VPS25 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2ZME, 3CUQ, 3HTU | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VPS25, DERP9, EAP20, FAP20, vacuolar protein sorting 25 homolog |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 610907 MGI: 106354 HomoloGene: 6303 GeneCards: VPS25 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • protein N-terminus binding • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • гіалоплазма • ендосома • мембрана • нуклеоплазма • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро • ESCRT II complex |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multivesicular body assembly • transcription, DNA-templated • endosomal transport • protein transport • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity • GO:0015915 транспорт • multivesicular body sorting pathway |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | | NM_001284411 NM_001284412 NM_001284414 NM_026776 |
|
---|
RefSeq (білок) | | | NP_001271340 NP_001271341 NP_001271343 NP_081052 |
|
---|
Локус (UCSC) | Хр. 17: 42.77 – 42.78 Mb | Хр. 11: 101.14 – 101.15 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VPS25 (англ. Vacuolar protein sorting 25 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 176 амінокислот, а молекулярна маса — 20 748[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAMSFEWPWQ | | YRFPPFFTLQ | | PNVDTRQKQL | | AAWCSLVLSF | | CRLHKQSSMT |
VMEAQESPLF | | NNVKLQRKLP | | VESIQIVLEE | | LRKKGNLEWL | | DKSKSSFLIM |
WRRPEEWGKL | | IYQWVSRSGQ | | NNSVFTLYEL | | TNGEDTEDEE | | FHGLDEATLL |
RALQALQQEH | | KAEIITVSDG | | RGVKFF |
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
- Slater R., Bishop N.E. (2006). Genetic structure and evolution of the Vps25 family, a yeast ESCRT-II component. BMC Evol. Biol. 6: 59—59. PMID 16889659 DOI:10.1186/1471-2148-6-59
- Pincetic A., Medina G., Carter C., Leis J. (2008). Avian sarcoma virus and human immunodeficiency virus, type 1 use different subsets of ESCRT proteins to facilitate the budding process. J. Biol. Chem. 283: 29822—29830. PMID 18723511 DOI:10.1074/jbc.M804157200
- Im Y.J., Hurley J.H. (2008). Integrated structural model and membrane targeting mechanism of the human ESCRT-II complex. Dev. Cell. 14: 902—913. PMID 18539118 DOI:10.1016/j.devcel.2008.04.004
- Im Y.J., Wollert T., Boura E., Hurley J.H. (2009). Structure and function of the ESCRT-II-III interface in multivesicular body biogenesis. Dev. Cell. 17: 234—243. PMID 19686684 DOI:10.1016/j.devcel.2009.07.008
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28122 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9BRG1 (англ.) . Архів оригіналу за 23 грудня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |