WIPI1 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | WIPI1, ATG18, ATG18A, WIPI49, WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 609224 MGI: 1261864 HomoloGene: 117983 GeneCards: WIPI1 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • phosphatidylinositol-3-phosphate binding • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • androgen receptor binding • signaling receptor binding • estrogen receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lipid binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • phagophore assembly site membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • trans-Golgi network • autophagosome membrane • endosome membrane • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • phagophore assembly site • гіалоплазма • extrinsic component of membrane |
---|
Біологічний процес | • vesicle targeting, trans-Golgi to endosome • автофагія • IRE1-mediated unfolded protein response • macroautophagy • autophagy of mitochondrion • protein lipidation • protein localization to phagophore assembly site • autophagy of nucleus • autophagosome assembly • cellular response to starvation |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 68.42 – 68.46 Mb | Хр. 11: 109.46 – 109.5 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
WIPI1 (англ. WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 48 673[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEAEAADAPP | | GGVESALSCF | | SFNQDCTSLA | | TGTKAGYKLF | | SLSSVEQLDQ |
VHGSNEIPDV | | YIVERLFSSS | | LVVVVSHTKP | | RQMNVYHFKK | | GTEICNYSYS |
SNILSIRLNR | | QRLLVCLEES | | IYIHNIKDMK | | LLKTLLDIPA | | NPTGLCALSI |
NHSNSYLAYP | | GSLTSGEIVL | | YDGNSLKTVC | | TIAAHEGTLA | | AITFNASGSK |
LASASEKGTV | | IRVFSVPDGQ | | KLYEFRRGMK | | RYVTISSLVF | | SMDSQFLCAS |
SNTETVHIFK | | LEQVTNSRPE | | EPSTWSGYMG | | KMFMAATNYL | | PTQVSDMMHQ |
DRAFATARLN | | FSGQRNICTL | | STIQKLPRLL | | VASSSGHLYM | | YNLDPQDGGE |
CVLIKTHSLL | | GSGTTEENKE | | NDLRPSLPQS | | YAATVARPSA | | SSASTVPGYS |
EDGGALRGEV | | IPEHEFATGP | | VCLDDENEFP | | PIILCRGNQK | | GKTKQS |
Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jeffries T.R., Dove S.K., Michell R.H., Parker P.J. (2004). PtdIns-specific MPR pathway association of a novel WD40 repeat protein, WIPI49. Mol. Biol. Cell. 15: 2652—2663. PMID 15020712 DOI:10.1091/mbc.E03-10-0732
- Proikas-Cezanne T., Ruckerbauer S., Stierhof Y.D., Berg C., Nordheim A. (2007). Human WIPI-1 puncta-formation: a novel assay to assess mammalian autophagy. FEBS Lett. 581: 3396—3404. PMID 17618624 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.040
- Itakura E., Mizushima N. (2010). Characterization of autophagosome formation site by a hierarchical analysis of mammalian Atg proteins. Autophagy. 6: 764—776. PMID 20639694 DOI:10.4161/auto.6.6.12709
- Ho H., Kapadia R., Al-Tahan S., Ahmad S., Ganesan A.K. (2011). WIPI1 coordinates melanogenic gene transcription and melanosome formation via TORC1 inhibition. J. Biol. Chem. 286: 12509—12523. PMID 21317285 DOI:10.1074/jbc.M110.200543
- Proikas-Cezanne T., Robenek H. (2011). Freeze-fracture replica immunolabelling reveals human WIPI-1 and WIPI-2 as membrane proteins of autophagosomes. J. Cell. Mol. Med. 15: 2007—2010. PMID 21564513 DOI:10.1111/j.1582-4934.2011.01339.x
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25471 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q5MNZ9 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |