UTP4 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | UTP4, CIRHIN, NAIC, TEX292, CIRH1A, small subunit processome component, UTP4 small subunit processome component |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 607456 MGI: 1096573 HomoloGene: 40775 GeneCards: UTP4 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding |
---|
Клітинна компонента | • fibrillar center • ядерце • клітинне ядро • t-UTP complex • хромосома • нуклеоплазма • 90S preribosome • small-subunit processome |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • maturation of SSU-rRNA • transcription, DNA-templated • rRNA processing • ribosome biogenesis • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | ENSG00000262788 ENSG00000141076 |
| |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 16: 69.13 – 69.23 Mb | Хр. 8: 107.62 – 107.65 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
UTP4 (англ. UTP4, small subunit processome component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 76 890[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MGEFKVHRVR | | FFNYVPSGIR | | CVAYNNQSNR | | LAVSRTDGTV | | EIYNLSANYF |
QEKFFPGHES | | RATEALCWAE | | GQRLFSAGLN | | GEIMEYDLQA | | LNIKYAMDAF |
GGPIWSMAAS | | PSGSQLLVGC | | EDGSVKLFQI | | TPDKIQFERN | | FDRQKSRILS |
LSWHPSGTHI | | AAGSIDYISV | | FDVKSGSAVH | | KMIVDRQYMG | | VSKRKCIVWG |
VAFLSDGTII | | SVDSAGKVQF | | WDSATGTLVK | | SHLIANADVQ | | SIAVADQEDS |
FVVGTAEGTV | | FHFQLVPVTS | | NSSEKQWVRT | | KPFQHHTHDV | | RTVAHSPTAL |
ISGGTDTHLV | | FRPLMEKVEV | | KNYDAALRKI | | TFPHRCLISC | | SKKRQLLLFQ |
FAHHLELWRL | | GSTVATGKNG | | DTLPLSKNAD | | HLLHLKTKGP | | ENIICSCISP |
CGSWIAYSTV | | SRFFLYRLNY | | EHDNISLKRV | | SKMPAFLRSA | | LQILFSEDST |
KLFVASNQGA | | LHIVQLSGGS | | FKHLHAFQPQ | | SGTVEAMCLL | | AVSPDGNWLA |
ASGTSAGVHV | | YNVKQLKLHC | | TVPAYNFPVT | | AMAIAPNTNN | | LVIAHSDQQV |
FEYSIPDKQY | | TDWSRTVQKQ | | GFHHLWLQRD | | TPITHISFHP | | KRPMHILLHD |
AYMFCIIDKS | | LPLPNDKTLL | | YNPFPPTNES | | DVIRRRTAHA | | FKISKIYKPL |
LFMDLLDERT | | LVAVERPLDD | | IIAQLPPPIK | | KKKFGT |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, процесинг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.
Література
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins. DNA Res. 8: 319—327. PMID 11853319 DOI:10.1093/dnares/8.6.319
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2005). Nucleolar localization of cirhin, the protein mutated in North American Indian childhood cirrhosis. Exp. Cell Res. 311: 218—228. PMID 16225863 DOI:10.1016/j.yexcr.2005.08.012
- Prieto J.L., McStay B. (2007). Recruitment of factors linking transcription and processing of pre-rRNA to NOR chromatin is UBF-dependent and occurs independent of transcription in human cells. Genes Dev. 21: 2041—2054. PMID 17699751 DOI:10.1101/gad.436707
- Yu B., Mitchell G.A., Richter A. (2009). Cirhin up-regulates a canonical NF-kappaB element through strong interaction with Cirip/HIVEP1. Exp. Cell Res. 315: 3086—3098. PMID 19732766 DOI:10.1016/j.yexcr.2009.08.017
- Freed E.F., Prieto J.L., McCann K.L., McStay B., Baserga S.J. (2012). NOL11, implicated in the pathogenesis of North American Indian childhood cirrhosis, is required for pre-rRNA transcription and processing. PLoS Genet. 8: E1002892—E1002892. PMID 22916032 DOI:10.1371/journal.pgen.1002892
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1983 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q969X6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |