UROD

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1JPH, 1JPI, 1JPK, 1R3Q, 1R3R, 1R3S, 1R3T, 1R3V, 1R3W, 1R3Y, 1URO, 2Q6Z, 2Q71, 3GVQ, 3GVR, 3GVV, 3GVW, 3GW0, 3GW3

Ідентифікатори

Символи

UROD, PCT, UPD, uroporphyrinogen decarboxylase

Зовнішні ІД

OMIM: 613521 MGI: 98916 HomoloGene: 320 GeneCards: UROD

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • lyase activity • uroporphyrinogen decarboxylase activity • carboxy-lyase activity
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• protoporphyrinogen IX biosynthetic process • porphyrin-containing compound biosynthetic process • heme biosynthetic process • heme metabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7389


22275

Ensembl


ENSG00000126088


ENSMUSG00000028684

UniProt


P06132


P70697

RefSeq (мРНК)


NM_000374


NM_009478

RefSeq (білок)


NP_000365


NP_033504

Локус (UCSC)

Хр. 1: 45.01 – 45.02 Mb

Хр. 4: 116.85 – 116.85 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

UROD (англ. Uroporphyrinogen decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 367 амінокислот, а молекулярна маса — 40 787^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEANGLGPQG	FPELKNDTFL	RAAWGEETDY	TPVWCMRQAG	RYLPEFRETR
AAQDFFSTCR	SPEACCELTL	QPLRRFPLDA	AIIFSDILVV	PQALGMEVTM
VPGKGPSFPE	PLREEQDLER	LRDPEVVASE	LGYVFQAITL	TRQRLAGRVP
LIGFAGAPWT	LMTYMVEGGG	SSTMAQAKRW	LYQRPQASHQ	LLRILTDALV
PYLVGQVVAG	AQALQLFESH	AGHLGPQLFN	KFALPYIRDV	AKQVKARLRE
AGLAPVPMII	FAKDGHFALE	ELAQAGYEVV	GLDWTVAPKK	ARECVGKTVT
LQGNLDPCAL	YASEEEIGQL	VKQMLDDFGP	HRYIANLGHG	LYPDMDPEHV
GAFVDAVHKH	SRLLRQN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. (1997). Characterization and crystallization of human uroporphyrinogen decarboxylase. Protein Sci. 6: 1343—1346. PMID 9194196 DOI:10.1002/pro.5560060624
Whitby F.G., Phillips J.D., Kushner J.P., Hill C.P. (1998). Crystal structure of human uroporphyrinogen decarboxylase. EMBO J. 17: 2463—2471. PMID 9564029 DOI:10.1093/emboj/17.9.2463
Phillips J.D., Whitby F.G., Kushner J.P., Hill C.P. (2003). Structural basis for tetrapyrrole coordination by uroporphyrinogen decarboxylase. EMBO J. 22: 6225—6233. PMID 14633982 DOI:10.1093/emboj/cdg606
de Verneuil H., Grandchamp B., Beaumont C., Picat C., Nordmann Y. (1986). Uroporphyrinogen decarboxylase structural mutant (Gly-281-->Glu) in a case of porphyria. Science. 234: 732—734. PMID 3775362 DOI:10.1126/science.3775362
McManus J.F., Begley C.G., Sassa S., Ratnaike S. (1999). Three new mutations in the uroporphyrinogen decarboxylase gene in familial porphyria cutanea tarda. Hum. Mutat. 13: 412—412. PMID 10338097 DOI:10.1002/(SICI)1098-1004(1999)13:5<412::AID-HUMU11>3.3.CO;2-K

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12591 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, P06132 (англ.) . Архів оригіналу за 25 листопада 2016. Процитовано 25 серпня 2017.