ZBED6

Ідентифікатори

Символи

ZBED6, MGR, zinc finger BED-type containing 6

Зовнішні ІД

OMIM: 613512 MGI: 3828086 HomoloGene: 130066 GeneCards: ZBED6

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • protein dimerization activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес	• GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


100381270


667118

Ensembl


ENSG00000257315


ENSMUSG00000094410

UniProt


P86452


D2EAC2

RefSeq (мРНК)


NM_001174108 NM_001395895


NM_001166552 NM_001395904

RefSeq (білок)


NP_001167579


NP_001160024 NP_001382833

Локус (UCSC)

Хр. 1: 203.8 – 203.85 Mb

Хр. 1: 133.55 – 133.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZBED6 (англ. Zinc finger BED-type containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 979 амінокислот, а молекулярна маса — 109 973^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVCTLSVPV	SSLSPGRRCN	TFSDSGILGC	VPINSNTDEE	DVVEEKMVAE
GVNKEAKQPA	KKKRKKGLRI	KGKRRRKKLI	LAKKFSKDLG	SGRPVADAPA
LLASNDPEQD	EESLFESNIE	KQIYLPSTRA	KTSIVWHFFH	VDPQYTWRAI
CNLCEKSVSR	GKPGSHLGTS	TLQRHLQARH	SPHWTRANKF	GVASGEEDFT
LDVSLSPSSG	SNGSFEYIPT	DPLDDNRMGK	KHDKSASDAL	RAERGRFLIK
SNIVKHALIP	GTRAKTSAVW	NFFYTDPQHI	SRAVCNICKR	SVSRGRPGSH
LGTSTLQRHL	QATHPIHWAV	ANKDSGAVAN	GLDEAETERS	DLLSDTLHGE
KSTGSQDLTA	EDLSDSDSDE	PMLEVENRSE	SPIPVAEQGT	LMRAQERETT
CCGNPVSSHI	SQAIIQMIVE	DMHPYNYFST	PAFQRFMQIV	APDYRLPSET
YFFTKAVPQL	YDCVREKIFL	TLENVQSQKI	HLTVDIWTHD	PSTDYFIVTV
HWVSLETASF	LNNGRIPDFR	KWAVLCVTGL	AKDCLITNIL	QELNDQIGLW
LSPNFLIPSF	IVSDNSSNVV	HAIKDGGFTH	VPCFLHCLNM	VIQDFFCEHK
SIENMLVAAR	KTCHHFSHSV	KARQILQEFQ	NDHQLPWKNL	KQDETGHWIS
TFYMLKWLLE	HCYSVHHSLG	RASGVVLTSL	QWTLMTYVCD	ILKPFEEATQ
KVSVKTAGLN	QVLPLIHHLL	LSLQKLREDF	QVRGITQALN	LVDSLSLKLE
TDTLLSAMLK	SKPCILATLL	DPCFKNSLED	FFPQGADLET	YKQFLAEEVC
NYMESSPEIC	QIPTSEASCP	SVTVGADSFT	SSLKEGTSSS	GSVDSSAVDN
VALGSKSFMF	PSAVAVVDEY	FKEKYSEFSG	GDDPLIYWQR	KISIWPALTQ
VAIQYLSCPM	CSWQSECIFT	KNSHFHPKQI	MSLDFDNIEQ	LMFLKMNLKN
VNYDYSTLVL	SWDPEQNEVV	QSSEKEILP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:33273 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P86452 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 28 серпня 2017.