Embecovirus

Embecovirus
Phân loại virus e
(kph): Virus
Vực: Riboviria
Ngành: incertae sedis
Bộ: Nidovirales
Họ: Coronaviridae
Chi: Betacoronavirus
Phân chi: Embecovirus
Species[1]
  • Betacoronavirus 1
  • China Rattus coronavirus HKU24
  • Human coronavirus HKU1
  • Murine coronavirus

Embecovirus là một phân chi của coronavirus trong chi Betacoronavirus.[2] Các virut trong phân chi này, không giống như các coronavirus khác, có gen hemagglutinin esterase (HE).[3] Các virut trong thế hệ con trước đây được gọi là coronavirus nhóm 2a.[4][5]

Cấu trúc

Các virut của phân chi này, giống như các coronavirus khác, có lớp màng bọc lipid trong đó các protein cấu trúc màng (M), vỏ (E) và gai (S) được neo lại.[6] Không giống như các coronavirus khác, virus trong thế hệ con này cũng có một protein cấu trúc giống như gai ngắn hơn gọi là hemagglutinin esterase (HE).[3][7]

Xem thêm

  • Sarbecovirus (nhóm 2b)
  • Merbecovirus (nhóm 2c)
  • Nobecovirus (nhóm 2d)

Tham khảo

  1. ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release” (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). tháng 10 năm 2018. Lưu trữ bản gốc ngày 4 tháng 3 năm 2018. Truy cập ngày 24 tháng 1 năm 2019.
  2. ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release”. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (bằng tiếng Anh). tháng 10 năm 2018. Bản gốc (html) lưu trữ ngày 4 tháng 3 năm 2018. Truy cập ngày 24 tháng 1 năm 2019.
  3. ^ a b Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (ngày 24 tháng 8 năm 2010). “Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis”. Viruses. 2 (8): 1804–1820. doi:10.3390/v2081803. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
  4. ^ Woo, Patrick C. Y.; Wang, Ming; Lau, Susanna K. P.; Xu, Huifang; Poon, Rosana W. S.; Guo, Rongtong; Wong, Beatrice H. L.; Gao, Kai; Tsoi, Hoi-wah (tháng 2 năm 2007). “Comparative Analysis of Twelve Genomes of Three Novel Group 2c and Group 2d Coronaviruses Reveals Unique Group and Subgroup Features”. Journal of Virology. 81 (4): 1574–1585. doi:10.1128/JVI.02182-06. ISSN 0022-538X. PMC 1797546. PMID 17121802. See figure 2.
  5. ^ Wong, Antonio C. P.; Li, Xin; Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y. (ngày 20 tháng 2 năm 2019). “Global Epidemiology of Bat Coronaviruses”. Viruses. 11 (2): 174. doi:10.3390/v11020174. ISSN 1999-4915. PMC 6409556. PMID 30791586. CoVs are classified into four genera, Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus and Deltacoronavirus. Within Betacoronavirus, they can be further subclassified into lineages A, B, C and D [1]. In 2018, these four lineages were reclassified as subgenera of Betacoronavirus, and renamed as Embecovirus (previous lineage A), Sarbecovirus (previous lineage B), Merbecovirus (previous lineage C) and Nobecovirus (previous lineage D) [2]. In addition, a fifth subgenus, Hibecovirus, was also included (Figure 1) [2].
  6. ^ The Molecular Biology of Coronaviruses; III. Structure of Virions; A. Virion Morphology (bằng tiếng Anh)
  7. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung (ngày 24 tháng 8 năm 2010). “Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis”. Viruses. 2 (8): 1804–1820. doi:10.3390/v2081803. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. The presence of HE genes exclusively in members of Betacoronavirus subgroup A, but not members of Betacoronavirus subgroup B, C and D suggested that the recombination had probably occurred in the ancestor of members of Betacoronavirus subgroup A, after diverging from the ancestor of other subgroups of Betacoronavirus.
Thẻ nhận dạng đơn vị phân loại
  • x
  • t
  • s
Phân loại họ Coronaviridae
Higher taxonomy: Riboviria > Orthornavirae > Pisuviricota > Pisoniviricetes > Nidovirales > Cornidovirineae > Coronaviridae
Orthocoronavirinae
Alphacoronavirus
Colacovirus
  • Bat coronavirus CDPHE15
Decacovirus
  • Bat coronavirus HKU10
  • Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
Duvinacovirus
  • Human coronavirus 229E
Luchacovirus
  • Lucheng Rn rat coronavirus
Minacovirus
  • Mink coronavirus 1
Minunacovirus
  • Miniopterus bat coronavirus 1
  • Miniopterus bat coronavirus HKU8
Myotacovirus
  • Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
Nyctacovirus
  • Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
  • Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
Pedacovirus
  • Porcine epidemic diarrhea virus
  • Scotophilus bat coronavirus 512
Rhinacovirus
  • Rhinolophus bat coronavirus HKU2
Setracovirus
  • Human coronavirus NL63
  • NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
Soracovirus
  • Sorex araneus coronavirus T14
Sunacovirus
  • Suncus murinus coronavirus X74
Tegacovirus
Betacoronavirus
Embecovirus
  • Betacoronavirus 1
    • Bovine coronavirus
    • Human coronavirus OC43
  • China Rattus coronavirus HKU24
  • Human coronavirus HKU1
  • Murine coronavirus
    • Rat coronavirus
  • Myodes coronavirus 2JL14
Hibecovirus
  • Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
Merbecovirus
Nobecovirus
  • Eidolon bat coronavirus C704
  • Rousettus bat coronavirus GCCDC1
  • Rousettus bat coronavirus HKU9
Sarbecovirus
Gammacoronavirus
Brangacovirus
  • Goose coronavirus CB17
Cegacovirus
  • Beluga whale coronavirus SW1
Igacovirus
  • Avian coronavirus
  • Avian coronavirus 9203
  • Duck coronavirus 2714
Deltacoronavirus
Andecovirus
  • Wigeon coronavirus HKU20
Buldecovirus
  • Bulbul coronavirus HKU11
  • Common moorhen coronavirus HKU21
  • Coronavirus HKU15
  • Munia coronavirus HKU13
  • White-eye coronavirus HKU16
Herdecovirus
  • Night heron coronavirus HKU19
Letovirinae
Alphaletovirus
Milecovirus
  • Microhyla letovirus 1
Source: ICTV –– Trang Wikispecies Wikispecies