PRPF40A

PRPF40A
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

1UZC, 1YWI, 1YWJ, 1ZR7, 2CQN, 2DYF, 2KZG, 2L5F, 2L9V, 2LKS

معرفات
أسماء بديلة PRPF40A, FBP-11, FBP11, FLAF1, FNBP3, HIP-10, HIP10, HYPA, NY-REN-6, Prp40, pre-mRNA processing factor 40 homolog A
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 612941 MGI: MGI:1860512 HomoloGene: 6377 GeneCards: 55660
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• proline-rich region binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• RNA binding

مكونات خلوية

• مصفوفة نووية
• U1 snRNP
• U2-type prespliceosome
• غشاء
• نواة
• بلازم نووي
• عصارة خلوية
• nuclear speck

عمليات حيوية

• انقسام خلوي
• دورة الخلية
• mRNA processing
• regulation of cytokinesis
• هجرة الخلية
• cytoskeleton organization
• تضفير الآر أن إيه
• regulation of cell shape
• mRNA splicing, via spliceosome
• mRNA cis splicing, via spliceosome

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 55660 56194
Ensembl ENSG00000196504 ENSMUSG00000061136
يونيبروت

O75400

Q9R1C7

RefSeq (رنا مرسال.)

‏XM_011511447، ‏NM_001354432، ‏NM_001354431، ‏NM_001365596، ‏NM_001365597، ‏NM_001365598، ‏NM_001365599، ‏NM_001365600، ‏NM_001365601، ‏NM_001365602، ‏NM_001365603، ‏NM_001365604، ‏NM_001365605، ‏NM_001395472، ‏NM_001395473، ‏NM_001395475، ‏NM_001395476، ‏NM_001395477، ‏NM_001395478، ‏NM_001395479، ‏NM_001395480، ‏NM_001395481، ‏NM_001395482، ‏NM_001395483، ‏NM_001395488، ‏XM_047444941، ‏XM_047444942 NM_017892، ‏XM_011511447، ‏NM_001354432، ‏NM_001354431، ‏NM_001365596، ‏NM_001365597، ‏NM_001365598، ‏NM_001365599، ‏NM_001365600، ‏NM_001365601، ‏NM_001365602، ‏NM_001365603، ‏NM_001365604، ‏NM_001365605، ‏NM_001395472، ‏NM_001395473، ‏NM_001395475، ‏NM_001395476، ‏NM_001395477، ‏NM_001395478، ‏NM_001395479، ‏NM_001395480، ‏NM_001395481، ‏NM_001395482، ‏NM_001395483، ‏NM_001395488، ‏XM_047444941، ‏XM_047444942

‏XM_006498192، ‏XM_006498193، ‏XM_006498194، ‏XM_006498195، ‏XM_011239140، ‏XM_017319135، ‏XM_017319136 NM_018785، ‏XM_006498192، ‏XM_006498193، ‏XM_006498194، ‏XM_006498195، ‏XM_011239140، ‏XM_017319135، ‏XM_017319136

RefSeq (بروتين)

‏XP_011509749، ‏XP_011509751، ‏XP_016859946، ‏XP_016859947، ‏XP_016859948، ‏XP_016859950، ‏NP_001341361، ‏NP_001341360، ‏XP_024308747، ‏XP_024308748، ‏NP_001352525، ‏NP_001352526، ‏NP_001352527، ‏NP_001352528، ‏NP_001352529، ‏NP_001352530، ‏NP_001352531، ‏NP_001352532، ‏NP_001352533، ‏NP_001352534 NP_060362، ‏XP_011509749، ‏XP_011509751، ‏XP_016859946، ‏XP_016859947، ‏XP_016859948، ‏XP_016859950، ‏NP_001341361، ‏NP_001341360، ‏XP_024308747، ‏XP_024308748، ‏NP_001352525، ‏NP_001352526، ‏NP_001352527، ‏NP_001352528، ‏NP_001352529، ‏NP_001352530، ‏NP_001352531، ‏NP_001352532، ‏NP_001352533، ‏NP_001352534

‏XP_006498256، ‏XP_011237442، ‏NP_001357944، ‏NP_001357945، ‏NP_001357946، ‏NP_001357947، ‏NP_001357948، ‏NP_001357949، ‏XP_030107753 NP_061255، ‏XP_006498256، ‏XP_011237442، ‏NP_001357944، ‏NP_001357945، ‏NP_001357946، ‏NP_001357947، ‏NP_001357948، ‏NP_001357949، ‏XP_030107753

الموقع (UCSC n/a Chr 2: 53.13 – 53.19 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

PRPF40A‏ (Pre-mRNA processing factor 40 homolog A) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين PRPF40A في الإنسان.[1][2][3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Bedford MT، Reed R، Leder P (سبتمبر 1998). "WW domain-mediated interactions reveal a spliceosome-associated protein that binds a third class of proline-rich motif: the proline glycine and methionine-rich motif". Proc Natl Acad Sci U S A. ج. 95 ع. 18: 10602–7. Bibcode:1998PNAS...9510602B. DOI:10.1073/pnas.95.18.10602. PMC:27941. PMID:9724750.
  2. ^ Wiesner S، Stier G، Sattler M، Macias MJ (ديسمبر 2002). "Solution structure and ligand recognition of the WW domain pair of the yeast splicing factor Prp40". J Mol Biol. ج. 324 ع. 4: 807–22. DOI:10.1016/S0022-2836(02)01145-2. PMID:12460579.
  3. ^ "Entrez Gene: PRPF40A PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Chan DC، Bedford MT، Leder P (1996). "Formin binding proteins bear WWP/WW domains that bind proline-rich peptides and functionally resemble SH3 domains". EMBO J. ج. 15 ع. 5: 1045–54. PMC:450002. PMID:8605874.
  • Bedford MT، Chan DC، Leder P (1997). "FBP WW domains and the Abl SH3 domain bind to a specific class of proline-rich ligands". EMBO J. ج. 16 ع. 9: 2376–83. DOI:10.1093/emboj/16.9.2376. PMC:1169838. PMID:9171351.
  • Faber PW، Barnes GT، Srinidhi J، وآخرون (1998). "Huntingtin interacts with a family of WW domain proteins". Hum. Mol. Genet. ج. 7 ع. 9: 1463–74. DOI:10.1093/hmg/7.9.1463. PMID:9700202.
  • Scanlan MJ، Gordan JD، Williamson B، وآخرون (1999). "Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma". Int. J. Cancer. ج. 83 ع. 4: 456–64. DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5. PMID:10508479.
  • Bedford MT، Sarbassova D، Xu J، وآخرون (2000). "A novel pro-Arg motif recognized by WW domains". J. Biol. Chem. ج. 275 ع. 14: 10359–69. DOI:10.1074/jbc.275.14.10359. PMID:10744724.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Zhang QH، Ye M، Wu XY، وآخرون (2001). "Cloning and functional analysis of cDNAs with open reading frames for 300 previously undefined genes expressed in CD34+ hematopoietic stem/progenitor cells". Genome Res. ج. 10 ع. 10: 1546–60. DOI:10.1101/gr.140200. PMC:310934. PMID:11042152.
  • Wenzel J، Sanzenbacher R، Ghadimi M، وآخرون (2002). "Multiple interactions of the cytosolic polyproline region of the CD95 ligand: hints for the reverse signal transduction capacity of a death factor". FEBS Lett. ج. 509 ع. 2: 255–62. DOI:10.1016/S0014-5793(01)03174-X. PMID:11741599.
  • Allen M، Friedler A، Schon O، Bycroft M (2002). "The structure of an FF domain from human HYPA/FBP11". J. Mol. Biol. ج. 323 ع. 3: 411–6. DOI:10.1016/S0022-2836(02)00968-3. PMID:12381297.
  • Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
  • Katoh M، Katoh M (2004). "Identification and characterization of human FNBP3 gene in silico". Int. J. Mol. Med. ج. 12 ع. 4: 651–6. DOI:10.3892/ijmm.12.4.651. PMID:12964049.
  • Busino L، Donzelli M، Chiesa M، وآخرون (2003). "Degradation of Cdc25A by beta-TrCP during S phase and in response to DNA damage". Nature. ج. 426 ع. 6962: 87–91. Bibcode:2003Natur.426...87B. DOI:10.1038/nature02082. PMID:14603323.
  • Mizutani K، Suetsugu S، Takenawa T (2004). "FBP11 regulates nuclear localization of N-WASP and inhibits N-WASP-dependent microspike formation". Biochem. Biophys. Res. Commun. ج. 313 ع. 3: 468–74. DOI:10.1016/j.bbrc.2003.11.139. PMID:14697212.
  • Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
  • Beausoleil SA، Jedrychowski M، Schwartz D، وآخرون (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 101 ع. 33: 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMC:514446. PMID:15302935.
  • Jin J، Smith FD، Stark C، وآخرون (2004). "Proteomic, functional, and domain-based analysis of in vivo 14-3-3 binding proteins involved in cytoskeletal regulation and cellular organization". Curr. Biol. ج. 14 ع. 16: 1436–50. DOI:10.1016/j.cub.2004.07.051. PMID:15324660.
  • Goehler H، Lalowski M، Stelzl U، وآخرون (2004). "A protein interaction network links GIT1, an enhancer of huntingtin aggregation, to Huntington's disease". Mol. Cell. ج. 15 ع. 6: 853–65. DOI:10.1016/j.molcel.2004.09.016. PMID:15383276.
  • Lin KT، Lu RM، Tarn WY (2004). "The WW domain-containing proteins interact with the early spliceosome and participate in pre-mRNA splicing in vivo". Mol. Cell. Biol. ج. 24 ع. 20: 9176–85. DOI:10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC:517884. PMID:15456888.
  • Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 2
جينات الكروموسوم 2
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة طب
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 2 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

  • ع
  • ن
  • ت
نووي
توصيل الرنا
عوامل الرنا قبل الرسول
سيتوسولي
التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية