growth of NIH 3T3 cells. Mol. Cell. Biol. 18: 3245—3256. PMID 9584165 DOI:10.1128/MCB.18.6.3245
  • Chang B.Y., Chiang M., Cartwright C.A. (2001). The interaction of Src and RACK1 is enhanced by activation of protein kinase C and tyrosine phosphorylation of RACK1. J. Biol. Chem. 276: 20346—20356. PMID 11279199 DOI:10.1074/jbc.M101375200
  • Gallina A., Rossi F., Milanesi G. (2001). Rack1 binds HIV-1 Nef and can act as a Nef-protein kinase C adaptor. Virology. 283: 7—18. PMID 11312657 DOI:10.1006/viro.2001.0855
  • Liedtke C.M., Yun C.H.C., Kyle N., Wang D. (2002). Protein kinase C epsilon-dependent regulation of cystic fibrosis transmembrane regulator involves binding to a receptor for activated C kinase (RACK1) and RACK1 binding to Na+/H+ exchange regulatory factor. J. Biol. Chem. 277: 22925—22933. PMID 11956211 DOI:10.1074/jbc.M201917200

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4399 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
  4. UniProt, P63244 (англ.) . Архів оригіналу за 25 січня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S