KCNIP2 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | KCNIP2, KCHIP2, potassium voltage-gated channel interacting protein 2 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604661 MGI: 2135916 HomoloGene: 23710 GeneCards: KCNIP2 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • calcium ion binding • potassium channel activity • ER retention sequence binding • transmembrane transporter binding • protein N-terminus binding • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • A-type (transient outward) potassium channel activity • identical protein binding • voltage-gated potassium channel activity involved in cardiac muscle cell action potential repolarization • potassium channel regulator activity |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • potassium channel complex • voltage-gated potassium channel complex |
---|
Біологічний процес | • clustering of voltage-gated potassium channels • м'язове скорочення • regulation of heart contraction • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • detection of calcium ion • potassium ion transport • membrane repolarization • regulation of cation channel activity • potassium ion transmembrane transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chemical synaptic transmission • membrane repolarization during cardiac muscle cell action potential • potassium ion export across plasma membrane • positive regulation of potassium ion export across plasma membrane • positive regulation of voltage-gated potassium channel activity • cardiac conduction |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/0/09/PBB_GE_KCNIP2_221321_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_KCNIP2_221321_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | NM_014591 NM_173191 NM_173192 NM_173193 NM_173194
| NM_173195 NM_173197 NM_173342 |
| | NM_001276358 NM_030716 NM_145703 NM_145704 |
|
---|
RefSeq (білок) | NP_055406 NP_775283 NP_775284 NP_775285 NP_775286
| NP_775287 NP_775289 |
| | NP_001263287 NP_109641 NP_663749 NP_663750 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 10: 101.83 – 101.84 Mb | Хр. 19: 45.78 – 45.8 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
KCNIP2 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 30 907[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MRGQGRKESL | | SDSRDLDGSY | | DQLTGHPPGP | | TKKALKQRFL | | KLLPCCGPQA |
LPSVSETLAA | | PASLRPHRPR | | LLDPDSVDDE | | FELSTVCHRP | | EGLEQLQEQT |
KFTRKELQVL | | YRGFKNECPS | | GIVNEENFKQ | | IYSQFFPQGD | | SSTYATFLFN |
AFDTNHDGSV | | SFEDFVAGLS | | VILRGTVDDR | | LNWAFNLYDL | | NKDGCITKEE |
MLDIMKSIYD | | MMGKYTYPAL | | REEAPREHVE | | SFFQKMDRNK | | DGVVTIEEFI |
ESCQKDENIM | | RSMQLFDNVI |
Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Література
- Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Deschenes I., Tomaselli G.F. (2002). Modulation of Kv4.3 current by accessory subunits. FEBS Lett. 528: 183—188. PMID 12297301 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03296-9
- Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15522 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9NS61 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| |
---|
| Ліганд-залежні | |
---|
| Потенціалкеровані | - L-тип/Cavα
- N-тип/Cavα2.2
- P-тип/Cavα
- Q-тип/Cavα2.1
- R-тип/Cavα2.3
- T-тип/Cavα
- α2δ-субодиниці
- β-компоненти
- γ-компоненти
|
---|
|
| | |
---|
| постійно відчинені | |
---|
| Протончутливі | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | K+: Калієві канали |
---|
| Кальцій-активовані | |
---|
| Вхідного випрямлення | |
---|
| Двопородоменні | |
---|
| Потенціалкеровані | |
---|
|
| | | | |
|