TRPC4AP

Ідентифікатори

Символи

TRPC4AP, C20orf188, PPP1R158, TRRP4AP, TRUSS, transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein

Зовнішні ІД

OMIM: 608430 MGI: 1930751 HomoloGene: 9224 GeneCards: TRPC4AP

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphatase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium channel activity
Клітинна компонента	• клітинна мембрана • Cul4A-RING E3 ubiquitin ligase complex
Біологічний процес	• calcium ion transmembrane transport • Убіквітин-залежний протеоліз • hair follicle maturation • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


26133


56407

Ensembl


ENSG00000100991


ENSMUSG00000038324

UniProt


Q8TEL6


Q9JLV2

RefSeq (мРНК)


NM_015638 NM_199368


NM_001163452 NM_019828

RefSeq (білок)


NP_056453 NP_955400


NP_001156924 NP_062802

Локус (UCSC)

Хр. 20: 35 – 35.09 Mb

Хр. 2: 155.48 – 155.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRPC4AP (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily C member 4 associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 797 амінокислот, а молекулярна маса — 90 852^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAPVAAGS	GAGRGRRSAA	TVAAWGGWGG	RPRPGNILLQ	LRQGQLTGRG
LVRAVQFTET	FLTERDKQSK	WSGIPQLLLK	LHTTSHLHSD	FVECQNILKE
ISPLLSMEAM	AFVTEERKLT	QETTYPNTYI	FDLFGGVDLL	VEILMRPTIS
IRGQKLKISD	EMSKDCLSIL	YNTCVCTEGV	TKRLAEKNDF	VIFLFTLMTS
KKTFLQTATL	IEDILGVKKE	MIRLDEVPNL	SSLVSNFDQQ	QLANFCRILA
VTISEMDTGN	DDKHTLLAKN	AQQKKSLSLG	PSAAEINQAA	LLSIPGFVER
LCKLATRKVS	ESTGTASFLQ	ELEEWYTWLD	NALVLDALMR	VANEESEHNQ
ASIVFPPPGA	SEENGLPHTS	ARTQLPQSMK	IMHEIMYKLE	VLYVLCVLLM
GRQRNQVHRM	IAEFKLIPGL	NNLFDKLIWR	KHSASALVLH	GHNQNCDCSP
DITLKIQFLR	LLQSFSDHHE	NKYLLLNNQE	LNELSAISLK	ANIPEVEAVL
NTDRSLVCDG	KRGLLTRLLQ	VMKKEPAESS	FRFWQARAVE	SFLRGTTSYA
DQMFLLKRGL	LEHILYCIVD	SECKSRDVLQ	SYFDLLGELM	KFNVDAFKRF
NKYINTDAKF	QVFLKQINSS	LVDSNMLVRC	VTLSLDRFEN	QVDMKVAEVL
SECRLLAYIS	QVPTQMSFLF	RLINIIHVQT	LTQENVSCLN	TSLVILMLAR
RKERLPLYLR	LLQRMEHSKK	YPGFLLNNFH	NLLRFWQQHY	LHKDKDSTCL
ENSSCISFSY	WKETVSILLN	PDRQSPSALV	SYIEEPYMDI	DRDFTEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Choi S.H., Wright J.B., Gerber S.A., Cole M.D. (2010). Myc protein is stabilized by suppression of a novel E3 ligase complex in cancer cells. Genes Dev. 24: 1236—1241. PMID 20551172 DOI:10.1101/gad.1920310
Li T., Robert E.I., van Breugel P.C., Strubin M., Zheng N. (2010). A promiscuous alpha-helical motif anchors viral hijackers and substrate receptors to the CUL4-DDB1 ubiquitin ligase machinery. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 105—111. PMID 19966799 DOI:10.1038/nsmb.1719

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16181 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8TEL6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані