EIF3D |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | EIF3D, EIF3S7, eIF3-p66, eIF3-zeta, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603915 MGI: 1933181 HomoloGene: 2782 GeneCards: EIF3D |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • translation initiation factor activity • RNA binding • mRNA cap binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m • мембрана • eukaryotic translation initiation factor 3 complex • eukaryotic 43S preinitiation complex • eukaryotic 48S preinitiation complex |
---|
Біологічний процес | • formation of cytoplasmic translation initiation complex • viral translational termination-reinitiation • translational initiation • Біосинтез білків • IRES-dependent viral translational initiation • cap-dependent translational initiation • positive regulation of translation • positive regulation of mRNA binding • cytoplasmic translational initiation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 22: 36.51 – 36.53 Mb | Хр. 15: 77.84 – 77.86 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF3D (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 63 973[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKFMTPVIQ | | DNPSGWGPCA | | VPEQFRDMPY | | QPFSKGDRLG | | KVADWTGATY |
QDKRYTNKYS | | SQFGGGSQYA | | YFHEEDESSF | | QLVDTARTQK | | TAYQRNRMRF |
AQRNLRRDKD | | RRNMLQFNLQ | | ILPKSAKQKE | | RERIRLQKKF | | QKQFGVRQKW |
DQKSQKPRDS | | SVEVRSDWEV | | KEEMDFPQLM | | KMRYLEVSEP | | QDIECCGALE |
YYDKAFDRIT | | TRSEKPLRSI | | KRIFHTVTTT | | DDPVIRKLAK | | TQGNVFATDA |
ILATLMSCTR | | SVYSWDIVVQ | | RVGSKLFFDK | | RDNSDFDLLT | | VSETANEPPQ |
DEGNSFNSPR | | NLAMEATYIN | | HNFSQQCLRM | | GKERYNFPNP | | NPFVEDDMDK |
NEIASVAYRY | | RRWKLGDDID | | LIVRCEHDGV | | MTGANGEVSF | | INIKTLNEWD |
SRHCNGVDWR | | QKLDSQRGAV | | IATELKNNSY | | KLARWTCCAL | | LAGSEYLKLG |
YVSRYHVKDS | | SRHVILGTQQ | | FKPNEFASQI | | NLSVENAWGI | | LRCVIDICMK |
LEEGKYLILK | | DPNKQVIRVY | | SLPDGTFSSD | | EDEEEEEEEE | | EEEEEEET |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Daughenbaugh K.F., Fraser C.S., Hershey J.W., Hardy M.E. (2003). The genome-linked protein VPg of the Norwalk virus binds eIF3, suggesting its role in translation initiation complex recruitment. EMBO J. 22: 2852—2859. PMID 12773399 DOI:10.1093/emboj/cdg251
- Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
- Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
- Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 DOI:10.1101/gad.439507
- Yu X., Zheng B., Chai R. (2014). Lentivirus-mediated knockdown of eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D inhibits proliferation of HCT116 colon cancer cells. Biosci. Rep. 34: E00161—E00161. PMID 25370813 DOI:10.1042/BSR20140078
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3278 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O15371 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| Білки | Фактори ініціації трансляції | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
---|
| Фактори ініціації трансляції археїв | |
---|
| Фактори ініціації трансляції еукаріотів | eIF1 | |
---|
| eIF2 | |
---|
| eIF3 | |
---|
| eIF4 | |
---|
| eIF5 | |
---|
| eIF6 | |
---|
|
---|
|
---|
| Фактори елонгації трансляції | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
---|
| Фактори елонгації трансляції археїв | |
---|
| Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
---|
|
---|
| Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
---|
| Рибосомні білки | Цитоплазмові | підрозділ 60S | |
---|
| підрозділ 40S | |
---|
|
---|
| Мітохондріальні | підрозділ 39S | |
---|
| підрозділ 28S | |
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|