Рибосомний білок S27a

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2KTF, 2L0F, 2L0T, 2XK5, 3AXC, 3NHE, 3NOB, 3PHW, 3TBL, 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4R62, 5FLX, 4UJD, 4KZZ, 4UJC, 3J7P, 4KZY, 4D5L, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4UJE, 5A2Q

Ідентифікатори

Символи

RPS27A, CEP80, HEL112, S27A, UBA80, UBC, UBCEP1, UBCEP80, ribosomal protein S27a

Зовнішні ІД

OMIM: 191343 MGI: 1925544 HomoloGene: 37715 GeneCards: RPS27A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • рибосома • myelin sheath • cytosolic small ribosomal subunit • ядерце • екзосома • клітинна мембрана • нуклеоплазма • small ribosomal subunit • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell
Біологічний процес	• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • viral transcription • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0019067 viral life cycle • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • positive regulation of apoptotic process • translational initiation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Біосинтез білків • rRNA processing • ERBB2 signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6233


78294

Ensembl


ENSG00000143947


ENSMUSG00000020460

UniProt


P62979


P62983

RefSeq (мРНК)


NM_002954 NM_001135592 NM_001177413


NM_001033865 NM_024277

RefSeq (білок)


NP_001129064 NP_001170884 NP_002945


NP_001029037 NP_077239

Локус (UCSC)

Хр. 2: 55.23 – 55.24 Mb

Хр. 11: 29.5 – 29.5 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок S27a (англ. Ribosomal protein S27a) – білок, який кодується геном RPS27A, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 17 965^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQIFVKTLTG	KTITLEVEPS	DTIENVKAKI	QDKEGIPPDQ	QRLIFAGKQL
EDGRTLSDYN	IQKESTLHLV	LRLRGGAKKR	KKKSYTTPKK	NKHKRKKVKL
AVLKYYKVDE	NGKISRLRRE	CPSDECGAGV	FMASHFDRHY	CGKCCLTYCF
NKPEDK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Adams S.M., Sharp M.G., Walker R.A., Brammar W.J., Varley J.M. (1992). Differential expression of translation-associated genes in benign and malignant human breast tumours. Br. J. Cancer. 65: 65—71. PMID 1370760 DOI:10.1038/bjc.1992.12
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature. 255: 423—424. PMID 1128706 DOI:10.1038/255423a0
Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell. 21: 737—748. PMID 16543144 DOI:10.1016/j.molcel.2006.02.018
Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem. 279: 53533—53543. PMID 15466860 DOI:10.1074/jbc.M402916200
Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans. 37: 937—953. PMID 19754430 DOI:10.1042/BST0370937

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10417 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.
↑ UniProt, P62979 (англ.) . Процитовано 27 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)

Білки

Фактори ініціації трансляції

Фактори ініціації трансляції прокаріотів

PIF-1
PIF-2
PIF-3

Фактори ініціації трансляції археїв

aIF1
aIF2
aIF5
aIF6

Фактори ініціації трансляції еукаріотів

eIF1	eIF1 AX AY B

eIF2	α β γ eIF2B 1 2 3 4 5 кіназа eIF2A eIF2D

eIF3	A B C D E F G H I J K L M

eIF4	EIF4A2 A3 B E1 E2 E3 G1 G2 G3 H

eIF5	EIF5 A A2 5B

eIF6	EIF6

Фактори елонгації трансляції

Фактори елонгації трансляції прокаріотів	EF-Tu EF-Ts EF-G

Фактори елонгації трансляції археїв	aEF-1, aEF-2

Фактори елонгації трансляції еукаріотів	EEF-1 A1 A2 A3 B1 B2 B3 B4 D E1 G EEF2

Фактори термінації трансляції

Фактори термінації трансляції прокаріотів
Фактори термінації трансляції археїв
Фактори термінації трансляції еукаріотів

Клас 1
- eRF1
Клас 2/RF3
- GSPT1
- GSPT2

Рибосомні білки

Цитоплазмові

підрозділ 60S	RPL3 4 5 6 7 7A 8 9 10 A L 11 12 13 13A 14 15 17 18 18A 19 21 22 23 23A 24 26 27 27A 28 29 30 31 32 34 35 35A 36 36A 37 37A 38 39 40 41 P0 P1 P2 RRP15 RSL24D1

підрозділ 40S	RPSA 2 3 3A RPS4 X Y1 Y2 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 15A 16 17 18 19 20 21 23 24 25 26 27 27A 28 29 30 RACK1

Мітохондріальні

підрозділ 39S	MRPL1 2 3 4 6 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58

підрозділ 28S	MRPS1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 14 15 16 17 18 A B C 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 33 34 35 36