Рибосомний білок L11

Рибосомний білок L11
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4UG0, 4V6X, 4XXB, 5AJ0, 4V5Z, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC,%%s4UJE, 4XXB, 4UJD, 4D67, 4V5Z, 4V6X, 5AJ0, 4UJC, 4D5Y, 4UG0

Ідентифікатори
Символи RPL11, DBA7, GIG34, L11, ribosomal protein L11, uL5
Зовнішні ІД OMIM: 604175 MGI: 1914275 HomoloGene: 37376 GeneCards: RPL11
Пов'язані генетичні захворювання
Diamond-Blackfan anemia[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• rRNA binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• RNA binding
• structural constituent of ribosome
• 5S rRNA binding
• ubiquitin protein ligase binding
• GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• рибосома
• мембрана
• внутрішньоклітинний
• ядерце
• cytosolic large ribosomal subunit
• екзосома
• клітинне ядро
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• нуклеоплазма
• цитоплазма
• GO:0009327 protein-containing complex
• polysomal ribosome

Біологічний процес

• сортування білків
• viral transcription
• SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
• ribosomal large subunit biogenesis
• translational initiation
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
• rRNA processing
• Біосинтез білків
• ribosomal large subunit assembly
• GO:1901313 positive regulation of gene expression
• positive regulation of protein binding
• protein stabilization
• GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity
• negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process
• negative regulation of protein neddylation
• regulation of signal transduction by p53 class mediator
• negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
• protein localization to nucleus
• positive regulation of signal transduction by p53 class mediator
• positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
• cytoplasmic translation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6135
67025
Ensembl
ENSG00000142676
ENSMUSG00000059291
UniProt
P62913
Q5VVD0
Q9CXW4
RefSeq (мРНК)
NM_001199802
NM_000975
NM_025919
RefSeq (білок)
NP_000966
NP_001186731
NP_000966.2
NP_080195
Локус (UCSC) Хр. 1: 23.69 – 23.7 Mb Хр. 4: 135.76 – 135.78 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Рибосомний білок L11 (англ. Ribosomal protein L11) – білок, який кодується геном RPL11, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 178 амінокислот, а молекулярна маса — 20 252[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAQDQGEKENPMRELRIRKLCLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLTGQTPVF
SKARYTVRSFGIRRNEKIAVHCTVRGAKAEEILEKGLKVREYELRKNNFS
DTGNFGFGIQEHIDLGIKYDPSIGIYGLDFYVVLGRPGFSIADKKRRTGC
IGAKHRISKEEAMRWFQQKYDGIILPGK

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Mishin V.P., Filipenko M.L., Muravlev A.I., Karpova G.G., Mertvetsov N.P. (1995). Cloning and determination of the primary structure of DNA complementary to the mRNA of human ribosomal protein L11. Bioorg. Khim. 21: 158—160. PMID 7748210
  • Voronina E.N., Kolokol'tsova T.D., Nechaeva E.A., Filipenko M.L. (2003). Structural and functional analysis of the human ribosomal protein L11 gene. Mol. Biol. (Mosk.). 37: 425—435. PMID 12815950

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з Рибосомний білок L11 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10301 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.
  5. ↑ UniProt, P62913 (англ.) . Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S