ZFYVE16 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZFYVE16, PPP1R69, zinc finger FYVE-type containing 16 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 608880 MGI: 2145181 HomoloGene: 8826 GeneCards: ZFYVE16 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • 1-phosphatidylinositol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • ендосома • early endosome • early endosome membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма |
---|
Біологічний процес | • regulation of endocytosis • endosomal transport • protein targeting to lysosome • BMP signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • vesicle organization |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001105251 NM_001284236 NM_001284237 NM_014733 NM_001349434 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001098721 NP_001271165 NP_001271166 NP_055548 NP_001336363 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 5: 80.41 – 80.48 Mb | Хр. 13: 92.62 – 92.67 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZFYVE16 (англ. Zinc finger FYVE-type containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 539 амінокислот, а молекулярна маса — 168 903[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MDSYFKAAVS | | DLDKLLDDFE | | QNPDEQDYLQ | | DVQNAYDSNH | | CSVSSELASS |
QRTSLLPKDQ | | ECVNSCASSE | | TSYGTNESSL | | NEKTLKGLTS | | IQNEKNVTGL |
DLLSSVDGGT | | SDEIQPLYMG | | RCSKPICDLI | | SDMGNLVHAT | | NSEEDIKKLL |
PDDFKSNADS | | LIGLDLSSVS | | DTPCVSSTDH | | DSDTVREQQN | | DISSELQNRE |
IGGIKELGIK | | VDTTLSDSYN | | YSGTENLKDK | | KIFNQLESIV | | DFNMSSALTR |
QSSKMFHAKD | | KLQHKSQPCG | | LLKDVGLVKE | | EVDVAVITAA | | ECLKEEGKTS |
ALTCSLPKNE | | DLCLNDSNSR | | DENFKLPDFS | | FQEDKTVIKQ | | SAQEDSKSLD |
LKDNDVIQDS | | SSALHVSSKD | | VPSSLSCLPA | | SGSMCGSLIE | | SKARGDFLPQ |
HEHKDNIQDA | | VTIHEEIQNS | | VVLGGEPFKE | | NDLLKQEKCK | | SILLQSLIEG |
MEDRKIDPDQ | | TVIRAESLDG | | GDTSSTVVES | | QEGLSGTHVP | | ESSDCCEGFI |
NTFSSNDMDG | | QDLDYFNIDE | | GAKSGPLISD | | AELDAFLTEQ | | YLQTTNIKSF |
EENVNDSKSQ | | MNQIDMKGLD | | DGNINNIYFN | | AEAGAIGESH | | GINIICEIVD |
KQNTIENGLS | | LGEKSTIPVQ | | QGLPTSKSEI | | TNQLSVSDIN | | SQSVGGARPK |
QLFSLPSRTR | | SSKDLNKPDV | | PDTIESEPST | | ADTVVPITCA | | IDSTADPQVS |
FNSNYIDIES | | NSEGGSSFVT | | ANEDSVPENT | | CKEGLVLGQK | | QPTWVPDSEA |
PNCMNCQVKF | | TFTKRRHHCR | | ACGKVFCGVC | | CNRKCKLQYL | | EKEARVCVVC |
YETISKAQAF | | ERMMSPTGSN | | LKSNHSDECT | | TVQPPQENQT | | SSIPSPATLP |
VSALKQPGVE | | GLCSKEQKRV | | WFADGILPNG | | EVADTTKLSS | | GSKRCSEDFS |
PLSPDVPMTV | | NTVDHSHSTT | | VEKPNNETGD | | ITRNEIIQSP | | ISQVPSVEKL |
SMNTGNEGLP | | TSGSFTLDDD | | VFAETEEPSS | | PTGVLVNSNL | | PIASISDYRL |
LCDINKYVCN | | KISLLPNDED | | SLPPLLVASG | | EKGSVPVVEE | | HPSHEQIILL |
LEGESFHPVT | | FVLNANLLVN | | VKFIFYSSDK | | YWYFSTNGLH | | GLGQAEIIIL |
LLCLPNEDTI | | PKDIFRLFIT | | IYKDALKGKY | | IENLDNITFT | | ESFLSSKDHG |
GFLFITPTFQ | | KLDDLSLPSN | | PFLCGILIQK | | LEIPWAKVFP | | MRLMLRLGAE |
YKAYPAPLTS | | IRGRKPLFGE | | IGHTIMNLLV | | DLRNYQYTLH | | NIDQLLIHME |
MGKSCIKIPR | | KKYSDVMKVL | | NSSNEHVISI | | GASFSTEADS | | HLVCIQNDGI |
YETQANSATG | | HPRKVTGASF | | VVFNGALKTS | | SGFLAKSSIV | | EDGLMVQITP |
ETMNGLRLAL | | REQKDFKITC | | GKVDAVDLRE | | YVDICWVDAE | | EKGNKGVISS |
VDGISLQGFP | | SEKIKLEADF | | ETDEKIVKCT | | EVFYFLKDQD | | LSILSTSYQF |
AKEIAMACSA | | ALCPHLKTLK | | SNGMNKIGLR | | VSIDTDMVEF | | QAGSEGQLLP |
QHYLNDLDSA | | LIPVIHGGTS | | NSSLPLEIEL | | VFFIIEHLF |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.
Література
- Seet L.-F., Hong W. (2001). Endofin, an endosomal FYVE domain protein. J. Biol. Chem. 276: 42445—42454. PMID 11546807 DOI:10.1074/jbc.M105917200
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Seet L.-F., Liu N., Hanson B.J., Hong W. (2004). Endofin recruits TOM1 to endosomes. J. Biol. Chem. 279: 4670—4679. PMID 14613930 DOI:10.1074/jbc.M311228200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20756 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q7Z3T8 (англ.) . Архів оригіналу за 28 квітня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |