CACNA1G

CACNA1G
Ідентифікатори
Символи CACNA1G, Ca(V)T.1, Cav3.1, NBR13, SCA42, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G, SCA42ND
Зовнішні ІД OMIM: 604065 MGI: 1201678 HomoloGene: 22544 GeneCards: CACNA1G
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера, spinocerebellar ataxia type 42[1]
Реагує на сполуку
Анандамід, mibefradil, bepridil hydrochloride monohydrate[2]
Онтологія гена
Молекулярна функція

voltage-gated calcium channel activity
calcium channel activity
scaffold protein binding
voltage-gated ion channel activity
ion channel activity
voltage-gated calcium channel activity involved in AV node cell action potential
voltage-gated calcium channel activity involved SA node cell action potential
low voltage-gated calcium channel activity
voltage-gated sodium channel activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
voltage-gated calcium channel complex
цитоплазма
клітинна мембрана

Біологічний процес

membrane depolarization during action potential
calcium ion import
regulation of membrane potential
regulation of ion transmembrane transport
regulation of atrial cardiac muscle cell membrane depolarization
ion transport
регуляція серцевого ритму
positive regulation of calcium ion-dependent exocytosis
трансмембранний транспорт
потенціал дії
response to nickel cation
calcium ion transport
chemical synaptic transmission
AV node cell to bundle of His cell signaling
regulation of heart rate by cardiac conduction
SA node cell action potential
AV node cell action potential
SA node cell to atrial cardiac muscle cell signaling
membrane depolarization during AV node cell action potential
calcium ion transmembrane transport
membrane depolarization during SA node cell action potential
cardiac muscle cell action potential involved in contraction
neuronal action potential
sodium ion transmembrane transport

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8913
12291
Ensembl
ENSG00000006283
ENSMUSG00000020866
UniProt
O43497
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_001256324
NM_001256325
NM_001256326
NM_001256327
NM_001256328
NM_001256329
NM_001256330
NM_001256331
NM_001256332
NM_001256333
NM_001256334
NM_001256359
NM_001256360
NM_001256361
NM_018896
NM_198376
NM_198377
NM_198378
NM_198379
NM_198380
NM_198382
NM_198383
NM_198384
NM_198385
NM_198386
NM_198387
NM_198388
NM_198396
NM_198397
NM_001112813
NM_001177888
NM_001177890
NM_009783
RefSeq (білок)
NP_001243253
NP_001243254
NP_001243255
NP_001243256
NP_001243257
NP_001243258
NP_001243259
NP_001243260
NP_001243261
NP_001243262
NP_001243263
NP_001243288
NP_001243289
NP_001243290
NP_061496
NP_938190
NP_938191
NP_938192
NP_938193
NP_938194
NP_938196
NP_938197
NP_938198
NP_938199
NP_938200
NP_938201
NP_938202
NP_938406
н/д
Локус (UCSC) Хр. 17: 50.56 – 50.63 Mb Хр. 11: 94.3 – 94.37 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CACNA1G (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 377 амінокислот, а молекулярна маса — 262 472[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDEEEDGAGAEESGQPRSFMRLNDLSGAGGRPGPGSAEKDPGSADSEAEG
LPYPALAPVVFFYLSQDSRPRSWCLRTVCNPWFERISMLVILLNCVTLGM
FRPCEDIACDSQRCRILQAFDDFIFAFFAVEMVVKMVALGIFGKKCYLGD
TWNRLDFFIVIAGMLEYSLDLQNVSFSAVRTVRVLRPLRAINRVPSMRIL
VTLLLDTLPMLGNVLLLCFFVFFIFGIVGVQLWAGLLRNRCFLPENFSLP
LSVDLERYYQTENEDESPFICSQPRENGMRSCRSVPTLRGDGGGGPPCGL
DYEAYNSSSNTTCVNWNQYYTNCSAGEHNPFKGAINFDNIGYAWIAIFQV
ITLEGWVDIMYFVMDAHSFYNFIYFILLIIVGSFFMINLCLVVIATQFSE
TKQRESQLMREQRVRFLSNASTLASFSEPGSCYEELLKYLVYILRKAARR
LAQVSRAAGVRVGLLSSPAPLGGQETQPSSSCSRSHRRLSVHHLVHHHHH
HHHHYHLGNGTLRAPRASPEIQDRDANGSRRLMLPPPSTPALSGAPPGGA
ESVHSFYHADCHLEPVRCQAPPPRSPSEASGRTVGSGKVYPTVHTSPPPE
TLKEKALVEVAASSGPPTLTSLNIPPGPYSSMHKLLETQSTGACQSSCKI
SSPCLKADSGACGPDSCPYCARAGAGEVELADREMPDSDSEAVYEFTQDA
QHSDLRDPHSRRQRSLGPDAEPSSVLAFWRLICDTFRKIVDSKYFGRGIM
IAILVNTLSMGIEYHEQPEELTNALEISNIVFTSLFALEMLLKLLVYGPF
GYIKNPYNIFDGVIVVISVWEIVGQQGGGLSVLRTFRLMRVLKLVRFLPA
LQRQLVVLMKTMDNVATFCMLLMLFIFIFSILGMHLFGCKFASERDGDTL
PDRKNFDSLLWAIVTVFQILTQEDWNKVLYNGMASTSSWAALYFIALMTF
GNYVLFNLLVAILVEGFQAEEISKREDASGQLSCIQLPVDSQGGDANKSE
SEPDFFSPSLDGDGDRKKCLALVSLGEHPELRKSLLPPLIIHTAATPMSL
PKSTSTGLGEALGPASRRTSSSGSAEPGAAHEMKSPPSARSSPHSPWSAA
SSWTSRRSSRNSLGRAPSLKRRSPSGERRSLLSGEGQESQDEEESSEEER
ASPAGSDHRHRGSLEREAKSSFDLPDTLQVPGLHRTASGRGSASEHQDCN
GKSASGRLARALRPDDPPLDGDDADDEGNLSKGERVRAWIRARLPACCLE
RDSWSAYIFPPQSRFRLLCHRIITHKMFDHVVLVIIFLNCITIAMERPKI
DPHSAERIFLTLSNYIFTAVFLAEMTVKVVALGWCFGEQAYLRSSWNVLD
GLLVLISVIDILVSMVSDSGTKILGMLRVLRLLRTLRPLRVISRAQGLKL
VVETLMSSLKPIGNIVVICCAFFIIFGILGVQLFKGKFFVCQGEDTRNIT
NKSDCAEASYRWVRHKYNFDNLGQALMSLFVLASKDGWVDIMYDGLDAVG
VDQQPIMNHNPWMLLYFISFLLIVAFFVLNMFVGVVVENFHKCRQHQEEE
EARRREEKRLRRLEKKRRNLMLDDVIASGSSASAASEAQCKPYYSDYSRF
RLLVHHLCTSHYLDLFITGVIGLNVVTMAMEHYQQPQILDEALKICNYIF
TVIFVLESVFKLVAFGFRRFFQDRWNQLDLAIVLLSIMGITLEEIEVNAS
LPINPTIIRIMRVLRIARVLKLLKMAVGMRALLDTVMQALPQVGNLGLLF
MLLFFIFAALGVELFGDLECDETHPCEGLGRHATFRNFGMAFLTLFRVST
GDNWNGIMKDTLRDCDQESTCYNTVISPIYFVSFVLTAQFVLVNVVIAVL
MKHLEESNKEAKEEAELEAELELEMKTLSPQPHSPLGSPFLWPGVEGPDS
PDSPKPGALHPAAHARSASHFSLEHPTDRQLFDTISLLIQGSLEWELKLM
DELAGPGGQPSAFPSAPSLGGSDPQIPLAEMEALSLTSEIVSEPSCSLAL
TDDSLPDDMHTLLLSALESNMQPHPTELPGPDLLTVRKSGVSRTHSLPND
SYMCRHGSTAEGPLGHRGWGLPKAQSGSVLSVHSQPADTSYILQLPKDAP
HLLQPHSAPTWGTIPKLPPPGRSPLAQRPLRRQAAIRTDSLDVQGLGSRE
DLLAEVSGPSPPLARAYSFWGQSSTQAQQHSRSHSKISKHMTPPAPCPGP
EPNWGKGPPETRSSLELDTELSWISGDLLPPGGQEEPPSPRDLKKCYSVE
AQSCQRRPTSWLDEQRRHSIAVSCLDSGSQPHLGTDPSNLGGQPLGGPGS
RPKKKLSPPSITIDPPESQGPRTPPSPGICLRRRAPSSDSKDPLASGPPD
SMAASPSPKKDVLSLSGLSSDPADLDP

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

  • Mittman S., Guo J., Agnew W.S. (1999). Structure and alternative splicing of the gene encoding alpha1G, a human brain T calcium channel alpha1 subunit. Neurosci. Lett. 274: 143—146. PMID 10548410 DOI:10.1016/S0304-3940(99)00716-8
  • Cribbs L.L., Gomora J.C., Daud A.N., Lee J.-H., Perez-Reyes E. (2000). Molecular cloning and functional expression of ca(v)3.1c, a T-type calcium channel from human brain. FEBS Lett. 466: 54—58. PMID 10648811 DOI:10.1016/S0014-5793(99)01756-1
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Toyota M., Ho C., Ohe-Toyota M., Baylin S.B., Issa J.-P.J. (1999). Inactivation of CACNA1G, a T-type calcium channel gene, by aberrant methylation of its 5' CpG island in human tumors. Cancer Res. 59: 4535—4541. PMID 10493502

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CACNA1G переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 G переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1394 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.
  6. UniProt, O43497 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 17
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Ліганд-залежні
Потенціалкеровані
  • L-тип/Cavα
  • N-тип/Cavα2.2
  • P-тип/Cavα
  • Q-тип/Cavα2.1
  • R-тип/Cavα2.3
  • T-тип/Cavα
 
постійно відчинені
Протончутливі
  • Кислота
Потенціалкеровані
 
K+: Калієві канали
Кальцій-активовані
Вхідного випрямлення
Двопородоменні
Потенціалкеровані
 
Різні
Cl: Хлорні канали
H+: Протонні канали
M+: CNG-канали
M+: TRP-канали
H2O (+ розчини): Порини
Цитоплазма: Щілинні контакти
 
За механізмом залежності
Ion channel class