ZFYVE27

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1X4U

Ідентифікатори

Символи

ZFYVE27, PROTRUDIN, SPG33, zinc finger FYVE-type containing 27

Зовнішні ІД

OMIM: 610243 MGI: 1919602 HomoloGene: 16939 GeneCards: ZFYVE27

Пов'язані генетичні захворювання

hereditary spastic paraplegia 33^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • protein self-association
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • аксон • ендосома • recycling endosome membrane • growth cone membrane • дендрит (нейробіологія) • клітинна мембрана • cell projection • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • endoplasmic reticulum tubular network • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• protein localization to plasma membrane • neuron projection development • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • vesicle-mediated transport • positive regulation of axon extension • endoplasmic reticulum tubular network formation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


118813


319740

Ensembl


ENSG00000155256


ENSMUSG00000018820

UniProt


Q5T4F4


Q3TXX3

RefSeq (мРНК)

NM_001002261 NM_001002262 NM_001174119 NM_001174120 NM_001174121
NM_001174122 NM_144588


NM_001164531 NM_177319

RefSeq (білок)

NP_001002261 NP_001002262 NP_001167590 NP_001167591 NP_001167592
NP_001167593 NP_653189


NP_001158003 NP_796293

Локус (UCSC)

Хр. 10: 97.74 – 97.76 Mb

Хр. 19: 42.15 – 42.18 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZFYVE27 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 27) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 45 843^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQTSEREGSG	PELSPSVMPE	APLESPPFPT	KSPAFDLFNL	VLSYKRLEIY
LEPLKDAGDG	VRYLLRWQMP	LCSLLTCLGL	NVLFLTLNEG	AWYSVGALMI
SVPALLGYLQ	EVCRARLPDS	ELMRRKYHSV	RQEDLQRGRL	SRPEAVAEVK
SFLIQLEAFL	SRLCCTCEAA	YRVLHWENPV	VSSQFYGALL	GTVCMLYLLP
LCWVLTLLNS	TLFLGNVEFF	RVVSEYRASL	QQRMNPKQEE	HAFESPPPPD
VGGKDGLMDS	TPALTPTEDL	TPGSVEEAEE	AEPDEEFKDA	IEETHLVVLE
DDEGAPCPAE	DELALQDNGF	LSKNEVLRSK	VSRLTERLRK	RYPTNNFGNC
TGCSATFSVL	KKRRSCSNCG	NSFCSRCCSF	KVPKSSMGAT	APEAQRETVF
VCASCNQTLS	K

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, клітинних відростках, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Shirane M., Nakayama K.I. (2006). Protrudin induces neurite formation by directional membrane trafficking. Science. 314: 818—821. PMID 17082457 DOI:10.1126/science.1134027
Shirane M., Ogawa M., Motoyama J., Nakayama K.I. (2008). Regulation of apoptosis and neurite extension by FKBP38 is required for neural tube formation in the mouse. Genes Cells. 13: 635—651. PMID 18459960 DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01194.x
Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein. J. Biol. Chem. 284: 13766—13777. PMID 19289470 DOI:10.1074/jbc.M807938200
Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation. Mol. Biol. Cell. 22: 4602—4620. PMID 21976701 DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068
Martignoni M., Riano E., Rugarli E.I. (2008). The role of ZFYVE27/protrudin in hereditary spastic paraplegia. Am. J. Hum. Genet. 83: 127—130. PMID 18606302 DOI:10.1016/j.ajhg.2008.05.014

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ZFYVE27 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26559 (англ.) . Архів оригіналу за 27 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5T4F4 (англ.) . Архів оригіналу за 19 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.