APC (ген)

APC
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1DEB, 1EMU, 1JPP, 1M5I, 1T08, 1TH1, 1V18, 2RQU, 3AU3, 3NMW, 3NMX, 3NMZ, 3QHE, 3RL7, 3RL8, 3T7U, 4G69, 4YJL, 4YK6, 4YJE

Ідентифікатори
Символи APC, BTPS2, DP2, DP2.5, DP3, GS, PPP1R46, adenomatous polyposis coli, WNT signaling pathway regulator, Genes
Зовнішні ІД OMIM: 611731 MGI: 88039 HomoloGene: 30950 GeneCards: APC
Пов'язані генетичні захворювання
APC-related attenuated familial adenomatous polyposis, liver carcinoma, large intestine adenocarcinoma, large intestine cancer, desmoid disease, hereditary, синдром Ґарднера, familial adenomatous polyposis[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• gamma-catenin binding
• protein kinase binding
• microtubule plus-end binding
• microtubule binding
• cadherin binding
• protein kinase regulator activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• beta-catenin binding
• ubiquitin protein ligase binding
• identical protein binding
• dynein complex binding

Клітинна компонента

• цитоскелет
• Адгезивні контакти
• beta-catenin destruction complex
• нуклеоплазма
• цитоплазма
• cell projection
• гіалоплазма
• catenin complex
• міжклітинні контакти
• клітинне ядро
• lamellipodium
• мембрана
• Wnt signalosome
• центросома
• кінетохор
• bicellular tight junction
• ruffle membrane
• клітинна мембрана
• lateral plasma membrane
• perinuclear region of cytoplasm
• мікротрубочка
• cytoplasmic microtubule

Біологічний процес

• negative regulation of cell population proliferation
• negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
• mitotic spindle assembly checkpoint signaling
• positive regulation of cell migration
• GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process
• bicellular tight junction assembly
• regulation of microtubule-based process
• positive regulation of pseudopodium assembly
• regulation of attachment of spindle microtubules to kinetochore
• cellular response to DNA damage stimulus
• negative regulation of Wnt signaling pathway
• адгезія клітин
• mitotic cytokinesis
• negative regulation of microtubule depolymerization
• positive regulation of apoptotic process
• canonical Wnt signaling pathway
• cell migration
• beta-catenin destruction complex assembly
• beta-catenin destruction complex disassembly
• negative regulation of canonical Wnt signaling pathway
• Wnt signaling pathway
• protein deubiquitination
• GO:1901047 insulin receptor signaling pathway
• positive regulation of cell death
• protein homooligomerization
• positive regulation of protein localization to centrosome
• GO:0034622 protein-containing complex assembly
• cell fate specification
• pattern specification process
• регуляція диференціювання клітин
• positive regulation of cold-induced thermogenesis

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
324
11789
Ensembl
ENSG00000134982
ENSMUSG00000005871
UniProt
P25054
Q61315
RefSeq (мРНК)
NM_001127511
NM_000038
NM_001127510
NM_007462
NM_001360979
NM_001360980
RefSeq (білок)
NP_000029
NP_001120982
NP_001120983
NP_001341824
NP_001341825
NP_001341826
NP_001341827
NP_001341828
NP_001341829
NP_001341830
NP_001341831
NP_001341832
NP_001341833
NP_001341834
NP_001341835
н/д
Локус (UCSC) н/д Хр. 18: 34.22 – 34.32 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

APC (англ. APC, WNT signaling pathway regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 843 амінокислот, а молекулярна маса — 311 646[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAASYDQLLKQVEALKMENSNLRQELEDNSNHLTKLETEASNMKEVLKQ
LQGSIEDEAMASSGQIDLLERLKELNLDSSNFPGVKLRSKMSLRSYGSRE
GSVSSRSGECSPVPMGSFPRRGFVNGSRESTGYLEELEKERSLLLADLDK
EEKEKDWYYAQLQNLTKRIDSLPLTENFSLQTDMTRRQLEYEARQIRVAM
EEQLGTCQDMEKRAQRRIARIQQIEKDILRIRQLLQSQATEAERSSQNKH
ETGSHDAERQNEGQGVGEINMATSGNGQGSTTRMDHETASVLSSSSTHSA
PRRLTSHLGTKVEMVYSLLSMLGTHDKDDMSRTLLAMSSSQDSCISMRQS
GCLPLLIQLLHGNDKDSVLLGNSRGSKEARARASAALHNIIHSQPDDKRG
RREIRVLHLLEQIRAYCETCWEWQEAHEPGMDQDKNPMPAPVEHQICPAV
CVLMKLSFDEEHRHAMNELGGLQAIAELLQVDCEMYGLTNDHYSITLRRY
AGMALTNLTFGDVANKATLCSMKGCMRALVAQLKSESEDLQQVIASVLRN
LSWRADVNSKKTLREVGSVKALMECALEVKKESTLKSVLSALWNLSAHCT
ENKADICAVDGALAFLVGTLTYRSQTNTLAIIESGGGILRNVSSLIATNE
DHRQILRENNCLQTLLQHLKSHSLTIVSNACGTLWNLSARNPKDQEALWD
MGAVSMLKNLIHSKHKMIAMGSAAALRNLMANRPAKYKDANIMSPGSSLP
SLHVRKQKALEAELDAQHLSETFDNIDNLSPKASHRSKQRHKQSLYGDYV
FDTNRHDDNRSDNFNTGNMTVLSPYLNTTVLPSSSSSRGSLDSSRSEKDR
SLERERGIGLGNYHPATENPGTSSKRGLQISTTAAQIAKVMEEVSAIHTS
QEDRSSGSTTELHCVTDERNALRRSSAAHTHSNTYNFTKSENSNRTCSMP
YAKLEYKRSSNDSLNSVSSSDGYGKRGQMKPSIESYSEDDESKFCSYGQY
PADLAHKIHSANHMDDNDGELDTPINYSLKYSDEQLNSGRQSPSQNERWA
RPKHIIEDEIKQSEQRQSRNQSTTYPVYTESTDDKHLKFQPHFGQQECVS
PYRSRGANGSETNRVGSNHGINQNVSQSLCQEDDYEDDKPTNYSERYSEE
EQHEEEERPTNYSIKYNEEKRHVDQPIDYSLKYATDIPSSQKQSFSFSKS
SSGQSSKTEHMSSSSENTSTPSSNAKRQNQLHPSSAQSRSGQPQKAATCK
VSSINQETIQTYCVEDTPICFSRCSSLSSLSSAEDEIGCNQTTQEADSAN
TLQIAEIKEKIGTRSAEDPVSEVPAVSQHPRTKSSRLQGSSLSSESARHK
AVEFSSGAKSPSKSGAQTPKSPPEHYVQETPLMFSRCTSVSSLDSFESRS
IASSVQSEPCSGMVSGIISPSDLPDSPGQTMPPSRSKTPPPPPQTAQTKR
EVPKNKAPTAEKRESGPKQAAVNAAVQRVQVLPDADTLLHFATESTPDGF
SCSSSLSALSLDEPFIQKDVELRIMPPVQENDNGNETESEQPKESNENQE
KEAEKTIDSEKDLLDDSDDDDIEILEECIISAMPTKSSRKAKKPAQTASK
LPPPVARKPSQLPVYKLLPSQNRLQPQKHVSFTPGDDMPRVYCVEGTPIN
FSTATSLSDLTIESPPNELAAGEGVRGGAQSGEFEKRDTIPTEGRSTDEA
QGGKTSSVTIPELDDNKAEEGDILAECINSAMPKGKSHKPFRVKKIMDQV
QQASASSSAPNKNQLDGKKKKPTSPVKPIPQNTEYRTRVRKNADSKNNLN
AERVFSDNKDSKKQNLKNNSKVFNDKLPNNEDRVRGSFAFDSPHHYTPIE
GTPYCFSRNDSLSSLDFDDDDVDLSREKAELRKAKENKESEAKVTSHTEL
TSNQQSANKTQAIAKQPINRGQPKPILQKQSTFPQSSKDIPDRGAATDEK
LQNFAIENTPVCFSHNSSLSSLSDIDQENNNKENEPIKETEPPDSQGEPS
KPQASGYAPKSFHVEDTPVCFSRNSSLSSLSIDSEDDLLQECISSAMPKK
KKPSRLKGDNEKHSPRNMGGILGEDLTLDLKDIQRPDSEHGLSPDSENFD
WKAIQEGANSIVSSLHQAAAAACLSRQASSDSDSILSLKSGISLGSPFHL
TPDQEEKPFTSNKGPRILKPGEKSTLETKKIESESKGIKGGKKVYKSLIT
GKVRSNSEISGQMKQPLQANMPSISRGRTMIHIPGVRNSSSSTSPVSKKG
PPLKTPASKSPSEGQTATTSPRGAKPSVKSELSPVARQTSQIGGSSKAPS
RSGSRDSTPSRPAQQPLSRPIQSPGRNSISPGRNGISPPNKLSQLPRTSS
PSTASTKSSGSGKMSYTSPGRQMSQQNLTKQTGLSKNASSIPRSESASKG
LNQMNNGNGANKKVELSRMSSTKSSGSESDRSERPVLVRQSTFIKEAPSP
TLRRKLEESASFESLSPSSRPASPTRSQAQTPVLSPSLPDMSLSTHSSVQ
AGGWRKLPPNLSPTIEYNDGRPAKRHDIARSHSESPSRLPINRSGTWKRE
HSKHSSSLPRVSTWRRTGSSSSILSASSESSEKAKSEDEKHVNSISGTKQ
SKENQVSAKGTWRKIKENEFSPTNSTSQTVSSGATNGAESKTLIYQMAPA
VSKTEDVWVRIEDCPINNPRSGRSPTGNTPPVIDSVSEKANPNIKDSKDN
QAKQNVGNGSVPMRTVGLENRLNSFIQVDAPDQKGTEIKPGQNNPVPVSE
TNESSIVERTPFSSSSSSKHSSPSGTVAARVTPFNYNPSPRKSSADSTSA
RPSQIPTPVNNNTKKRDSKTDSTESSGTQSPKRHSGSYLVTSV

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

  • Su L.-K., Vogelstein B., Kinzler K.W. (1993). Association of the APC tumor suppressor protein with catenins. Science. 262: 1734—1737. PMID 8259519 DOI:10.1126/science.8259519
  • Bu W., Su L.-K. (2003). Characterization of functional domains of human EB1 family proteins. J. Biol. Chem. 278: 49721—49731. PMID 14514668 DOI:10.1074/jbc.M306194200
  • Choi J., Park S.Y., Costantini F., Jho E.-H., Joo C.-K. (2004). Adenomatous polyposis coli is down-regulated by the ubiquitin-proteasome pathway in a process facilitated by Axin. J. Biol. Chem. 279: 49188—49198. PMID 15355978 DOI:10.1074/jbc.M404655200
  • Tran H., Hamada F., Schwarz-Romond T., Bienz M. (2008). Trabid, a new positive regulator of Wnt-induced transcription with preference for binding and cleaving K63-linked ubiquitin chains. Genes Dev. 22: 528—542. PMID 18281465 DOI:10.1101/gad.463208
  • Zaoui K., Benseddik K., Daou P., Salaun D., Badache A. (2010). ErbB2 receptor controls microtubule capture by recruiting ACF7 to the plasma membrane of migrating cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 18517—18522. PMID 20937854 DOI:10.1073/pnas.1000975107
  • Pfister A.S., Tanneberger K., Schambony A., Behrens J. (2012). Amer2 protein is a novel negative regulator of Wnt/beta-Catenin signaling involved in neuroectodermal patterning. J. Biol. Chem. 287: 1734—1741. PMID 22128170 DOI:10.1074/jbc.M111.308650

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з APC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:583 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. ↑ UniProt, P25054 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 5
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
Людські
Мікрофіламенти
та актин-зв'язуючі білки
Міофіламенти
Актин
Міозин
Інші
Інші
Проміжні філаменти
Тип 1/2
(Кератин,
Цитокератин)
Епітеліальні кератини
(м'які альфа-кератини)
Кератини волосся
(жорсткі альфа-кератини)
Незгруповані альфа
Не-альфа
  • Бета-кератин
Тип 3
Тип 4
Тип 5
Мікротрубочки
та пов'язані білки
Тубулін
Кінезин
Динеїн
Інші
Катеніни
Мембранні
Інші
Нелюдські