Рибосомний білок S6

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4D5L, 4UJE, 5FLX, 4UJC, 3J7P, 4KZZ, 4UJD, 4KZY, 4D61, 3J7R, 4KZX

Ідентифікатори

Символи

RPS6, S6, ribosomal protein S6

Зовнішні ІД

OMIM: 180460 MGI: 98159 HomoloGene: 85949 GeneCards: RPS6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • RNA binding
Клітинна компонента	• cell body • гіалоплазма • рибосома • мембрана • внутрішньоклітинний • ядерце • small ribosomal subunit • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • Полісома • cytosolic small ribosomal subunit • дендрит (нейробіологія) • perinuclear region of cytoplasm • ендоплазматичний ретикулум • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • TOR signaling • positive regulation of apoptotic process • translational initiation • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • Біосинтез білків • G1 phase • GO:0007067 мітоз • placenta development • T cell proliferation involved in immune response • rRNA processing • activation-induced cell death of T cells • mitotic cell cycle checkpoint signaling • гаструляція • mammalian oogenesis stage • T cell differentiation in thymus • ribosomal small subunit biogenesis • glucose homeostasis • negative regulation of apoptotic process • erythrocyte development • G1/S transition of mitotic cell cycle
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6194


20104

Ensembl


ENSG00000137154


ENSMUSG00000028495

UniProt


P62753


P62754

RefSeq (мРНК)


NM_001010


NM_009096

RefSeq (білок)


NP_001001


NP_033122

Локус (UCSC)

Хр. 9: 19.38 – 19.38 Mb

Хр. 4: 86.77 – 86.78 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S6 (англ. Ribosomal protein S6) – білок, який кодується геном RPS6, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 28 681^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKLNISFPAT	GCQKLIEVDD	ERKLRTFYEK	RMATEVAADA	LGEEWKGYVV
RISGGNDKQG	FPMKQGVLTH	GRVRLLLSKG	HSCYRPRRTG	ERKRKSVRGC
IVDANLSVLN	LVIVKKGEKD	IPGLTDTTVP	RRLGPKRASR	IRKLFNLSKE
DDVRQYVVRK	PLNKEGKKPR	TKAPKIQRLV	TPRVLQHKRR	RIALKKQRTK
KNKEEAAEYA	KLLAKRMKEA	KEKRQEQIAK	RRRLSSLRAS	TSKSESSQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

Lott J.B., Mackie G.A. (1988). Isolation and characterization of cloned cDNAs that code for human ribosomal protein S6. Gene. 65: 31—39. PMID 2840355 DOI:10.1016/0378-1119(88)90414-3
Antoine M., Fried M. (1992). The organization of the intron-containing human S6 ribosomal protein (rpS6) gene and determination of its location at chromosome 9p21. Hum. Mol. Genet. 1: 565—570. PMID 1301164 DOI:10.1093/hmg/1.8.565
Pata I., Hoth S., Kruppa J., Metspalu A. (1992). The human ribosomal protein S6 gene: isolation, primary structure and location in chromosome 9. Gene. 121: 387—392. PMID 1446836 DOI:10.1016/0378-1119(92)90149-J
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Heinze H., Arnold H.H., Fischer D., Kruppa J. (1988). The primary structure of the human ribosomal protein S6 derived from a cloned cDNA. J. Biol. Chem. 263: 4139—4144. PMID 3279029

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10429 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, P62753 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)

Білки

Фактори ініціації трансляції

Фактори ініціації трансляції прокаріотів

PIF-1
PIF-2
PIF-3

Фактори ініціації трансляції археїв

aIF1
aIF2
aIF5
aIF6

Фактори ініціації трансляції еукаріотів

eIF1	eIF1 AX AY B

eIF2	α β γ eIF2B 1 2 3 4 5 кіназа eIF2A eIF2D

eIF3	A B C D E F G H I J K L M

eIF4	EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H

eIF5	EIF5 A A2 5B

eIF6	EIF6

Фактори елонгації трансляції

Фактори елонгації трансляції прокаріотів	EF-Tu EF-Ts EF-G

Фактори елонгації трансляції археїв	aEF-1, aEF-2

Фактори елонгації трансляції еукаріотів	EEF-1 A1 A2 A3 B1 B2 B3 B4 D E1 G EEF2

Фактори термінації трансляції

Фактори термінації трансляції прокаріотів
Фактори термінації трансляції археїв
Фактори термінації трансляції еукаріотів

Клас 1
- eRF1
Клас 2/RF3
- GSPT1
- GSPT2

Рибосомні білки

Цитоплазмові

підрозділ 60S	RPL3 4 5 6 7 7A 8 9 10 A L 11 12 13 13A 14 15 17 18 18A 19 21 22 23 23A 24 26 27 27A 28 29 30 31 32 34 35 35A 36 36A 37 37A 38 39 40 41 P0 P1 P2 RRP15 RSL24D1

підрозділ 40S	RPSA 2 3 3A RPS4 X Y1 Y2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 15A 16 17 18 19 20 21 23 24 25 26 27 27A 28 29 30 RACK1

Мітохондріальні

підрозділ 39S	MRPL1 2 3 4 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58

підрозділ 28S	MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 14 15 16 17 18 A B C 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 33 34 35 36