EIF5B

EIF5B
Ідентифікатори
Символи EIF5B, IF2, eukaryotic translation initiation factor 5B
Зовнішні ІД OMIM: 606086 MGI: 2441772 HomoloGene: 134613 GeneCards: EIF5B
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• зв'язування з іоном металу
• GTP binding
• hydrolase activity
• translation initiation factor activity
• RNA binding
• GO:0006184 GTPase activity

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• клітинне ядро
• цитоплазма

Біологічний процес

• regulation of translational initiation
• translational initiation
• Біосинтез білків

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9669
226982
Ensembl
ENSG00000158417
ENSMUSG00000026083
UniProt
O60841
Q05D44
RefSeq (мРНК)
NM_015904
NM_198303
RefSeq (білок)
NP_056988
NP_938045
Локус (UCSC) Хр. 2: 99.34 – 99.4 Mb Хр. 1: 38.04 – 38.09 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EIF5B (англ. Eukaryotic translation initiation factor 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 220 амінокислот, а молекулярна маса — 138 827[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGKKQKNKSEDSTKDDIDLDALAAEIEGAGAAKEQEPQKSKGKKKKEKKK
QDFDEDDILKELEELSLEAQGIKADRETVAVKPTENNEEEFTSKDKKKKG
QKGKKQSFDDNDSEELEDKDSKSKKTAKPKVEMYSGSDDDDDFNKLPKKA
KGKAQKSNKKWDGSEEDEDNSKKIKERSRINSSGESGDESDEFLQSRKGQ
KKNQKNKPGPNIESGNEDDDASFKIKTVAQKKAEKKERERKKRDEEKAKL
RKLKEKEELETGKKDQSKQKESQRKFEEETVKSKVTVDTGVIPASEEKAE
TPTAAEDDNEGDKKKKDKKKKKGEKEEKEKEKKKGPSKATVKAMQEALAK
LKEEEERQKREEEERIKRLEELEAKRKEEERLEQEKRERKKQKEKERKER
LKKEGKLLTKSQREARARAEATLKLLQAQGVEVPSKDSLPKKRPIYEDKK
RKKIPQQLESKEVSESMELCAAVEVMEQGVPEKEETPPPVEPEEEEDTED
AGLDDWEAMASDEETEKVEGNKVHIEVKENPEEEEEEEEEEEEDEESEEE
EEEEGESEGSEGDEEDEKVSDEKDSGKTLDKKPSKEMSSDSEYDSDDDRT
KEERAYDKAKRRIEKRRLEHSKNVNTEKLRAPIICVLGHVDTGKTKILDK
LRHTHVQDGEAGGITQQIGATNVPLEAINEQTKMIKNFDRENVRIPGMLI
IDTPGHESFSNLRNRGSSLCDIAILVVDIMHGLEPQTIESINLLKSKKCP
FIVALNKIDRLYDWKKSPDSDVAATLKKQKKNTKDEFEERAKAIIVEFAQ
QGLNAALFYENKDPRTFVSLVPTSAHTGDGMGSLIYLLVELTQTMLSKRL
AHCEELRAQVMEVKALPGMGTTIDVILINGRLKEGDTIIVPGVEGPIVTQ
IRGLLLPPPMKELRVKNQYEKHKEVEAAQGVKILGKDLEKTLAGLPLLVA
YKEDEIPVLKDELIHELKQTLNAIKLEEKGVYVQASTLGSLEALLEFLKT
SEVPYAGINIGPVHKKDVMKASVMLEHDPQYAVILAFDVRIERDAQEMAD
SLGVRIFSAEIIYHLFDAFTKYRQDYKKQKQEEFKHIAVFPCKIKILPQY
IFNSRDPIVMGVTVEAGQVKQGTPMCVPSKNFVDIGIVTSIEINHKQVDV
AKKGQEVCVKIEPIPGESPKMFGRHFEATDILVSKISRQSIDALKDWFRD
EMQKSDWQLIVELKKVFEII

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, факторів ініціації. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • Lee J.H., Choi S.K., Roll-Mecak A., Burley S.K., Dever T.E. (1999). Universal conservation in translation initiation revealed by human and archaeal homologs of bacterial translation initiation factor IF2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 4342—4347. PMID 10200264 DOI:10.1073/pnas.96.8.4342
  • Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
  • Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30793 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, O60841 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S