Кератин-16 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | KRT16, CK16, FNEPPK, K16, K1CP, KRT16A, NEPPK, PC1, keratin 16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 148067 MGI: 96690 HomoloGene: 21145 GeneCards: KRT16 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • structural constituent of cytoskeleton • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • structural molecule activity |
---|
Клітинна компонента | • екзосома • цитоскелет • Проміжні філаменти • клітинне ядро • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • morphogenesis of an epithelium • hair cycle • keratinocyte migration • GO:0010260 старіння людини • проліферація • inflammatory response • negative regulation of cell migration • вроджений імунітет • cytoskeleton organization • keratinocyte differentiation • epidermis development • intermediate filament cytoskeleton organization • establishment of skin barrier • keratinization • cornification |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 41.61 – 41.62 Mb | Хр. 11: 100.14 – 100.14 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
Кератин-16 (англ. Keratin 16) – білок, який кодується геном KRT16, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 51 268[4].
Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.
Мутації в цьому гені призводять до рідкісного захворювання пахіоніхія спадкова[en].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MTTCSRQFTS | | SSSMKGSCGI | | GGGIGGGSSR | | ISSVLAGGSC | | RAPSTYGGGL |
SVSSRFSSGG | | ACGLGGGYGG | | GFSSSSSFGS | | GFGGGYGGGL | | GAGFGGGLGA |
GFGGGFAGGD | | GLLVGSEKVT | | MQNLNDRLAS | | YLDKVRALEE | | ANADLEVKIR |
DWYQRQRPSE | | IKDYSPYFKT | | IEDLRNKIIA | | ATIENAQPIL | | QIDNARLAAD |
DFRTKYEHEL | | ALRQTVEADV | | NGLRRVLDEL | | TLARTDLEMQ | | IEGLKEELAY |
LRKNHEEEML | | ALRGQTGGDV | | NVEMDAAPGV | | DLSRILNEMR | | DQYEQMAEKN |
RRDAETWFLS | | KTEELNKEVA | | SNSELVQSSR | | SEVTELRRVL | | QGLEIELQSQ |
LSMKASLENS | | LEETKGRYCM | | QLSQIQGLIG | | SVEEQLAQLR | | CEMEQQSQEY |
QILLDVKTRL | | EQEIATYRRL | | LEGEDAHLSS | | QQASGQSYSS | | REVFTSSSSS |
SSRQTRPILK | | EQSSSSFSQG | | QSS |
Література
- Raychaudhury A., Marchuk D., Lindhurst M., Fuchs E. (1986). Three tightly linked genes encoding human type I keratins: conservation of sequence in the 5'-untranslated leader and 5'-upstream regions of coexpressed keratin genes. Mol. Cell. Biol. 6: 539—548. PMID 2431270 DOI:10.1128/MCB.6.2.539
- Rosenberg M., Raychaudhury A., Shows T.B., le Beau M.M., Fuchs E. (1988). A group of type I keratin genes on human chromosome 17: characterization and expression. Mol. Cell. Biol. 8: 722—736. PMID 2451124 DOI:10.1128/MCB.8.2.722
- Paladini R.D., Takahashi K., Gant T.M., Coulombe P.A. (1995). cDNA cloning and bacterial expression of the human type I keratin 16. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 517—523. PMID 7487986 DOI:10.1006/bbrc.1995.2495
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Connors J.B., Rahil A.K., Smith F.J.D., McLean W.H.I., Milstone L.M. (2001). Delayed-onset pachyonychia congenita associated with a novel mutation in the central 2B domain of keratin 16. Br. J. Dermatol. 144: 1058—1062. PMID 11359398 DOI:10.1046/j.1365-2133.2001.04199.x
- Paris F., Hurtado C., Azon A., Aguado L., Vizmanos J.L. (2013). A new KRT16 mutation associated with a phenotype of pachyonychia congenita. Exp. Dermatol. 22: 838—839. PMID 24118415 DOI:10.1111/exd.12262
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6423 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 30 січня 2017.
- ↑ UniProt, P08779 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
Людські | Мікрофіламенти та актин-зв'язуючі білки | Міофіламенти | Актин | |
---|
Міозин | - I
- II
- III
- V
- VI
- VII
- IX
- X
- XV
- XVIII
- Легкий ланцюг міозину
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Інші | |
---|
|
---|
Проміжні філаменти | Тип 1/2 (Кератин, Цитокератин) | Епітеліальні кератини (м'які альфа-кератини) | - тип I/хромосома 17
- хромосома 12
- інші
|
---|
Кератини волосся (жорсткі альфа-кератини) | |
---|
Незгруповані альфа | |
---|
Не-альфа | |
---|
|
---|
Тип 3 | |
---|
Тип 4 | - Інтернексин
- Нестин
- Нейрофіламент
- Синемін
- Синкоїлін
|
---|
Тип 5 | |
---|
|
---|
Мікротрубочки та пов'язані білки | |
---|
Катеніни | |
---|
Мембранні | |
---|
Інші | |
---|
|
---|
Нелюдські | |
---|