VAPB |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 2MDK, 3IKK | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | VAPB, ALS8, VAMP-B, VAP-B, VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein B and C, VAMP associated protein B and C |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605704 MGI: 1928744 HomoloGene: 36163 GeneCards: VAPB |
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
amyotrophic lateral sclerosis type 8[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • protein homodimerization activity • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • protein heterodimerization activity • enzyme binding • cadherin binding • FFAT motif binding |
---|
Клітинна компонента | • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum exit site • Golgi membrane • цитоплазма |
---|
Біологічний процес | • COPII-coated vesicle budding • cellular calcium ion homeostasis • sphingolipid biosynthetic process • endoplasmic reticulum organization • positive regulation by host of viral genome replication • Відповідь на незгорнуті білки • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • response to unfolded protein • suppression of viral release by host • negative regulation by host of viral genome replication • positive regulation of viral genome replication • negative regulation by virus of viral protein levels in host cell • GO:0022415 viral process • modulation by host of viral RNA genome replication • IRE1-mediated unfolded protein response |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 20: 58.39 – 58.45 Mb | Хр. 2: 173.58 – 173.63 Mb |
---|
PubMed search | [2] | [3] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
VAPB (англ. VAMP associated protein B and C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 27 228[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MAKVEQVLSL | | EPQHELKFRG | | PFTDVVTTNL | | KLGNPTDRNV | | CFKVKTTAPR |
RYCVRPNSGI | | IDAGASINVS | | VMLQPFDYDP | | NEKSKHKFMV | | QSMFAPTDTS |
DMEAVWKEAK | | PEDLMDSKLR | | CVFELPAEND | | KPHDVEINKI | | ISTTASKTET |
PIVSKSLSSS | | LDDTEVKKVM | | EECKRLQGEV | | QRLREENKQF | | KEEDGLRMRK |
TVQSNSPISA | | LAPTGKEEGL | | STRLLALVVL | | FFIVGVIIGK | | IAL |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.
Література
- Nishimura Y., Hayashi M., Inada H., Tanaka T. (1999). Molecular cloning and characterization of mammalian homologues of vesicle-associated membrane protein-associated (VAMP-associated) proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 254: 21—26. PMID 9920726 DOI:10.1006/bbrc.1998.9876
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Kanekura K., Nishimoto I., Aiso S., Matsuoka M. (2006). Characterization of amyotrophic lateral sclerosis-linked P56S mutation of vesicle-associated membrane protein-associated protein B (VAPB/ALS8). J. Biol. Chem. 281: 30223—30233. PMID 16891305 DOI:10.1074/jbc.M605049200
- Saita S., Shirane M., Natume T., Iemura S., Nakayama K.I. (2009). Promotion of neurite extension by protrudin requires its interaction with vesicle-associated membrane protein-associated protein. J. Biol. Chem. 284: 13766—13777. PMID 19289470 DOI:10.1074/jbc.M807938200
- Matsuzaki F., Shirane M., Matsumoto M., Nakayama K.I. (2011). Protrudin serves as an adaptor molecule that connects KIF5 and its cargoes in vesicular transport during process formation. Mol. Biol. Cell. 22: 4602—4620. PMID 21976701 DOI:10.1091/mbc.E11-01-0068
- Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з VAPB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12649 (англ.) . Архів оригіналу за 21 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, O95292 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |