EIF4A2

EIF4A2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3BOR

Ідентифікатори
Символи EIF4A2, BM-010, DDX2B, EIF4A, EIF4F, eIF-4A-II, eIF4A-II, eukaryotic translation initiation factor 4A2
Зовнішні ІД OMIM: 601102 MGI: 106906 HomoloGene: 1487 GeneCards: EIF4A2
Онтологія гена
Молекулярна функція

• nucleotide binding
• translation initiation factor activity
• GO:0008026 helicase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• nucleic acid binding
• hydrolase activity
• ATP binding
• ATPase activity
• RNA binding

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• perinuclear region of cytoplasm
• eukaryotic translation initiation factor 4F complex
• ядерце

Біологічний процес

• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
• RNA secondary structure unwinding
• GO:0022415 viral process
• negative regulation of RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity
• Біосинтез білків
• regulation of translational initiation
• translational initiation
• cellular response to leukemia inhibitory factor

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1974
13682
Ensembl
ENSG00000156976
ENSMUSG00000022884
UniProt
Q14240
P10630
RefSeq (мРНК)
NM_001967
NM_001123037
NM_001123038
NM_013506
NM_001347179
RefSeq (білок)
NP_001958
NP_001116509
NP_001116510
NP_001334108
NP_038534
Локус (UCSC) Хр. 3: 186.78 – 186.79 Mb Хр. 16: 22.93 – 22.93 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EIF4A2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 402[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSGGSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYA
YGFEKPSAIQQRAIIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFK
ETQALVLAPTRELAQQIQKVILALGDYMGATCHACIGGTNVRNEMQKLQA
EAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVLDEADEMLSRGFKDQIYEI
FQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEELTLEGIKQF
YINVEREEWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMHARDFTV
SALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDL
PTNRENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVTEEDKRILRDIETFYNTTVEEMP
MNVADLI

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Li W., Belsham G.J., Proud C.G. (2001). Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo. J. Biol. Chem. 276: 29111—29115. PMID 11408474 DOI:10.1074/jbc.C100284200
  • Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 DOI:10.1016/j.gene.2004.12.027
  • Feng P., Everly D.N. Jr., Read G.S. (2005). mRNA decay during herpes simplex virus (HSV) infections: protein-protein interactions involving the HSV virion host shutoff protein and translation factors eIF4H and eIF4A. J. Virol. 79: 9651—9664. PMID 16014927 DOI:10.1128/JVI.79.15.9651-9664.2005
  • Sudo K., Takahashi E., Nakamura Y. (1995). Isolation and mapping of the human EIF4A2 gene homologous to the murine protein synthesis initiation factor 4A-II gene Eif4a2. Cytogenet. Cell Genet. 71: 385—388. PMID 8521730

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3284 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. ↑ UniProt, Q14240 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S